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饮食干预对肠道微生物基因丰富度的影响

自然体积500，页面585 - 588 (2013）引用本文

一个应改正的错误本文于2013年10月23日发表

摘要

复杂的基因-环境相互作用被认为是肥胖发展的重要因素1。肠道菌群的组成可以决定从食物中获取能量的功效2，3.，4饮食组成的变化与肠道微生物群组成的变化有关5，6。通过宏基因组方法的发展，探索微生物群组成的能力得到了显著提高7，8美国已经允许制作第一个人类肠道微生物基因目录9并根据他们的肠道基因组图谱将个体分为不同的肠道类型10，但分析主要是在非干预环境下进行的。为了研究食物摄入、肠道微生物群与代谢和炎症表型之间的时间关系，我们对38名肥胖个体和11名超重个体进行了饮食诱导的减肥和体重稳定干预。在这里，我们报告了微生物基因丰富度降低(40%)的个体表现出更明显的代谢障碍和低度炎症，这在随附的论文中也有观察到11。饮食干预改善了低基因丰富度和临床表型，但对于基因丰富度较低的个体的炎症变量似乎效率较低。因此，低基因丰富度可能具有预测干预效果的潜力。

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图1:LGC的肠道微生物组成(n= 18)及HGC (n= 27)受试者。
图2:LGC和HGC受试者在生物临床变量上的差异。
图3:干预期间LGC组和HGC组基因丰富度。

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下载参考

致谢

我们感谢O. Pedersen (Univ. Copenhagen)对本文的有益评论，感谢MetaHIT联盟在发表前提供丹麦受试者的基因图谱，用于测试ROC模型，并在SOLiD平台上对DNA样本进行测序，以便与随附稿件中使用的Illumina平台进行比较。我们感谢C. Baudoin, P. Ancel和V. Pelloux对临床调查研究的贡献;S. Fellahi和j . p .。用于分析炎症标记物的混蛋;D. Bonnefont-Rousselot和R. Bittar帮助分析血浆脂质谱。这项工作得到了法国国家研究院(ANR MICRO-Obes, ANR, Nutra2sens，ANR-10-IAHU-05)， Metagenopolis资助ANR-11-DPBS-0001, KOT-Ceprodi (Florence Massiera)， Danone Research (Damien Paineau)以及Fondacoeur协会和Louis-Bonduelle。其他资金来自欧盟委员会FP7 HEALTH-F4-2007-201052赠款和METACARDIS。

作者信息

作者指出

  1. 歌迪亚、肯尼迪、孔令椿、普里夫提和庞斯:这些作者对本书贡献相同。

  2. 法国能源原子研究所，基因显微镜，每91000枚，法国。

作者及单位

  1. 法国国立健康与健康研究中心，U872, Nutriomique， Équipe 7，法国科德利埃尔研究中心，巴黎75006;

    奥尔·考迪亚、孔令春、埃迪·普里夫蒂、萨尔瓦·里兹卡拉、让-丹尼尔·扎克和卡琳·克莱蒙

  2. 法国巴黎75006，皮埃尔和玛丽居里大学，巴黎第六营养学院，医学院街15号;

    奥尔·考迪亚、孔令春、埃迪·普里夫蒂、萨尔瓦·里兹卡拉、让-丹尼尔·扎克和卡琳·克莱蒙

  3. 国家农学研究所，Metagenopolis, Jouy en Josas78350，法国;

    Sean P. Kennedy、Edi Prifti、Nicolas Pons、Emmanuelle Le Chatelier、Mathieu Almeida、Benoit Quinquis、Florence Levenez、Nathalie Galleron、Jean-Michel Batto、Joel dor和Stanislav Dusko Ehrlich

  4. 心脏代谢和营养研究所，援助Publique-Hôpitaux巴黎，crnh -法兰西岛，Pitié-Salpêtrière，医院大道，巴黎75013，法国，

    孔令春，索菲·古吉斯，萨尔瓦·里兹卡拉和卡琳·克莱蒙

  5. 法国国家农学研究所，UMR 1319 Micalis, Jouy en Josas 78350，法国;

    Florence Levenez, Jean-Michel Batto, Pierre Renault和Joel dor

  6. 法国北部，unmisco, unmisco, Bondy F-93143，法国，

    Jean-Daniel Zucker

  7. 国家农学研究所，1319 Micalis UMR, Jouy en Josas 78350，法国;

    herv blotti、Marion Leclerc、Catherine Juste、Tomas de Wouters、Patricia Lepage、Charlene Fouqueray、Emmanuelle Maguin、Maarten van de Guchte、Alexandre Jamet、Fouad Boumezbeur和ssamverine Layec

  8. 国家农学研究所，Metagenopolis, Jouy en Josas 78350，法国;

    Herve Blottiere

  9. 心脏代谢和营养研究所，援助Publique-Hôpitaux de Paris, CRNH-Ile de France, Pitié-Salpêtrière，巴黎75013，法国，

    Arnaud Basdevant, corneliu Henegar, Cindy Godard, Marine Fondacci, Alili Rohia和Froogh Hajduch

  10. 法国国家农学与信息研究所，法国茹埃昂若萨78350;

    jean - pierre Gauchi

  11. 法国国家农学研究所， 与 与 - - - - - - - - - - - - - - -信息与 - - - - - - - - - - - -

    jean - francois Gibrat, Valentin Loux和Wilfrid carr

作者
  1. Aurelie歌迪亚
    查看作者出版物

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  2. 肖恩·p·肯尼迪
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  3. 凌春空
    查看作者出版物

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  4. Edi Prifti
    查看作者出版物

    您也可以在中搜索该作者PubMed谷歌学者

  5. 尼古拉斯·庞斯
    查看作者出版物

    您也可以在中搜索该作者PubMed谷歌学者

  6. 艾曼纽·勒夏特列
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  7. 马修阿尔梅达
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  8. Benoit Quinquis
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  9. 佛罗伦萨Levenez
    查看作者出版物

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  10. 娜塔莉Galleron
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  11. 苏菲Gougis
    查看作者出版物

    您也可以在中搜索该作者PubMed谷歌学者

  12. 瓦萨Rizkalla
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    您也可以在中搜索该作者PubMed谷歌学者

  13. jean - michel Batto
    查看作者出版物

    您也可以在中搜索该作者PubMed谷歌学者

  14. 皮埃尔·雷诺
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  15. 乔尔·多尔
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  16. Jean-Daniel Zucker
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  17. Karine克莱门特
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  18. 斯坦尼斯拉夫·杜斯科·埃利希
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财团

ANR微生物联盟

ANR MicroObes联盟成员

  • Herve Blottiere
  • 玛丽昂·勒克莱尔
  • 凯瑟琳·贾斯特
  • 托马斯·德·沃特
  • ——Patricia Lepage
  • Charlene Fouqueray
  • 阿尔诺·巴斯德万特
  • corneliu Henegar
  • ——辛迪·戈达尔
  • Marine Fondacci
  • Alili Rohia
  • Froogh Hajduch
  • Jean Weissenbach
  • Eric Pelletier
  • Denis Le Paslier
  • 让-皮埃尔·高齐
  • 让-弗朗索瓦·直布罗陀
  • Valentin Loux
  • 威尔弗里德·卡罗尔
  • 艾曼纽·马昆
  • 马丁·范·德·古赫特
  • 亚历山大·詹姆斯
  • Fouad Boumezbeur
  • & ssamverine Layec

贡献

s.d.e.、J.D.和K.C.设计了这项研究;s.d.e.、j.d.、K.C.和pr负责这项研究;K.C.和S.R.设计了临床研究;S.R.和L.C.K.进行临床研究和临床数据管理;a.c.， S.R.和L.C.K.进行了临床和饮食数据分析;S.G.为患者提供饮食咨询，并对饮食数据进行分析;fl制备DNA进行测序;S.K.负责DNA测序，由B.Q.和N.G.负责;N.P.和j.m b建立了序列分析管道;交流,J.-D.Z密纹唱片,N.P, E.L.C,硕士J.-M.B。”栏目和S.D.E.微生物进行数据分析; A.C., K.C., L.C.K. and S.D.E. wrote the manuscript.

相应的作者

对应到Karine克莱门特或斯坦尼斯拉夫·杜斯科·埃利希。

道德声明

相互竞争的利益

作者声明没有与之竞争的经济利益。

额外的信息

作者和所属单位的名单出现在论文的末尾。

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补充信息

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关于本文

引用本文

歌迪亚，A，肯尼迪，S，孔，L。et al。饮食干预对肠道微生物基因丰富度的影响。自然500， 585-588(2013)。https://doi.org/10.1038/nature12480

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