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随着测序速度的增加,更大的吞吐量要求从读准仪。全文分指标常被用来使对齐非常快和节约内存,但是这种方法不适合发现更长,缺口对齐。领结2结合了全文分指标的优势和硬件加速的灵活性和速度动态规划算法来实现高速、敏感性和准确性。
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确认
这项工作是支持部分由美国国家卫生研究院资助R01-HG006102 R01-GM083873 S.L.S.和Amazon Web服务在教育研究授予文学士在2011年7月。
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文学士写软件并进行了实验。文学士和S.L.S.写的手稿。
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作者声明没有竞争的经济利益。
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Langmead B。,Salzberg, S. Fast gapped-read alignment with Bowtie 2.Nat方法9,357 - 359 (2012)。https://doi.org/10.1038/nmeth.1923
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DOI:https://doi.org/10.1038/nmeth.1923
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