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数据可用性
本研究期间未生成或分析任何数据集。
代码的可用性
nf-core框架和所有nf-core管道的源代码可以在https://github.com/nf-core/.在适用的情况下,Zenodo doi可以在各自的管道存储库中使用。
参考文献
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确认
作者还想感谢以下人士的贡献:F. Bonath, O. Contreras-López, S. Haglund, R. Hammarén, A. Jemt, R. A. Olsen, S. Paneerselvam, M. Proks, J. Wan, C. Wang, J. Westholm和D. Yuen(瑞典斯德哥尔摩生命科学实验室);施忠忠(A*STAR基因研究所);M. Hoeppner (für Klinische分子生物学研究所,基尔,德国);V. Malladi(德克萨斯大学西南医学中心,达拉斯);邓肯(安大略癌症研究所);H. Gourlé(瑞典农业科学大学,乌普萨拉);G. Gabernet, S. Heumos, T. Koch, C. Mohr和D. Straub(定量生物学中心,Tübingen,德国);G.凯利(伦敦弗朗西斯克里克研究所);赵问(中山大学癌症中心,广州,中国);E. Floden(西班牙巴塞罗那基因组调控比较生物信息学实验室中心)。 A.P., S.F. and S.N. acknowledge funding from the Deutsche Forschungsgemeinschaft (German Research Foundation, DFG; core facilities initiative, KO-2313/6-1 and KO- 2313-2, Institutional Strategy of the University of Tübingen, ZUK 63). A.P. and S.N. acknowledge funding by the Sonderforschungsbereich SFB/TR 209 “Liver cancer” of the DFG. S.N. acknowledges funding from the DFG Project ID 398967434 – TRR 261 and the DFG im Rahmen der Exzellenzstrategie des Bundes und der Länder EXC 2180 – 390900677 and EXC 2124 – 390838134. P.D. acknowledges the support of the Spanish Ministry of Economy, Industry and Competitiveness (MEIC) to the EMBL partnership, the Centro de Excelencia Severo Ochoa and the CERCA Programme / Generalitat de Catalunya. P.D.’s work is supported by the European Union’s Horizon 2020 research and innovation program under grant agreement 815668 (BovReg), the Spanish Ministry of Economy, Industry and Competitiveness (BFU2017-88264-P) and the Secretaria d’Universitats i Recerca del Departament d’Economia i Coneixement de la Generalitat de Catalunya (2017 SGR 447).
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Ewels, p.a., Peltzer, A, Fillinger, S。et al。社区策划的生物信息学管道的nf-core框架。生物科技Nat》38, 276-278(2020)。https://doi.org/10.1038/s41587-020-0439-x
发表:
发行日期:
DOI:https://doi.org/10.1038/s41587-020-0439-x
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