使用宽范围(通用)探针和引物组实时PCR检测细菌负荷
微生物学(阅读)．
2002年1月．
摘要
报道了一套通用引物和探针的设计和评价，该引物和探针用于实时PCR扩增域菌16S rDNA，以估计细菌总载量。通用检测系统的广泛特异性通过测试从34种细菌中分离出来的DNA得到证实，这些细菌包括Bergey的确定细菌学手册中概述的大多数细菌群。然而，作为标准的染色体DNA的性质是至关重要的。由于16S rDNA拷贝数的变化以及细菌生成时间对该数量的影响，代表在给定栖息地中最有可能占主导地位的细菌的DNA标准对于更准确地确定细菌总负荷是重要的，因为快速生长可能导致多个复制分叉，因此，实际上，染色体部分的多个拷贝。通过计数体外混合的人工样本和临床龋牙本质样本中的细菌数量，证实了应用这些警告来估计细菌负荷的有效性。考虑到这些参数，通用探针和引物在龋牙本质中估计的厌氧菌数量比培养方法检测到的细菌总数大40倍，证明了实时PCR在这种环境分析中的实用价值。
类似的文章
-
通过培养和实时PCR定量微生物学研究人类龋牙本质:厌氧菌与慢性牙髓炎组织病理学改变的关系。临床微生物学杂志，2002 5;40(5):1698-704。doi: 10.1128 / jcm.40.5.1698 - 1704.2002。 临床微生物学杂志，2002。 PMID:11980945 免费的PMC文章。
-
南极洲麦克默多干谷弗里克塞尔湖样品中培养和未培养原核生物的16S rDNA多样性。极端微生物。2001 2月;5(1):23-33。doi: 10.1007 / s007920000169。 极端微生物》2001。 PMID:11302499
-
龋齿牙本质为一系列新型普雷沃氏菌提供了栖息地。临床微生物学杂志2004,11;42(11):5238-44。doi: 10.1128 / jcm.42.11.5238 - 5244.2004。 临床微生物学杂志。2004。 PMID:15528720 免费的PMC文章。
-
通过实时扩增和16S rRNA基因测序快速鉴定细菌。《微生物学杂志》，2006年7月;66(1):156-64。doi: 10.1016 / j.mimet.2005.11.005。Epub 2005年12月20日。 微生物学方法，2006。 PMID:16371239
-
宽范围16s rDNA PCR在临床微生物学中的应用。中华微生物学杂志。2009 3;76(3):217-25。doi: 10.1016 / j.mimet.2008.11.002。Epub 2008 11月21日。 微生物学方法，2009。 PMID:19046999 审查。
引用的
-
肠道源性细菌鞭毛蛋白诱导β细胞炎症和功能障碍。肠道微生物。2022 1 - 12月;14(1):2111951。doi: 10.1080 / 19490976.2022.2111951。 肠道微生物，2022年。 PMID:35984746 免费的PMC文章。
-
粪便样本低温保存在数量和组成上改变了微生物活力。中国微生物学报。2022年8月16日;204(9):557。doi: 10.1007 / s00203 - 022 - 03169 - 1。 《拱门微生物》，2022年。 PMID:35972563
-
糖化血红蛋白、维生素C和微生物组在糖尿病足溃疡和完整皮肤中的关系:一项横断面研究。卫生科学代表2022年8月3日;5(5):e718。doi: 10.1002 / hsr2.718。收藏2022年9月 健康科学代表2022。 PMID:35949674 免费的PMC文章。
-
评价污水消毒后细菌群落谱变化和细菌病原体负荷减少的策略。前沿微生物。2022年7月11日;13:919207。doi: 10.3389 / fmicb.2022.919207。eCollection 2022。 前端微生物，2022。 PMID:35898906 免费的PMC文章。
-
褪黑素通过重塑大豆转录组和根际微生物群落结构减弱尿素诱导的产量提高。前沿微生物。2022年7月7日;13:903467。doi: 10.3389 / fmicb.2022.903467。eCollection 2022。 前端微生物，2022。 PMID:35875554 免费的PMC文章。
网格计算
物质
LinkOut -更多的资源
全文来源
其他文献来源
