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审查
2010年7月,11 (7):459 - 63。
doi: 10.1038 / nrg2813。

人口分层在全基因组关联研究的新方法

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免费的PMC的文章
审查

人口分层在全基因组关联研究的新方法

碱性L价格et al。 Nat牧师麝猫 2010年7月
免费的PMC的文章

文摘

全基因组协会(GWA)研究是一种有效的方法来识别基因变异与疾病风险相关。GWA研究可以通过人口分层抱愧蒙羞——系统的祖先之间的差异情况和控制——曾被推断遗传祖先的方法解决。这些方法表现良好在数据集人口结构是唯一一种结构存在但在数据集是不够的,也包含家庭结构或神秘的亲缘。在这里,我们审查的最新进展的方法正确分层而占这些额外的复杂性。

数据

图1
图1所示。p p情节的可视化分层或其他混杂因素
我们显示模拟p p阴谋下的全基因组扫描没有因果标记三个场景。(一)没有分层:假定值符合预期的分布。(b)分层没有异常分化标记:假定值表现出适度的全基因组的通货膨胀。(c)分层异常分化标记:假定值表现出适度的全基因组的通货膨胀,再加上严重的通货膨胀在少量的标记。
图1
图1所示。p p情节的可视化分层或其他混杂因素
我们显示模拟p p阴谋下的全基因组扫描没有因果标记三个场景。(一)没有分层:假定值符合预期的分布。(b)分层没有异常分化标记:假定值表现出适度的全基因组的通货膨胀。(c)分层异常分化标记:假定值表现出适度的全基因组的通货膨胀,再加上严重的通货膨胀在少量的标记。

评论

  • 应对并Eskin。
    价格,Zaitlen NA,帝国D,帕特森N。 价格,等。 Nat牧师麝猫。2013年4月,14 (4):300。doi: 10.1038 / nrg2813-c2。Epub 2013年2月26日。 Nat牧师麝猫》2013。 PMID:23438870 免费的PMC的文章。 没有可用的抽象。
  • 混合模型可以正确的对人口结构基因组区域下的选择。
    南JH Eskin E。 南JH, et al。 Nat牧师麝猫。2013年4月,14 (4):300。doi: 10.1038 / nrg2813-c1。Epub 2013年2月26日。 Nat牧师麝猫》2013。 PMID:23438871 没有可用的抽象。

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