一个回顾性研究调查流行病学、临床和病毒学特征COVID-19 2020年1月17日至2020年2月8。收集的数据进行统一的健康委员会浙江省在指定医院,所有成功注册病人诊断为有COVID-19根据世卫组织临时指导。 13我们的初步数据报告给浙江省的权威与世卫组织共享和开放。书面知情同意放弃了道德委员会的指定医院,作为新兴传染病进行了这个研究目的,是一个持续的一部分公共卫生疫情调查根据国家授权。

积极消化系统症状的定义要求病人至少有下列症状:恶心、呕吐和腹泻。胃肠道症状入院记录,从而排除其他医学治疗和外部因素的影响。腹泻便溏的传递的定义>每天3次。凳子上文化进行负面结果为所有COVID-19患者胃肠道症状。自腹泻诊断入院,患者没有最近的抗生素使用的历史。因此, 艰难梭状芽胞杆菌没有检测到凳子。COVID-19患者分为四个亚型根据疾病严重程度,基于诊断和治疗方案SARS-CoV-2中国(第六版)。温和的类型被定义为对摄影产生轻微的临床症状,没有肺炎。常见的类型是定义为呈现发烧和/或呼吸道症状+肺炎在射线照相。被诊断为严重的类型根据呼吸困难(呼吸速率(RR)≥30次/分钟),休息的手指血氧饱和度≤93%,动脉PaO₂/ FiO₂≤300毫米汞柱(1毫米汞柱= 0.133 kPa)。关键类型被定义为呼吸衰竭和休克和multiorgan失败需要机械通气和重症监护室(ICU)录取。肝损伤的定义是丙氨酸转氨酶(ALT) > 50 U / L或天冬氨酸转氨酶(AST) > 40 U / L。潜伏期接触的具体日期的计算证实COVID-19患者发病的时间。

流行病学、临床、实验室、治疗和结果数据收集病人的医疗记录,验证由独立的医生。临床结果随访到2020年2月8日,当从咽喉拭子和痰标本了。对于丢失或模糊的数据,直接与主治医生和其他卫生保健提供者进行通信。实验室确认的执行SARS-CoV-2在我们医院和浙江省疾病预防控制中心/城市级别的授权下之前报道实时rt - pcr。 5所有患者接受胸部x线摄影或CT在承认,而其他呼吸道病毒被排除在外,如甲型流感(甲型H3N2和H7N9),乙型流感、呼吸道合胞病毒、副流感病毒病毒、腺病毒、冠状和MERS-CoV。

在这项研究中,我们收集和计算流行病学数据(接触受感染区域,接触患者确诊或疑似COVID-19,集群情况和平均潜伏期)和其他人体测量学,统计学,症状和体征。实验室和胸部x光片/ CT结果、并发症、治疗(包括药物、重症监护和机械通风)和临床结果也总结。

传染性非典型肺炎(AAS00003.1和AY278489.2)基因序列和Wuhan-Hu-1 (MN908947.3)从NCBI获得病毒基因组数据库( https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)。从浙江病人ZJ01分离和命名( 在线补充材料-ZJ01序列)。SRAMP ( http://www.cuilab.cn/sramp)是用于分析基因序列和预测转录后甲基化(N6-methyladenosine)修改网站。结果显示,相关预测⁶一个网站可以分为四个级别:非常高,高、中、低的信心。Multalin ( http://multalin.toulouse.inra.fr/multalin/multalin.html)是用来比较这些序列之间的差异。瑞士模式的在线服务器( https://swissmodel.expasy.org/)被用来重建三维结构根据基因或蛋白质的氨基酸序列。Poisson-Boltzmann方程可以用来计算年代的静电行为蛋白质在水溶液通过真空静电学PyMol的函数。蛋白质的能力模型的进一步分析显示,不同的蛋白质表面的静电配电三个病毒株。

连续变量,意味着(SD)和中值(差)是用于正常和异常分布数据,其次是未配对t检验和非参数测试在适当的时候。分类变量表示为数字使用χ(%)和比较²测试。单变量逻辑回归分析用来确定严重/关键类型的风险因素的病人。所有重要变量实现从单变量分析包含在多变量逻辑回归模型和提出的方法确定严重/关键类型的独立预测因素。不需要进行调整的多个测试。一个双边α< 0.05被认为是显著和SPSS (V.26.0)是用于所有分析。

本研究证实COVID-19招收了651名患者从17浙江省2020年1月至2020年2月8日,其中74名(11.4%)患者出现至少一个胃肠道症状(恶心、呕吐和腹泻),这是高于先前的武汉数据( 表1)。74年细节,COVID-19患者胃肠道症状,53名患者中只有腹泻的症状,只有11个病人的症状呕吐和10位病人只有恶心的症状。此外,只有三个患者的胃肠道症状腹泻、呕吐和恶心,而四个病人都恶心和呕吐的症状。腹泻是最常见的胃肠道症状在这项研究中,占8.14%的总COVID-19招收了651名患者,这是高于3.8%的速度报道。 1453 COVID-19患者腹泻、中值时间周期是4天(IQR: 3 - 6天),最短1天,最长时间的9天。大多数腹泻是自限性。

消化系统症状患者的平均年龄为46.14±14.19岁,男:女比例为1:1。没有共存条件下的癌症、慢性肾脏疾病、妊娠、慢性阻塞性肺疾病或免疫抑制。武汉38例(51.35%)患者有接触史和32例(43.24%)患者有接触史COVID-19患者。有趣的是,慢性肝病的速率为10.81% COVID-19患者胃肠道症状,明显高于2.95%无胃肠道症状(p = 0.004)。更重要的是,严重的速率/关键类型也显著增加COVID-19患者胃肠道症状比无胃肠道症状(22.97%比8.14%,p < 0.001)。家庭聚类是另一个关键COVID-19现象。我们发现,23例(31.08%)患者胃肠道症状有家族聚集,在患者显著高于没有胃肠道症状(20.45%,p = 0.037)。21 COVID-19患者胃肠道症状和195年没有人明确的曝光时间,计算平均潜伏期为4天(IQR 3 - 7天)和5天(差3 - 8天),分别。

消化系统症状的患者的临床特点是所示 表2。发烧、咳嗽和痰生产是最常见的症状。上述症状,29(39.19%),23例(31.08%),8(10.81%)和16例(21.62%)患者与胃肠道症状COVID-19 > 38.5°C发热、疲乏、气短和头痛,分别显著高于各自的同行没有胃肠道症状。74 COVID-19患者胃肠道症状,63人(85.14%)有发烧,最高气温为40.3°C。此外,21例(28.38%)缺乏呼吸道症状咳嗽和痰生产只有胃肠道症状的恶心、呕吐和腹泻。此外,AST增加的速度,但不是ALT,明显高于COVID-19患者胃肠道症状比无胃肠道症状(29.35 vs 24.4, p = 0.02)。最后,尽管大多数患者影像学报告之间的相似COVID-19有无胃肠道症状,单方面的肺炎患者胃肠道症状,12.16%远低于23.22%,无胃肠道症状(p = 0.030)。关于感染相关性标记,没有显著差异在原降钙素和C反应蛋白(CRP)之间COVID-19患者有无胃肠道症状。

所示 表35(6.76%)、13(17.57%)和1例(1.35%)患者有胃肠道症状COVID-19 ARDS的并发症,肝损伤和冲击,分别在前两人明显高于同行的2.08%和8.84% COVID-19没有消化系统症状,患者(分别p = 0.034;p = 0.035)。所有74 COVID-19患者胃肠道症状治疗孤立的支持和经验用药,而66名(89.19%)患者接受抗病毒治疗,包括interferon-α喷雾剂、盐酸arbidol胶囊(每日三次,每次两片),lopinavir,例如(500毫克)每天两次,一次两片通过口服途径。此外,从发病开始抗病毒治疗的平均时间是5.56±4.09天。与武汉数据相比,我们拥有较低的糖皮质激素和抗生素的使用,分别为14.86%和41.89%。没有由于肾功能衰竭患者接受连续血液净化,和患者接受体外膜肺氧合。直到现在,只有一个病人已经死亡。5个(6.76%)患者COVID-19与胃肠道症状接受机械通气和转移到加护病房,这是一个率显著高于2.08%的患者COVID-19没有胃肠道症状(p = 0.034)。

严重的/关键COVID-19患者,22.97%出现胃肠道症状在这项研究。温和、共同COVID-19相比,最初的单变量分析流行病学、临床和实验室变量确定11显著改变风险因素严重/关键COVID-19,包括增加口服补液盐的年龄,年龄≥50年,期间疾病发生和医院访问,吐痰,任何现有的医疗条件,多个肺部感染、ALT、乳酸脱氢酶(LDH)、葡萄糖和c反应蛋白,以及减少或受感染的地区( 在线补充表1)。基于这些变量,进一步使用远期方法进行多元分析,我们发现痰生产的患者从感染地区,如武汉和LDH /葡萄糖水平增加的独立危险因素严重/关键COVID-19患者胃肠道症状( 表4)。

ZJ01 SARS-CoV-2 29 381基地的应变。结果潜在的蛋白质序列的甲基化网站非典,Wuhan-Hu-1和ZJ01表明SARS-CoV-2之间有显著差异,非典。通过使用这些冠状病毒感染宿主细胞S蛋白与宿主细胞表面受体ACE2。病毒成熟过程中,蛋白质糖基化的和S1和S2分为部分。S1是球形和主要参与识别和绑定病毒的宿主细胞。S2是跟踪,能够促进病毒进入宿主细胞的融合。三个病毒株的比较结果表明,ZJ01和Wuhan-Hu-1有一个高信任度的网站,两个中等把握网站和四个低网站。“非典”有三个高信任度网站,三个中等把握网站和五个低的网站。从高信任度的角度来看网站( 图1一个红色箭头),潜在的甲基化点SARS-CoV-2 (n = 1)和非典型肺炎(n = 3)主要是集中在S1和S2的蛋白质。两个低的网站和一个中度自信站点的位置在S2中相对固定的三个病毒株(蓝色箭头)。这些结果表明,S蛋白的两种病毒可能由于结构和功能差异⁶甲基化在转录和翻译。

另外,基因序列比对的结果( 图1 b)表明,变异S蛋白序列之间ZJ01 Wuhan-Hu-1是微妙的,而这些变化都高度集中在S2段。这些变化导致了五个氨基酸替换和两个氨基酸缺失。然而,从模拟三维蛋白质结构的角度来看,这些变化的影响对整个蛋白质结构是相对有限。SARS-CoV-2和非典型肺炎的区别是重要的,特别是在特定的识别点位置在S1段( 图1 c红色圆圈)。一方面,这种变化可能影响宿主细胞的病毒约束力。另一方面,静电ZJ01和Wuhan-Hu-1之间的变化主要集中在S2的突变区( 图1 c绿色椭圆),详细的机制需要进一步探索。