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人类早产儿源性和成人源性肠类器官暴露于不同的基因表达谱粪肠球菌:初步研究
  1. 安德里亚·C马西1
  2. 塔蒂阿娜Y Fofanova2
  3. 克里斯托弗羊羔3.4
  4. 詹妮弗·M Auchtung5
  5. 罗伯特一个布里顿2
  6. 玛丽K埃斯蒂斯6
  7. Sasirekha Ramani2
  8. 西蒙J Cockell7
  9. 乔纳森Coxhead8
  10. 尼古拉斯·D Embleton910
  11. 珍妮特E伯林顿9
  12. Joseph F彼得611
  13. 克里斯托弗·J·斯图尔特1
  1. 1转化与临床研究所纽卡斯尔大学泰恩河畔纽卡斯尔、英国
  2. 2分子病毒学与微生物学系“,贝勒医学院休斯顿德州美国
  3. 3.转化与临床研究所纽卡斯尔大学泰恩河畔纽卡斯尔、英国
  4. 4胃肠病学纽卡斯尔泰恩河畔医院NHS基金会信托泰恩河畔纽卡斯尔、英国
  5. 5内布拉斯加州食品卫生中心和食品科学与技术部内布拉斯加大学林肯内布拉斯加州美国
  6. 6分子病毒学与微生物学系“,贝勒医学院休斯顿德州美国
  7. 7生物信息学支持单位纽卡斯尔大学泰恩河畔纽卡斯尔、英国
  8. 8生物科学研究所纽卡斯尔大学泰恩河畔纽卡斯尔、英国
  9. 9纽卡斯尔新生儿服务纽卡斯尔泰恩河畔医院NHS信托泰恩河畔纽卡斯尔、英国
  10. 10人口健康科学研究所纽卡斯尔大学泰恩河畔纽卡斯尔、英国
  11. 11人类基因组测序中心贝勒医学院休斯顿德州美国
  1. 对应到Christopher J Stewart博士,纽卡斯尔大学转化和临床研究所,英国泰恩河畔纽卡斯尔;Christopher.Stewart在{}newcastle.ac.uk

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我们饶有兴趣地阅读了凯伊索格鲁的研究1比较胚胎源性和成人源性肠类器官的基因表达。一些先天免疫系统基因在两种类器官类型之间表达差异,表明暴露于环境,包括肠道菌群,在形成肠道基因表达的潜在作用。在极早产儿(<32周妊娠)中,上皮表面的微生物-宿主相互作用与各种疾病相关,包括晚发性败血症和坏死性小肠结肠炎。2因此,早产儿肠类器官可能为这一人群提供一个特定的和健壮的模型。

我们将详述Kayisoglu所进行的工作1通过比较4名早产儿(23-32周妊娠)和5名成人(30-60岁)的全转录组测序分析3.肠类器官线暴露于粪肠球菌这是一种普遍存在的肠道病原体。4根据Stewart所描述的方案,从早产儿(手术切除)和成人(活检)中产生人类肠道类器官线5所有标本均来自回肠。肠道类器官暴露于粪肠球菌采用有机-厌氧菌共培养(OACC)模型,形成单分子膜。6所有数据可在基因表达综合(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)上获得,注册号:GSE161953。

我们首先比较了早产儿和成人的转录组资料。

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脚注

  • ACM和TYF是共同第一作者。

  • 推特@ACMasi10、@DrChrisLamb @CJStewart7

  • 贡献者AM和TYF进行了数据分析,对结果进行了解释,并起草了初稿。CAL, JMA, RAB, MKE, SR和JFP协助研究设计,提供设备,方法优化,分析和解释,并对文章的重要知识内容进行批判性修改。SJC和JC进行rna测序和生物信息学,并协助分析和解释,并起草文章。NDE和JB协助研究设计、分析和解读,并对文章重要的知识内容进行批判性修改。CS提出了研究的概念,进行了实验,并协助数据分析/解释和起草手稿。所有作者都认可了最终稿。

  • 资金政务司委员会获得了维康机构战略支持基金(ISSF)和纽卡斯尔大学学术跟踪计划的资助。

  • 免责声明资助方在研究的设计和实施中没有任何作用。

  • 相互竞争的利益TYF、JMA、RAB、MKE、JFP、CJS已申报了类肠厌氧共培养系统专利。CJS获得了达能纽迪西亚的酬金。

  • 患者和公众的参与患者和/或公众未参与本研究的设计、实施、报告或传播计划。

  • 来源和同行评审不是委托;内部同行评议。