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胰腺
原始研究
干扰素调节因子1 (IRF1)控制低级别胰腺癌细胞的代谢程序
  1. Gabriele Alfarano1，
  2. 马特奥Audano2，
  3. Pierluigi Di Chiaro1，
  4. 奇亚拉Balestrieri3.，
  5. 玛尔塔米兰1，
  6. 莎拉Polletti1，
  7. Paola Spaggiari4，
  8. 亚历山德罗Zerbi5，6，
  9. Giuseppe Riccardo Diaferia1，
  10. 尼科Mitro2，
  11. Gioacchino Natoli1
  1. 1IEO实验肿瘤科，欧洲肿瘤研究所IRCCS，米兰、意大利
  2. 2药物学生物分子分析，Università degli Studi di Milano，米兰、意大利
  3. 3.组学科学中心，IRCCS圣拉斐尔科学研究所，米兰、意大利
  4. 4病理科，ircc人道研究医院，Rozzano，米兰、意大利
  5. 5胰腺外科，ircc人道研究医院，Rozzano，米兰、意大利
  6. 6Humanitas大学，皮耶夫·伊曼纽尔(米兰)、意大利
  1. 对应到Nico Mitro教授;nico.mitro在{}unimi.it；Gioacchino Natoli博士，欧洲肿瘤研究所，米兰20141，意大利;gioacchino.natoli在{}ieo.it

摘要

客观的胰腺导管腺癌(PDACs)包括低级别细胞形成假腺结构的异质混合物和高级别细胞以非腺模式组织的致密巢。我们之前报道过低级别的PDAC细胞显示高表达干扰素调节因子1 (IRF1)，这是干扰素(IFN)系统的关键转录因子，提示IFN反应的级别特异性、细胞内在激活。在这里，我们开始确定在人类PDACs中ifn调节反应的激活的分子基础和功能影响。

设计我们首先证实了PDAC的腺分化与分子亚型的相关性，以及IRF1和ifn刺激基因的表达。接下来，我们使用无偏组学方法系统地分析了低级别和高级别PDAC细胞中基础和ifn调控的反应，以及IRF1对PDAC细胞基因表达程序和代谢谱的影响。

结果IRF1在低级别PDAC细胞中的高水平表达受内胚层谱系决定转录因子的控制。irf1调控的基因表达使低级别PDAC细胞具有与抗原呈递和加工以及对IFN刺激的响应性相关的独特特性。值得注意的是，IRF1还控制了低级别PDAC细胞的特征代谢特征，抑制线粒体呼吸和脂肪酸合成，这可能在一定程度上解释了它的生长抑制活性。

结论IRF1将内胚层分化与控制抗原呈递和加工的基因的表达以及经典PDAC细胞代谢特征的规范联系起来。

  • 胰腺癌
  • 干扰素
  • 基因表达
  • 能量代谢

数据可用性声明

数据可以在一个公共的、开放访问的存储库中获得。数据集可在基因表达综合(GEO)数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)，注册编号为GSE165950。

http://dx.doi.org/10.1136/gutjnl-2021-325811

数据来自Altmetric.com

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    脚注

    • GA、MA、PDC和CB是联合第一作者。

    • NM和GN是联合资深作者。

    • NM和GN的贡献相当。

    • GA、MA、PDC和CB贡献相同。

    • 调整通知这篇文章在Online First发表后已被更正。隶属关系4,5和6已经更正。

    • 贡献者GA和MA在MM和SP的帮助下设计并进行了大部分实验。计算分析:PDC和CB。概念化:GN, NM和GRD。GN和NM在所有作者的贡献下撰写了手稿。监督:GN, NM和GRD。资金获取:GN, GRD和NM。担保人:GN。

    • 资金这项研究得到了AIRC，意大利癌症研究协会(AIRC调查员赠款20251给GN和AIRC 5x1000赠款ISM)和意大利卫生部(赠款GR-2016-02361721给GRD)的支持。这项工作还得到了意大利卫生部的“Ricerca Corrente”和IEO IRCCS的5x1000资金的部分支持。本研究中使用的PDAC样本的单细胞RNA-seq数据集由安大略省癌症研究所通过安大略省政府提供的资金提供。MM和GA由AIRC的长期研究金支持。PDC得到了意大利AIRC研究金的支持。GRD部分得到了Umberto Veronesi基金会(FUV)的资助。

    • 相互竞争的利益没有宣布。

    • 出处和同行评审不是委托;外部同行评审。

    • 补充材料此内容由作者提供。它没有经过BMJ出版集团有限公司(BMJ)的审查，也可能没有经过同行评审。讨论的任何意见或建议仅是作者的意见或建议，不被BMJ认可。BMJ不承担因对内容的任何依赖而产生的所有责任和责任。如果内容包括任何翻译材料，BMJ不保证翻译的准确性和可靠性(包括但不限于当地法规、临床指南、术语、药品名称和药物剂量)，并且对因翻译和改编或其他原因引起的任何错误和/或遗漏不负责。