队列 | 控制 | 情况下表型(icd - 10) | N情况下|控制 | 叔 变体 |
EA | P值 | 或(95%置信区间) |
当前的研究* | ALD肝硬化* | C22.0酒精肝硬化的肝细胞癌(HCC) | 1214 | 1866 | rs2242652 | 一个 | 6.40×10−9 | 0.61 (0.52 - 0.72) |
复制队列 | |||||||
Trepoet al __ | ALD F0-F4纤维化 | C22.0 HCC与酒精相关肝病(F0-F4纤维化) | 775 | 1332 | rs2242652 | 一个 | 0.179 | 0.89(0.75到1.06 |
Stop-HCV‡ | 丙肝肝硬化 | C22.0与丙肝肝硬化的肝细胞癌(HCC) | 169 | 890 | rs2242652 | 一个 | 0.047§ | 0.72 (0.53 - 0.99) |
张等¶ | 健康的志愿者 | C22.0肝细胞癌(HCC) | 473 | 564 | rs2242652 | 一个 | 0.004 | 0.70 (0.55 - 0.90) |
越南盾等* * | 健康的志愿者 | C22.0肝细胞癌(HCC) (hepatitis-induced) | 162 | 106 | rs10069690 | T | 0.00014§ | 0.36 (0.21 - 0.63) |
FinnGen组合 | 一般人群 | 肝和肝内胆管恶性肿瘤 | 442 | 204 070 | rs2242652 | 一个 | 0.007 | 0.80 (0.68 - 0.94) |
UKBB‡‡ | 一般人群 | 肝和肝内胆管恶性肿瘤 | 874 | 348 465 | rs2242652 | 一个 | 0.027 | 0.87 (0.78 - 0.97) |
UKBB‡‡ | 一般人群 | C22.0肝细胞癌(HCC) | 383 | 348 956 | rs2242652 | 一个 | 0.028 | 0.80 (0.66 - 0.98) |
BBJ日本§§ | BBJ人口¶¶ | C22.0肝细胞癌(HCC) | 1866 | 195 745 | rs72709458 | T | 0.00031 | 0.84 (0.76 - 0.92) |
*综合效应的估计阶段1和2所示本研究的样本表1(相比之下)。
†案例:ALD患者(80% F3-4纤维化;20% F0-2纤维化)和肝癌,控制:ALD患者(90% F3-4纤维化,10% F0-2纤维化)Trepo等。14
‡例:丙肝病毒相关的肝硬化和肝癌患者,控制:丙肝病毒相关的肝硬化患者没有肝细胞癌(在线补充方法F)。
口服补液盐§等位基因从2×2表计算等位基因数。dfχ意义被计算为12测试。
¶张等,52黄等51汉族患者肝癌(个人如果他们被排除在研究HCV)。
董* *等61 62男汉族患者病毒hepatitis-induced原发性肝细胞癌(r2 = 0.85之间rs10069690: T和rs2242652: A,变异都是在高连锁不平衡)。
一般人群控制组合(不含所有癌症)。
‡‡UKB数据纳入我们的探索分析,进一步审讯的肝癌表型UKB不构成独立的验证。
§§变体rs2242652和rs10069690没有可用的概要GWAS数据从石垣岛等63年(PMID: 32514122,公开http://jenger.riken.jp/en/result)(rs72709458是最接近代理rs2242652 (r2 = 0.973)。
¶¶移除疾病控制样品(胆道癌、食道癌、胃癌、结直肠癌和胰腺癌)。
ALD、酒精肝病;BBJ生物日本;EA,影响等位基因;FinnGen FinnGen生物库;GWAS,全基因组关联研究;丙肝病毒、丙型肝炎病毒;国际疾病分类ICD;;UKB,英国生物库。