显性基因型在Mucosa-associated大肠杆菌从小儿炎症性肠病的患者

背景

研究在成人与炎症性肠病(IBD)建议mucosa-associated大肠杆菌菌株可能参与其发病机理。本研究的目的是描述大肠杆菌菌株儿科肠粘膜的炎症性肠病病人调查特定子集的菌株是否可能与疾病相关。

方法

我们的基因和表型性状分析60大肠杆菌菌株分离从儿科患者的活检与克罗恩病(CD),溃疡性结肠炎(UC),从年龄组。

结果

没有发现值得注意的差异在phylogroups的分布。胶的比例大肠杆菌菌株相似活检的病人和控制。然而,的粘附能力大肠杆菌菌株回肠和结肠或直肠地区之间不同,只有在CD和UC患者的压力。的百分比大肠杆菌拥有超过1的胶/毒性菌株从加州大学决定因素明显高于从CD和控制。有趣的是,基因档案检查发现2大集群相关的基因大肠杆菌菌株从IBD患者。百分之九十二的菌株分离从CD患者在第一个集群(A)和分布式2基因subclusters (A1和A2),而第二个集群(B)包含的大多数菌株与加州大学(78%;subcluster B1),控制株(77%;subcluster B2)。

结论

基因组分析mucosa-associated大肠杆菌分离到的菌株发现基因之间的联系密切从CD和UC患者。

炎症性肠病(IBD)的发病机理,其中包括2个主要表型,克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC),¹是主机易感性之间的复杂的相互作用的结果,粘膜免疫和肠道环境。最近的一个主要的进步IBD发病机制的理解肠道菌群的参与有关。有证据支持这一假设肠道细菌在成人IBD的发病机理中发挥作用:炎症和损伤通常发生在肠道细菌浓度最高的区域²;IBD患者通常有更高的mucosa-associated细菌数量与正常人相比³;有益的细菌,如双歧杆菌属和乳酸菌种虫害是下降,而“温和致病性细菌大肠杆菌增加肠道内。^{4,- - - - - -6}其他重要扰动在IBD患者的胃肠道微生物群也被观察到。^{7,- - - - - -9}最近,共生的细菌的损耗,属于门厚壁菌门和拟杆菌门,据报道在IBD子集,这表明加州大学和CD以不同形式存在,可以通过微生物种群分化。¹⁰这种失调可能引起崩溃的一种公认的保护之间的平衡和有害肠道细菌,促进炎症。^7,11

尽管一些炎症性肠病的病理特征元素与微生物引起,特定的病原体尚未确定。^1,大肠杆菌主要的兼性厌氧菌的人类结肠菌群,一直怀疑。增加数量的mucosa-associated大肠杆菌曾被观察到在CD和UC患者。^{12,- - - - - -15}此外,一些大肠杆菌菌株从CD患者坚持和侵入肠上皮细胞,^5,13,16和广泛复制到巨噬细胞,¹⁷使小说pathovar大肠杆菌,adherent-invasive大肠杆菌(AIEC)。¹⁶有趣的是,先前的研究显示改变粘液糖蛋白的糖基化在炎症性肠病,这表明mucosa-associated细菌可能表达丰富的瘤胎碳水化合物抗原的特异性过表达的粘膜glycoconjugates。¹⁸这些变化可能反映了亚临床preinflammatory表面上皮的改变可能促进异常招聘的细菌,包括大肠杆菌。最近,它已经表明,AIEC附着力取决于1型菌毛的表达在细菌表面和癌胚antigen-related 6 (CEACAM6),细胞粘附分子表达的异常在CD患者回肠上皮细胞。¹⁹然而,是否在某些类型的增加大肠杆菌在IBD是炎症的结果或原因尚不清楚。

有人建议,一些大肠杆菌基因型比其他人更有可能与CD。⁶然而,这些研究是指成人,儿童IBD的很多特征,区别于成人IBD。^20.在儿童IBD患者我们以前显示mucosa-associated大幅上升大肠杆菌菌株与粘膜活检。²¹

本研究的具体目的是描述mucosa-associated大肠杆菌菌株评估如果可以关联到一个特定的子集CD和加州大学儿科患者。为了达到这个目标,基因组资料,系统分组、毒性基因马车,不同的生化和酶学性质,和粘附能力大肠杆菌菌株从活组织检查的儿童受到CD和加州大学进行了调查。

材料和方法

病人

38儿科患者(年龄:24年)指的是儿科胃肠病学和肝脏疑似IBD的罗马Sapienza大学的单位进行了研究:活跃的克罗恩病(CD)是诊断12日活跃的溃疡性结肠炎(UC) 7。剩下的19个学科与胃肠功能紊乱和正常的结肠镜检查和组织学作为控制。在报道表1基线人口统计学特征相似的3组。病人组年龄和疾病持续时间之间没有显著性差异。所有的孩子都与CD ileocolonic参与和都是严重的疾病活动范围(表1)。所有UC患者内镜pancolitis的证据,显示“反溅回肠炎,”和疾病列为严重表1)。加州大学和CD的诊断工作是根据国际协议。²¹接受抗生素的儿童在3个月前开始研究被排除在外,以及那些已经收到入学前4周内糖皮质激素。没有收到之前的治疗与硫唑嘌呤和6 -巯基嘌呤环孢霉素或其他免疫抑制和/或生物制剂在入学之前在任何时间。患者接受柳氮磺胺吡啶或mesalazine资格如果超过4周的方案稳定研究的开始和停止之前至少5天前内镜研究。最后,患者结肠清洗前的3个月的研究期间不合格。

CD评估患儿使用小儿克罗恩病活动指数(PCDAI),这是一个多产品分数基于召回前一周的症状,实验室参数(红细胞沉降率、红细胞比容和白蛋白),和体检。得分≤10意味着不活跃的疾病,11-30轻微的疾病,和> 30是严重疾病。²²UC患者评估使用儿童溃疡性结肠炎活动指数(PUCAI),这是只基于临床症状。得分< 10表明不活跃的疾病,11-34轻微的疾病,35 - 64温和的疾病,和≥65严重疾病。²³所有患者接受ileocolonoscopy后家长知情同意书。在所有患者中,结肠清洗进行了使用口服聚乙二醇(PEG)的解决方案(Klean-Preap Norgine,意大利米兰)。孩子住院,喝处方剂量的结肠清洗解决方案;鼻胃管插入,如果孩子没有喝规定的剂量。内窥镜检查是由相同的endoscopist儿科videocolonoscope(宾得EC3470、米兰、意大利)有意识的镇静后静脉(注射)哌替啶(1 - 2毫克/公斤)和咪达唑仑(0.1毫克/公斤)。远端回肠和结肠的粘膜检查改变的存在,如淋巴结节性增生,血管模式的消失,红斑和水肿、糜烂、溃疡(小型、大型、波形的),鹅卵石,炎性息肉。内窥镜病变CD和UC患者评估使用两个不同的分数进行验证。^24,25在ileocolonoscopy 2活检样本取自从每个结肠段回肠和常规组织学评估和细菌学的研究。

治疗活组织检查和细菌的培养条件

活检标本从CD(15毫克每),加州大学,和控制患者和来自不同地区(回肠、结肠和直肠)500年第一次洗μL 0.016%的生理盐水dithioerythritol清除粘液,然后摇动3 * 500年μL生理盐水,持续30秒。第四个洗净后,切片是hypotonically细胞溶解于500年由涡流30分钟μL蒸馏水。一百年μL低渗的溶菌作用后细胞碎片的镀在10倍到MacConkey琼脂稀释步骤。24小时后的孵化37°C,细菌菌落都孤立和亚文化在营养琼脂和先后被api 32 ID (Bio-Merieux、米兰、意大利)。

Pulsed-field凝胶电泳(但是脉冲场凝胶电泳的出现)打字

的大肠杆菌DNA限制模式评估,但是脉冲场凝胶电泳的出现打字如前所述。²⁶简单地说,后XbaI消化通过1.2% MPagarose DNA电泳(罗氏、米兰、意大利)。Tris-borate-gel但是脉冲场凝胶电泳的出现进行CHEF-DRII系统(Bio-Rad大力神,CA)。脉冲时间范围从1 - 20秒在21小时6 V / cm;温度是14°C。λconcatamers(新英格兰生物学实验室,伊普斯维奇,MA)作为标准大小。凝胶和溴化乙锭染色和数字化使用柯达数码科技系统(柯达、米兰、意大利)。生成一个二进制矩阵使用GelQuest软件(Sequentix克莱因Raden、德国)和后续使用XLSTAT 2007软件限制模式进行了分析,给出了系统树图基于欧氏距离的不同矩阵和病房的凝聚方法。

系统发育PCR分组

系统发育的大肠杆菌菌株被确定使用多重聚合酶链反应(PCR)所描述的克莱蒙特等。²⁷的PCR产品279个基点蔡基因的211个基点yjaA基因,152个基点的碎片TspE4C2基因。系统分组的基础上进行了特定的扩增片段菌进行基因的存在:A组(蔡,yjaA + / -, TspE4C2 -),B1组(蔡,yjaA + / -, TspE4C2 +)、B2组(蔡+ yjaA + TspE4C2 + / -),D组(蔡+ yjaA, TspE4C2 + / -)。

通过PCR鉴定致病性和Adhesion-associated基因

细菌鉴定为大肠杆菌PCR筛选的致病性与毒性相关的基因吗大肠杆菌菌株和已知fimbrial adhesin基因所示表2。的参考菌株virulence-associated基因:大肠杆菌DH5α,大肠杆菌EPEC 32 O55,大肠杆菌肠出血性大肠杆菌O157: H7,大肠杆菌EIEC HN280,教授提供的m . Nicoletti(基大学、意大利);大肠杆菌EAEC 042,大肠杆菌ETEC联盟1493年,大肠杆菌DAEC C1845,大肠杆菌ExPEC CFT073教授提供的p . Escobar-Paramo (INSERM、巴黎、法国)。所有菌株都生长在脑心浸液肉汤(嗨,Oxoid、罗马、意大利)或Trypticase大豆琼脂(TSA Oxoid)板块在一夜之间在37°C。被放大的DNA提取全细胞悬浮液用试剂盒提取的DNA试剂盒(试剂盒、希尔登,德国)。适当的细菌,编码的毒力基因,包括PCR积极控制。大肠杆菌DH5α作为消极的控制除了fimH基因。每个PCR(50μL)混合物组成的10毫米Tris-HCl (pH值8.3),50 mM氯化钾,2.5毫米MgCl₂,每个deoxynucleoside三磷酸浓度的0.20毫米,模板DNA,在0.5μM底漆,1.5 U的黄金TaqDNA聚合酶(应用生物系统公司、米兰、意大利)。放大产品受到在2%琼脂糖凝胶电泳,溴化乙锭染色紧随其后。

生化特性

的生化资料大肠杆菌50株进行了研究使用api CH (Bio-Merieux),碳水化合物的系统将50生化测试细菌新陈代谢,和api ZYM (Bio-Merieux)的半定量micromethod 19酶活动,根据制造商的指示。生化概要分析使用XLSTAT 2007软件,产生空间表示基于特定的生化集群之间的底物利用率和酶活性的差异。集聚是评估使用不同矩阵由欧几里得距离和病房的方法。

坚持人类肠道Caco细胞化验

层的分化Caco-2细胞(人类结肠细胞腺癌)24-well盘子最低基本培养基培养(MEM、Euroclone、米兰、意大利),与NaHCO补充₃1.2 g / L, 2毫米谷氨酰胺,青霉素100单位/毫升,链霉素0.1毫克/毫升,heat-inactivated 10%胎牛血清(Euroclone) 5%的股份有限公司₂孵化器。

附着力检测,细胞被播种密度的2×10⁴细胞/好,允许区分感染前15天。最大fimbrial表达细菌菌落,生长在营养琼脂和resuspended无菌生理盐水和左48小时在室温下据马丁et al。¹⁴每个单层感染≈1×10⁸每口井的细菌,估计两种菌落的数量(CFU)和光学密度。经过2小时的潜伏期在37°C,单层膜的清洗与磷酸盐PBS 3次,0.1%的细胞细胞溶解Triton x - 100和菌落的数量是由电镀。对于每一个实验的平均数量Caco-2细胞后15天文化的决心。细菌粘附细菌被定义为附加的百分比与初始剂相比,它是100%。附着力检测进行了一式三份。

所有大肠杆菌菌株受到额外的依从性化验的单层细胞与神经氨酸酶进行预处理。之前,简要分析,细胞与PBS洗两次,孵化2μg /毫升(0.5 - -6.0 IU /毫克)perfringens梭状芽胞杆菌神经氨酸酶类型V (Sigma-Aldrich、米兰、意大利)为1小时37°C,一次又一次在PBS洗两次。

统计方法

卡方测试被用来发现的分布是否诊断、CD,加州大学,无症状控制集群系统树图确定的之间的不同。获得的值百分比细菌粘附在3诊断组与右边的长尾分布;也就是说,积极的倾斜。是规范化的数据取对数的百分比统计分析之前。对数的百分比观察3组比较使用1路的方差分析(方差分析)。一个P值小于或等于0.05被认为是具有统计学意义。

结果

共有60的粘膜菌株大肠杆菌被孤立的文化:28来自CD患者(S1i、S2i S5i, S6i, S7i, S9i, S8i, S10i, S11i, S12i回肠;S3c、S13c S14c、S15c S16c, S17c, S18c, S19c, S20c结肠;S4r、S21r S22r、S23r S24r, S25r, S26r, S27r, S28r从直肠)19 UC患者(S29i、S30i S32i, S33i, S34i, S35i, S37i, S38i, S39i)从回肠;S31c、S36c S40c、S41c S43c结肠;S42r, S44r S45r、S46r S47r从直肠),从控制和13 (S48i、S50i S51i, S52i, S53i, S54i, S55i, S59i回肠;S56c、S57c S58c S60c,从结肠;从直肠S61r)。当细菌物种的出现在每个患者组相比,大肠杆菌中检测出10的12 (83%)CD患者中,7的7 (100%)UC患者,在10的19(53%)控制(χ2 = 6.35,P= 0.04)。发现的细菌负荷范围从1×10⁴1×10⁶在IBD标本和CFU /毫升,礼物,总是< 1×10³CFU /毫升的控制。

确定一个假定的克隆的身份大肠杆菌菌株,提取的DNA被但是脉冲场凝胶电泳的出现了。2007年XLSTAT DNA限制资料进行评估软件(图1)。分支2菌株之间的距离显示他们的程度的关系。阈值来定义一个集群是75.5%的相似性。系统树图显示3群大肠杆菌菌株分享高程度的相似性。在第一个集群(A),有27个大肠杆菌菌株,其中26起源于28菌株分离从CD患者中,1起源于13株从一个无症状的控制,并从UC患者(费舍尔没有测试P< 0.00005)。第二个集群(B)包括30株,其中2例28菌株的分离从CD患者中,16的19株隔绝UC患者和12的13株分离控制(χ2 = 45.8,P< 0.00005)。第三个集群(C)由3株,分离出1 UC患者。在集群(A)和(B)可以确定2 subclusters高度相关的菌株。A1和A2 subclusters包括几乎所有的CD大肠杆菌菌株、B1加州大学的大部分菌株和B2几乎所有控制压力。此外,大肠杆菌菌株分离出不同的肠道网站配置文件相同的病人通常呈现相同的限制。

随后,假定的系统发育关系孤立大肠杆菌菌株,以及virulence-associated基因通过pcr方法进行了研究。从这些分析结果,总结了表3,4,5(列a和b),显示数据按主题分组和隔离的起源。所有的系统发育背景大肠杆菌菌株由PCR检查分组分析表明,菌株中分离出CD患者中,43%(12/28)属于A组、D组39%(11/28),而只有14%(4/28)和3.6%(1/28)来自团体B2和B1,分别(列的表3- - - - - -5)。的大肠杆菌菌株与UC患者隔离,从A组42%(8/19),从D组31%(6/19),26%(5/19)的B2组。的大肠杆菌发现菌株从控制54%(7/13),38%(5/13),8%(1/13)在B1。然而,在团体B2菌株的比例和D之间没有显著差异3类CD,加州大学,控件(χ²= 1.24,P= 0.54)。为了分析病原体的毒力属性的出现和共生体大肠杆菌,我们调查的范围广泛的已知fimbrial丰富和致病性基因通常与毒性有关大肠杆菌菌株(列b表3- - - - - -5)。大量的大肠杆菌隔离是积极的fimH基因(56/60)和相对较少的阳性超过1的胶基因测试(21/60)。所有菌株被发现是负的存在致病性基因测试,除了S2i, S34i, S38i, S39i S40c, S42r, S60c株。在这些,有些毒性基因存在,即使其他基因通常属于同一操纵子的和/或致病的缺席。有趣的是,的百分比大肠杆菌菌株拥有超过1胶/毒性因素是菌株从加州大学(73%)显著高于从CD(21%)和控制(38%)(P< 0.05)。

生化和酶的概要大肠杆菌隔离在一个单一的系统树图(分析和比较图2)和集群获得也报道(列c表3- - - - - -5)。分支2菌株之间的距离显示他们的程度的关系。阈值定义一个集群被设定为69%。系统树图显示4集群大肠杆菌菌株(模拟)共享高程度的相似性。具体测试,每个集群定义是:L-sorbose(”,熊果苷(ARB)、七叶灵(ESC)水杨苷(SAL) D-saccharose(囊),D-arabinose(达拉)Draffinose (RAF),美沙酮(AMD)、木糖醇(XLT) D-tagatose(标签),potassium-5-ketogluconate(5公斤)、酯酶C4 (ESTasi)和T-glucosidase (TGLUasi)。集群(a)以积极SBE,囊,和5公斤,集群(b)达拉,集群(c) SBE, ARB, ESC,萨尔,囊,英国皇家空军,标签,和5公斤,和SBE集群(d),英国皇家空军,AMD, XLT ESTasi, TGLUasi。在大肠杆菌菌株从CD, 12/28(43%)属于集群(a), 15/28(53%)集群(b)和1/28(4%)集群(c)内大肠杆菌菌株从加州大学,10/19(53%)在集群(a),在集群(b), 2/19(10%)和7/19(37%)在第三集群(c),控制,85%(11/13)的菌株在集群(a)和15%(2/13)从集群的集群(c)。(d)包含一个压力来自CD病人。有一个趋势的大肠杆菌菌株从控制病人分布在集群(a),虽然大肠杆菌菌株从CD和UC患者更4集群(χ之间均匀分布²= 6.3,df= 2,P= 0.042)。然而,分离菌株的主题通常相同或密切相关的生化概要(s)不同主体的菌株相比(独立于疾病的类型)。

最后,胶粘剂的特性大肠杆菌隔离Caco-2细胞模型研究了d(列表3- - - - - -5)。平均referent nonadhesive菌株的粘附率大肠杆菌DH5α为0.4±0.3%的原培养液,而referent胶压力大肠杆菌EPEC 32 o55粘附指数平均值为2.7±0.7%。大肠杆菌压力测试在这个研究中被认为是附着时,意味着粘附指数0.8%或更多的原始培养液。胶菌株的比例为68%(19/28)在CD患者中,84%在UC患者(16/19),53%(7/13)在控制(χ²= 3.5,P= 0.17)。附着百分比最高的菌株被发现mucosa-associated之一大肠杆菌隔绝活检的UC患者(几何平均数1.57,95%可信区间[CI] 1.08 - -2.27),但它不是明显不同于CD(几何平均数1.01,95%可信区间0.75 - -1.36)和控制(几何平均数1.34,95%可信区间0.87 - -2.07)。由1路的方差分析这三个几何意味着没有显著差异(P= 0.19)。

为了获得体外条件相似的黏膜发炎¹⁸、并行神经氨酸酶Caco-2预处理细胞粘附实验进行。粘附的水平大肠杆菌菌株在列e enzyme-treated细胞报道表3- - - - - -5。附着的百分比大肠杆菌菌株隔离在活检从CD病人从68%上升-93%,从84% - -100%,加州大学,控制从53%下降了-84%。神经氨酸酶治疗后,附着压力增加的速度在所有3组,几何意味着CD 2.32 (95% CI 1.70 - -3.16), 3.64 (95% CI 2.47 - -5.34),加州大学,和3.13 (95% CI 1.99 - -4.92)控制。然而,通过1路的方差分析的对数附着菌株的比例,这些几何意味着没有显著差异(P= 0.19)。粘附率观察酶预处理后高于不治疗观察。乳糜泻患者粘附百分率为2.3 (95% CI 1.9 - -2.8)倍治疗后,UC患者和控制治疗后的值分别为2.3 (95% CI 2.0 - -2.7)和2.3 (95% CI 1.6 - -3.4)倍,分别。这些增加的1路的方差分析(没有显著差异P3 = 0.99)之间的病人组。比较平均的粘附能力大肠杆菌菌株分离肠道不同区域的报道表6。CD菌株未经处理的细胞的粘合度没有显著变化在不同的内脏位置(P> 0.05),而平均neuraminidase-treated细胞粘附水平明显高于比株菌株的回肠直肠(P< 0.05)。在加州大学菌株处理和未经处理的结肠细胞的粘附显示类似的模式,从冒号(增加压力P< 0.05)和直肠(P< 0.01)。粘性的压力控制中观察到的差异没有统计学意义的研究领域。

讨论

大多数微生物研究mucosa-associated IBD成人患者的处理肠杆菌科,特别是大肠杆菌,这似乎更多地参与该病的ethiopathogenesis比其他物种。的数量肠杆菌科是在成年患者的炎症性肠病组织明显高于在控制。^7,8截然不同的附着或侵入性压力大肠杆菌已确定的回肠粘膜CD患者¹³和参与一个新的潜在致病性群adherent-invasive大肠杆菌已经建议。^14,16

研究者和临床医生普遍认为,炎症性肠病在儿科学科有许多特点,区别于成人病。^20.在儿科患者最近的一项研究,我们证明了革兰氏阴性细菌,包括大肠杆菌,增加了3 - 4对数在IBD组织。²¹当前研究的目的是描述大肠杆菌菌株孤立在IBD儿科患者,试图描述一个朴素的生态系统和早期mucosa-associated微生物群没有混杂因素如并发症,并发症,先前的手术,或伴随的药物。本研究的主要发现通过限制概要的分析大肠杆菌菌株已经确定的存在显性基因型与儿科CD和加州大学。有争议的数据已报告的遗传相似度大肠杆菌孤立的从成人IBD。我们的结果与Masseret协议等,⁶这意味着一些基因型比其他人更有可能与慢性或复发性回肠病变早期CD,但对比与佐佐木等,²⁸未能找到相关基因菌株在加州大学和CD患者。基因组的系统树图生成配置文件显示2大集群相关的基因大肠杆菌菌株IBD患者:在第一个集群(A),有92%的大肠杆菌菌株分离从CD患者中,分布在2 subclusters (A1和A2);第二个集群包含78%的(B)大肠杆菌菌株与UC患者和77%的分离控制,分布在2 subclusters (B1和B2)。2个或更多的存在subclusters在CD和加州大学大肠杆菌菌株同意弗兰克等人的发现,¹⁰建议IBD可能出现在不同的形式,可以通过微生物种群分化。我们还发现,大肠杆菌株肠道不同区域的每个病人都相关,从而确认统一的殖民肠道地区同样的应变(s)在小儿炎症性肠病。

生化和酶活动的分析显示的趋势大肠杆菌菌株从CD和加州大学4集群之间进行分配,而控制菌株分布在一个集群。此外,大肠杆菌菌株在同一病人一般都属于相同或密切相关的集群,与相似的比例大于或等于96%。有趣的是,我们的研究结果表明高生化之间的同质性大肠杆菌菌株比IBD患者脱离控制。这些结果支持范Nuenen et al,^29日表明,微生物区系的IBD患者产生大量代谢产物比控制的微生物区系。它可以推测IBD微生物群的不同代谢活动可能与异常黏膜殖民与异构细菌新陈代谢。

它已经表明,致病性大肠杆菌压力往往来自系统组织B2和D,而共生的大肠杆菌从系统发育组和B1。¹⁵特别是,B2组和D是多样的进化谱系,因为他们的联想不同的感染症状,被认为是“致命的克隆。”在当下研究系统分组分析并没有显示出显著差异的分布系统组在IBD患者和控制,虽然致病B2组只在IBD患者被发现。

由于致病和非病原的大肠杆菌根据是否存在额外的菌株不同DNA元素有助于特定毒性特征,¹⁵我们调查了他们评估的存在不同的细菌粘附和致病性的标志。绝大多数大肠杆菌菌株,包括控制,发现港口至少1的细菌粘附基因测试。几乎所有导致积极的FimH粘附基因和消极的致病性基因测试。这是有趣的,有一个明确的趋势phylogroups B2或D与的存在有关原先都效命于基因。此外,菌株分离出相同的病人(CD患者1:菌株S2i, S3c, S4r;CD患者3:菌株S6i、S7i S15c, S23r S24r;CD患者9:菌株S11i、S20c S28r;UC患者1:菌株S31i、S32c S42c;UC患者3:菌株S30i S41c;UC患者5:菌株S38i S39i),虽然共享同一基因组资料,可能具有不同的毒性特征,通过横向转移在不同的肠道环境。

我们已经找到了很高比例的胶菌株在IBD患者和控制,同意Schultsz et al。³⁴神经氨酸苷酶处理后,附着菌株和粘附水平的总体百分比增加。通过比较意味着粘附水平大肠杆菌孤立从CD患者肠道不同地区,发现粘性neuraminidase-treated细胞明显高于比株菌株的回肠直肠。这增加的粘附能力大肠杆菌菌株回肠黏膜的CD患者neuraminidase-treated Caco2细胞可以连接两个特定受体的需求的模式表达式粘膜发炎,出现大肠杆菌菌株的具体因素的粘合剂。其他作者已经证明大肠杆菌AIEC菌株的FimH人类癌胚抗原变异参与绑定CEACAM6,过表达只在回肠CD肠上皮细胞的顶端表面。¹⁹我们发现意味着粘连的治疗和neuraminidase-treated细胞水平大肠杆菌菌株分离出结肠和直肠活检的UC患者显著增加。这可以解释为发生在UC患者比例更高的压力已经拥有超过1的胶/致病因素,使她们能坚持不同的结合位点Caco-2细胞在两种不同的实验条件。最后,通过比较这些结果暗示肠道粘附在不同地区与肠道粘附水平位置的疾病,例如CD,回肠和结肠和直肠的加州大学。综上所述,这些结果可能阐明细菌相互作用的性质与IBD的粘膜发炎儿科患者因为知识之间的交互元素主机和植物可能代表一个重要的步骤对这些疾病的诊断和治疗。

本研究的目的是发现如果一个特定的子集大肠杆菌菌株参与儿科患者,发现成年人。¹²我们的数据突出显性基因的存在配置文件相关的疾病,并在平均附着水平的显著差异大肠杆菌肠道菌株不同地区。这些结果表明,一些常见的遗传因素可能允许选择性地优先从腔内细菌微生物群在一个特定的栖息地。这可能是由于不同上皮受体的表达的改变模式能够促进细菌粘附肠粘膜的炎症性肠病病人。

进一步的研究应该集中在假定的未知的识别大肠杆菌遗传因素参与儿童IBD的炎症过程。这些分子的研究应该基于DNA序列的映射描述基因的大肠杆菌菌株与CD、加州大学和控制。这种方法,除了肠道微生物群的简单描述,可以帮助我们理解的积极信号通路在特定细菌组/物种或基因型,并可能代表一个关键在治疗这些疾病的新策略。

引用

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