摘要
肠道菌群组成的改变与几种慢性疾病有关，包括肥胖和炎症性疾病。老年人的微生物群表现出比年轻人更大的个体间差异。在这里，我们表明178名老年受试者的粪便微生物组成组成了组，与社区、日间医院、康复或长期住院护理的居住地点相关。然而，按饮食分组的受试者因相同的居住地点和微生物群分组而被分开。微生物群组成的分离与虚弱、共病、营养状况、炎症标志物和粪便水中的代谢物显著相关。长期护理人群的个体微生物群的多样性明显低于社区居民。群落相关微生物群的损失与虚弱程度的增加相关。总的来说，这些数据支持饮食、微生物群和健康状况之间的关系，并表明饮食驱动的微生物群变化在衰老后不同程度的健康下降中发挥了作用。
这是订阅内容的预览，通过你所在的机构访问
相关的文章
引用本文的开放获取文章。
坚持地中海饮食和饮食总抗氧化能力与细菌性阴道病之间有任何联系吗?病例对照研究结果
BMC妇女健康开放获取2022年6月20日
全面的16S rRNA和宏基因组数据来自衰老和恢复小鼠模型的肠道微生物组
科学数据开放获取2022年5月10日
年轻和老年小鼠之间的粪便微生物群转移逆转了衰老的肠道、眼睛和大脑的特征
微生物组开放获取2022年4月29日
访问选项
订阅期刊
获得1年的完整期刊访问权限
199.00美元
每期仅需3.90美元
所有价格均为净价格。
增值税稍后将在结帐时添加。
税务计算将在结账时完成。
买条
在ReadCube上获得时间限制或全文访问。
32.00美元
所有价格均为净价格。
参考文献
O 'Toole, P. W. & Claesson, m.j.肠道菌群:从婴儿到老年的整个生命周期的变化。Int。乳制品J。20.， 281-291 (2010)
弗兰克，D. N.等人。人类炎症性肠病中微生物群落失衡的分子系统发育特征。国家科学院学报美国104， 13780-13785 (2007)
秦，等。宏基因组测序建立的人体肠道微生物基因目录。自然464， 59-65 (2010)
卡西宁，A.等人。肠易激综合征患者的粪便微生物群与健康受试者有显著差异。胃肠病学133， 24-33 (2007)
杰弗瑞，i.b.等。一种肠易激综合征亚型，由粪便微生物群的物种特异性改变定义。肠道61， 997-1006 (2012)
Ley, R. E.， Turnbaugh, P. J.， Klein, S. & Gordon, J. I.微生物生态学:人类肠道微生物与肥胖相关。自然444， 1022-1023 (2006)
rajilii - stojanovic, M.等人。人类肠道芯片的开发和应用，一种系统发育微阵列:分析青年人和老年人丰富的微生物群中普遍保守的系统型。环绕。Microbiol。11， 1736-1751 (2009)
克莱森，m.j.等人。老年人肠道菌群的组成、变异和时间稳定性。国家科学院学报美国108(增刊1). 4586-4591 (2011)
比亚吉，E.等。通过衰老，以及以后:老年人和百岁老人的肠道微生物群和炎症状态。《公共科学图书馆•综合》5， e10667 (2010)
Franceschi, C.等人。炎症老化:免疫衰老的进化观点。安。纽约理工学院908， 244-254 (2000)
加勒特，W. S.，戈登，J. I. &格里姆彻，L. H.肠道内稳态与炎症。细胞140， 859-870 (2010)
Guigoz, Y.， Dore, J. & Schiffrin, E.老年的炎症状态可以从肠道环境中培养。咕咕叫。当今。中国。减轻。金属底座。护理11， 13-20 (2008)
范汤格伦，s.p.，斯莱茨，j.p.，哈尔森，h.j.和韦林，g.w.粪便微生物群组成和脆弱性。达成。环绕。Microbiol。71， 6438-6442 (2005)
与年龄相关的肠道生理和营养状况的变化。肠道38， 306-309 (1996)
希尔德布兰特，m.a.等。高脂肪饮食决定了独立于肥胖的小鼠肠道微生物群的组成。胃肠病学137， 1716-1724 (2009)
Mai, V.， McCrary, Q. M.， Sinha, R. & Glei, M.饮食习惯和体重指数与肠道微生物群组成和粪便水遗传毒性之间的关系:一项针对非裔美国人和白种人志愿者的观察性研究。减轻。J。8， 49 (2009)
Muegge, B. D.等。饮食驱动肠道微生物群功能在哺乳动物系统发育和人类内部的收敛。科学332， 970-974 (2011)
De Filippo, C.等人。一项针对欧洲和非洲农村儿童的比较研究揭示了饮食对塑造肠道微生物群的影响。国家科学院学报美国107， 14691-14696 (2010)
特恩鲍，P. J.等人。饮食对人类肠道微生物群的影响:人源化gnotobiomice的宏基因组分析。科学。Transl。地中海。1， 6ra14 (2009)
Faith, J. J.， McNulty, N. P.， Rey, F. E. & Gordon, J. I.预测人类肠道微生物群对gnotobiomice饮食的反应。科学333， 101-104 (2011)
吴，g.d.等。将长期饮食模式与肠道微生物肠型联系起来。科学334， 105-108 (2011)
Lozupone, C. & Knight, R. UniFrac:比较微生物群落的一种新的系统发育方法。达成。环绕。Microbiol。71， 8228-8235 (2005)
Drescher, L. S.， Thiele, S. & Mensink, G. B.一个衡量健康食物多样性的新指数比传统指标更能反映健康饮食。j .减轻。137， 647-651 (2007)
杨松，J.等人。代谢组学揭示克罗恩病的代谢生物标志物。《公共科学图书馆•综合》4， e6386 (2009)
普莱德，S. E.，邓肯，S. H.， Hold, G. L.，斯图尔特，C. S. &弗林特，H. J.人类结肠中丁酸盐形成的微生物学。《。列托人。217， 133-139 (2002)
de Groot, V.， Beckerman, H.， Lankhorst, G. J. & Bouter, L. M.如何测量共病。对可用方法的批判性回顾。j .中国。论文。56， 221-229 (2003)
Mahoney, F. I. & Barthel, D. W.功能评价:Barthel指数。马里兰州立医学院。14， 61-65 (1965)
基德，D.等。功能独立性测量:比较效度和信度研究。Disabil。Rehabil。17， 10-14 (1995)
Folstein, M. F.， Folstein, S. E. & McHugh, p.r.“微型精神状态”:临床医生对患者认知状态进行分级的实用方法。j . Psychiatr。Res。12， 189-198 (1975)
鲍尔，J. M.，凯泽，M. J.，安东尼，P.， Guigoz, Y. & Sieber, C. C.迷你营养评估——它的历史、今天的实践和未来展望。减轻。中国。Pract。23， 388-396 (2008)
克鲁兹-詹托夫特，A. J.等人。肌肉减少症:关于定义和诊断的欧洲共识:老年人肌肉减少症欧洲工作组的报告。年龄老化39， 412-423 (2010)
Nyamundanda, G.， Brennan, L. & Gormley, i.c.代谢组学数据的概率主成分分析。BMC生物信息学11， 571 (2010)
王哲，等。肠道菌群代谢磷脂酰胆碱促进心血管疾病。自然472， 57-63 (2011)
Arumugam等人。人类肠道微生物群的肠型。自然473， 174-180 (2011)
欧盟委员会。人口结构与老龄化http://epp.eurostat.ec.europa.eu/statistics_explained/index.php/Population_structure_and_ageing(2011)
金塞拉，K.;老龄化的世界:2008(美国政府印刷局，2009)
考，A. L.，埃亨，P. P.，格里芬，N. W.，古德曼，A. L.和戈登，J. I.人类营养，肠道微生物群和免疫系统。自然474， 327-336 (2011)
沃克，a.w.等人。人类结肠菌群中的优势菌群和饮食反应菌群。ISME J。5， 220-230 (2011)
卡波拉索，J. G.等。QIIME允许分析高通量群落测序数据。自然方法7， 335-336 (2010)
王琪，王志强，王志强，王志强，王志强。基于朴素贝叶斯分类器的rRNA序列快速分类。达成。环绕。Microbiol。73， 5261-5267 (2007)
奥沙利文，A，吉布尼，M. J.和布伦南，L.饮食摄入模式反映在代谢组学概况:饮食评估研究的潜在作用。点。j .中国。减轻。93， 314-321 (2011)
哈林顿等人。不良饮食的社会人口学、健康和生活方式预测因素。公共卫生专家。14， 2166-2175 (2011)
麦坎斯，r.a. & Widdowson, e.m.。食物的成分英国皇家学会化学,2002)
克莱森，m.j.等人。焦磷酸测序和系统发育微阵列用于探索人类远端肠道微生物群落结构的比较分析。《公共科学图书馆•综合》4， e6669 (2009)
李尔本，t.g. & Garrity, g.m.探索原核分类学。Int。j .系统。另一个星球。Microbiol。54， 7-13 (2004)
卡波拉索，J. G.等。PyNAST:将序列与模板对齐的灵活工具。生物信息学26， 266-267 (2010)
Price, M. N. Dehal, P. S. & Arkin, A. P. FastTree 2 -用于大对齐的近似最大似然树。《公共科学图书馆•综合》5， e9490 (2010)
Hamady, M.， Lozupone, C. & Knight, R. Fast UniFrac:促进微生物群落的高通量系统发育分析，包括pyrosequencing和PhyloChip数据分析。ISME J。4， 17-27 (2010)
明木，八屋，八屋，田中，H. &榊原，Y.美国计算机学会生物信息学、计算生物学和生物医学会议(美国计算机协会，2011)
Chevreux, B.等人。使用miraEST组装程序进行可靠和自动化的mRNA转录本组装和测序est中的SNP检测。基因组Res。14， 1147-1159 (2004)
野口，H.， Park, J.和高木，T. MetaGene:原核基因从环境基因组霰弹枪序列发现。核酸测定。34， 5623-5630 (2006)
柯恩克，R. &巴塞特，G.回归分位数。费雪46， 33-50 (1978)
冯晓东，何兴民，胡建辉。分位数回归的Wild bootstrap。生物统计学98， 995-999 (2011)
Benjamini, Y. & Hochberg, Y.控制错误发现率:多重测试的一种实用而强大的方法。J. R.统计社57， 289-300 (1995)
达布尼，A.， Storey, J. D. & Warnes, G. R. qvalue:问错误发现率控制的-值估计;R包版本为1.24.20。(2010)
确认
这项工作得到了爱尔兰国家发展计划政府的支持，由农业部、食品和海洋部、卫生研究委员会FHRI授予ELDERMET项目，以及由爱尔兰科学基金会授予食品药物中心。M.J.C.由爱尔兰健康研究委员会的奖学金资助。我们感谢K. O 'Donovan和P. Egan的临床协助，感谢科克市和县医院的工作人员为受试者招募提供便利，感谢S. Wong和B. Clayton为超级计算机访问提供便利。
作者信息
作者及隶属关系
贡献
所有作者均为ELDERMET联盟成员(http://eldermet.ucc.ie)．P.W.O.T, E.M.O.C, s.c。1和R.P.R.管理项目;的官员,G.F.F王秋森,J.R.M, f.s.,刘昀,R.P.R. PWOT设计分析;m.j.c.， I.B.J, s.c .公司3.M.C。,,E.M.O.C H.M.B.H B.L, o, A.P.F, S.E.P,分子量和第2进行分析;J.D.进行DNA提取和PCR;M.W.和L.B.进行NMR代谢组学;m.o.c.， n.h.， K.O.C.和D.O.M.进行了临床分析;m.j.c.， I.B.J, s.c .公司3., E.M.O.C商量。,J.R.M A.P.F, R.P.R,刘昀,F.S. P.W.O.T.写的手稿。
相应的作者
道德声明
相互竞争的利益
作者声明没有相互竞争的经济利益。
额外的信息
扩增子序列数据，散弹枪序列数据，contigs，基因和注释已在mg - rast项目ID 154 (http://metagenomics.anl.gov/linkin.cgi?project154)．
权利和权限
关于本文
引用本文
克莱森，M.，杰弗里，I.，康德，S。et al。肠道菌群组成与老年人饮食和健康相关。自然488， 178-184(2012)。https://doi.org/10.1038/nature11319
收到了：
接受：
发表：
发行日期：
DOI：https://doi.org/10.1038/nature11319
这篇文章被引用
年轻和老年小鼠之间的粪便微生物群转移逆转了衰老的肠道、眼睛和大脑的特征
微生物组(2022)
肠易激综合征与微生物组;从传统的诊断和治疗转向个性化干预
转化医学杂志(2022)
微生物组数据无监督聚类方法的性能决定因素
微生物组(2022)
免疫遗传变异在自然脊椎动物种群中形成肠道微生物群
微生物组(2022)
肠道菌群和真菌菌群均与危重患者28天的死亡率相关
急救护理(2022)
