胰腺癌基因揭示畸变在轴突引导途径的基因

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• 2012年11月14日

  作者“奇儿徐”的拼写纠正;小格式确认和从属关系发生了改变。

本文致力于罗伯特·l·萨瑟兰于2012年10月10日死于胰腺癌。我们要感谢c·埃克斯福特,d .据M.-A。布兰卡多,美国罗,m·托马斯·s·辛普森和g·哈蒙德的中央协调澳大利亚胰腺癌症基因组计划,数据管理和质量控制;m . Martyn-Smith l . Braatvedt h . Tang诉Papangelis和m·贝林biospecimen收购;和w·Waterson j . Shepperd e·坎贝尔和大肠Glasov昆士兰医学基因组学中心为他们的努力。我们还要感谢m . b . Hodgin m . Debeljak约翰霍普金斯大学和d .可靠的技术援助,刘德华和j·m·Karaus k .瑞芭l .张和t Smyrk梅奥诊所。我们确认以下的资金支持:澳大利亚国家健康与医学研究理事会(NHMRC;631701、535903、427601、535914);澳大利亚政府:部门创新、工业、科学研究和高等教育(DIISRTE);澳大利亚癌症研究基金会(ACRF); Queensland Government (NIRAP); University of Queensland; Cancer Council NSW (SRP06-01; ICGC09-01; SRP11-01); Cancer Institute NSW (06/ECF/1-24, 09/CDF/2-40, 07/CDF/1-03, 10/CRF/1-01, 08/RSA/1-15, 07/CDF/1-28, 10/CDF/2-26,10/FRL/2-03, 06/RSA/1-05, 09/RIG/1-02, 10/TPG/1-04, 11/REG/1-10, 11/CDF/3-26); Garvan Institute of Medical Research; Avner Nahmani Pancreatic Cancer Research Foundation; R.T. Hall Trust; Petre Foundation; Jane Hemstritch in memory of Philip Hemstritch; Gastroenterological Society of Australia (GESA); American Association for Cancer Research (AACR) Landon Foundation – INNOVATOR Award; Royal Australasian College of Surgeons (RACS); Royal Australasian College of Physicians (RACP); Royal College of Pathologists of Australasia (RCPA); HGSC-BCM: NHGRI U54 HG003273; CPRIT grant RP101353-P7 (Tumor Banking for Genomic Research and Clinical Translation Site 1); The Ontario Institute for Cancer Research; The Ontario Ministry of Economic Development and Innovation; Canada Foundation for Innovation; Pancreatic Cancer Genetic Epidemiology Consortium, NIH grant R01 CA97075; The Agency for Science, Technology, and Research (Singapore); University of Verona and Italian Ministry of University (FIRB RBAP10AHJB), Rome, Italy; Cancer Research UK; Wellcome Trust; CPRIT (Cancer Prevention Research Institute of Texas); NIH P50CA062924 (SPORE) and P01CA134292 (PPG); The Sol Goldman Pancreatic Cancer Research Center; NCI grant P50 CA102701 (Mayo Clinic SPORE in Pancreatic Cancer) and NCI grant R01 CA97075 (Pancreatic Cancer Genetic Epidemiology Consortium); NIH SPORE grant 2P50CA101955 (UMN/UAB), and AIRC (Associazione Italiana Ricerca sul Cancro) 5xmille grant 12182, Italy.

作者指出

1. 罗伯特·l·萨瑟兰:已故。

作者和联系

1. Darlinghurst Kinghorn癌症中心,370年维多利亚街,和癌症研究计划,Garvan医学研究所,384年维多利亚街,Darlinghurst,悉尼,2010年新南威尔士,澳大利亚。

   安德鲁•诉Biankin琥珀l . Johns健民吴、大卫·k . Chang马克·j·考利滨Pajic,克里斯托弗·j·斯佳丽,安东尼·j·吉尔Andreia诉Pinho,伊尔丝Rooman,马克Pinese r·斯科特•米德杰里米·l·Humphris沃伦·卡普兰,马克·d·琼斯,艾米丽·k·科尔文,Adnan m . Nagrial艾米丽·s·汉弗莱,安琪拉周,凡妮莎t .下巴,洛林a . Chantrill阿曼达·莫森,詹姆斯·g·肯奇杰西卡·a·洛弗尔罗杰·j·戴利克里斯托弗·图恩,伊丽莎白Musgrove &罗伯特·l·萨瑟兰

2. 外科学系,Bankstown医院,埃尔德里奇,Bankstown,悉尼,2200年新南威尔士,澳大利亚。

   大卫·k·安德鲁•诉Biankin Chang和尼尔·d·与生命

3. 南西悉尼临床学院、医学院、新南方大学威尔士,利物浦,2170年,新南方威尔士,澳大利亚

   安德鲁诉Biankin &大卫·k·张

4. 昆士兰医学基因组学中心研究所分子生物科学,昆士兰大学,圣卢西亚,4072年,澳大利亚昆士兰州布里斯班

   尼古拉Waddell,卡琳Kassahn,大卫·k·米勒,Peter j . Wilson,安玛丽补丁,布鲁克·b·加德纳萨拉歌,Ivon Harliwong, Senel Idrisoglu,克雷格•诺斯•Nourbakhsh,苏珊娜曼宁Shivangi万尼米贡戈拉,马修·安德森,奥利弗·福尔摩斯,康拉德·伦纳德,达林泰勒,斯科特木头,奇儿,凯蒂斯——j·林恩·芬克Angelika基督,蒂姆•Bruxner费莉希蒂纽厄尔,约翰·尼科尔·科卢楠诉皮尔森和肖恩·m·Grimmond

5. 分子和人类遗传学、人类基因组测序中心,贝勒医学院一个贝勒广场,MS226,休斯顿,德克萨斯州77030 - 3411,美国。

   Marie-Claude Gingras、他Kakkar Fengmei赵,元清,王敏,唐娜·m·Muzny珍妮弗·德拉蒙德,凯尔,杰弗里·g·里德一汉,罗拉r·刘易斯Huyen Dinh,基督教j . Buhay大卫·a·惠勒和理查德·a·吉布斯

6. 迈克尔·e·DeBakey外科学系,贝勒医学院一个贝勒广场,休斯顿,德克萨斯州77030 - 3411,美国。

   Marie-Claude Gingras威廉·e·费舍尔和莎莉·e·霍奇

7. 多伦多安大略癌症研究所M5G 0 a3,加拿大

   Lakshmi Muthuswamy,蒂莫西·贝克李•蒂姆斯米歇尔·山姆金伯利贝格利,安德鲁·布朗迪帕劳Ami应,尼古拉斯·毕希纳理查德•德博佳罗伯特·e·Denroche,克里斯蒂娜·k·容妮可Onetto,林肯·d·斯坦,托马斯·哈德逊和约翰·d·麦克弗森

8. 环境与生命科学学院的帅哥纽卡斯尔大学2258年,澳大利亚新南威尔士州

   克里斯托弗·j·斯佳丽

9. 部解剖病理学,皇家北岸医院,圣伦纳德,悉尼,2065年,澳大利亚新南威尔士州

   安东尼·j·吉尔&以及美国谋求

10. 2006年悉尼大学、悉尼,澳大利亚新南威尔士州

    安东尼·j·吉尔和詹姆斯·g·肯奇

11. 生活技术,4000年,澳大利亚昆士兰州布里斯班

    盖伯瑞尔》

12. 部解剖病理学、Sydpath悉尼圣文森特医院2010年,澳大利亚新南威尔士州

    r·斯科特·米德和安吉拉·周

13. 皇家北岸医院外科学系,圣伦纳德,悉尼,2065年,澳大利亚新南威尔士州

    以及美国谋求

14. 组织病理和诊断肿瘤,皇家王子阿尔弗雷德医院,Camperdown, 2050年,澳大利亚新南威尔士州

    詹姆斯·g·肯奇

15. 潘瑞斯西悉尼大学医学院,2175年,澳大利亚新南威尔士州

    尼尔·d·与生命

16. 外科学系,弗里曼特尔医院,阿尔玛街,弗里曼特尔,澳大利亚西部6160年,澳大利亚。

    克里希纳Epari

17. 美国胃肠病学、皇家阿德莱德医院、北露台,阿德莱德,5000年南澳大利亚,澳大利亚。

    南问:阮

18. 外科学系,昆士兰大学的亚历山德拉公主医院,伊普斯维奇,Woollongabba, 4102年昆士兰,澳大利亚。

    安德鲁·巴伯

19. 手术M507学院西澳大利亚大学35斯特林号,Nedlands 6009年,澳大利亚和圣约翰神的病理学、12 Salvado路,Subiaco, 6008年西澳大利亚,美国,

    Nikolajs齐柏林飞艇

20. Elkins胰腺atBaylor大学医学中心,6620大街,1450套房,休斯顿,德克萨斯州77030,美国。

    威廉·e·费舍尔和莎莉·e·霍奇

21. 洛杉矶加州大学洛杉矶分校的大卫格芬医学院,90024年,美国Callfornia

    f·查尔斯Brunicardi

22. 大学健康网络,M5G2C4、加拿大多伦多

    斯特凡诺塞拉,Ming-Sound曹,帕特里夏·a·肖和史蒂文难堪的

23. 美国明尼苏达州罗彻斯特市梅奥诊所55905

    Debabrata Mukhopadhyay和格洛丽亚·m·彼得森

24. 西奈山医院,多伦多,M5G 1 x5,加拿大

    史蒂文难堪的

25. 病理学系,索尔高盛胰腺癌研究中心,约翰霍普金斯大学医学院,21231年,美国马里兰州巴尔的摩

    拉尔夫·h·Hruban Anirban Maitra Christine a . Iacobuzio-Donahue理查德·a·摩根和詹姆斯·r·Eshleman

26. 外科学系,索尔高盛胰腺癌研究中心,约翰霍普金斯大学医学院,21231年,美国马里兰州巴尔的摩

    理查德·d·Schulick &克里斯托弗·l·沃尔夫冈

27. ARC-NET癌症应用研究中心、大学和医院的信任维罗纳,维罗纳,37134年,意大利

    丽塔·t·Lawlor Vincenzo Corbo &阿尔多斯卡帕

28. 大学病理学系和诊断贝隆,维罗纳,37134年,意大利

    Paola卡佩里,玛丽亚Scardoni &阿尔多斯卡帕

29. 手术和肿瘤,大学和医院的信任维罗纳,维罗纳,37134年,意大利

    Giampaolo Tortora

30. 血液学和肿瘤学,加州大学,旧金山,94115年,美国

    玛格丽特·a·Tempero

31. 癌症研究计划,卫理公会医院研究所Bertner大街6670号,休斯顿,德克萨斯州77030,美国。

    凯伦·m·曼南希·a·詹金斯和尼尔·g·科普兰

32. 和肿瘤学部门,李嘉诚中心剑桥研究所,英国癌症研究,罗宾逊,CB2 0再保险,英国剑桥

    佩德罗·a·Perez-Mancera & David a . Tuveson

33. 维尔康姆基金会桑格研究所实验癌症遗传学,Hinxton, CB10 1 hh,英国

    大卫·j·亚当斯& Alistair g .生锈

34. 共济会癌症中心,明尼苏达大学,55455年,美国明尼苏达州明尼阿波利斯市

    David a . Largaespada

35. 生物信息学和统计,荷兰癌症研究所,121年Plesmanlaan 1066 CX阿姆斯特丹,荷兰。

    Lodewyk f.a.h ayek鞋号

36. 圣文森特临床学院,医学院,新南威尔士大学,新南威尔士,澳大利亚2010年

    伊丽莎白·a·Musgrove和罗伯特·l·萨瑟兰

37. Kinghorn癌症中心,癌症研究计划,Garvan医学研究所,370年维多利亚街,Darlinghurst,悉尼,2010年新南威尔士,澳大利亚。

    安德鲁•诉Biankin琥珀l . Johns阿曼达·莫森,大卫·k . Chang克里斯托弗·j·斯佳丽,玛丽·安妮·l·布兰卡多莎拉·j·罗,斯凯l·辛普森莫娜Martyn-Smith,米歇尔·t·托马斯,洛林a . Chantrill凡妮莎t .下巴,安琪拉周,马克·j·考利杰里米·l·Humphris马克·d·琼斯,r·斯科特•米德Adnan m . Nagrial滨Pajic,杰西卡·佩蒂特,马克Pinese Ilse Rooman健民吴、江泽民道,蕾妮DiPietro,克莱尔华生,瑞秋黄,Andreia诉Pinho,罗杰·j·戴利,伊丽莎白·a·马克•Giry-Laterriere Musgrove和罗伯特·l·萨瑟兰

38. 昆士兰医学基因组学中心研究所分子生物科学,昆士兰大学,圣卢西亚,4072年,澳大利亚昆士兰州

    肖恩·m·Grimmond尼古拉Waddell,卡琳Kassahn,大卫·k·米勒,Peter j . Wilson,安玛丽补丁,萨拉歌,Ivon Harliwong, Senel Idrisoglu,克雷格•诺斯•Nourbakhsh,苏珊娜曼宁Shivangi万尼米贡戈拉,马修·安德森,奥利弗·福尔摩斯,康拉德·伦纳德,达林泰勒,斯科特木头,奇儿,凯蒂斯——j·林恩·芬克Angelika基督,蒂姆•Bruxner尼科尔·科卢楠费利西蒂纽厄尔&约翰·皮尔逊诉

39. 皇家北岸医院,Westbourne街,圣伦纳德,2065年,澳大利亚新南威尔士州

    以及美国谋求,安东尼·j·吉尔尼克Pavlakis,亚历克斯Guminski &克里斯托弗·图恩

40. Bankstown Bankstown医院,埃尔德里奇路,2200年,澳大利亚新南威尔士州

    安德鲁•诉Biankin Ray Asghari尼尔·d·与达伦·a·大卫·k . Chang Pavey &阿弥陀佛Das

41. 利物浦医院,伊丽莎白街,利物浦,2170年,澳大利亚新南威尔士州

    彼得·h·Cosman Kasim伊斯梅尔& Chelsie奥康纳

42. 韦斯特米德医院,Hawkesbury和达西公路,韦斯特米德,2145年新南威尔士,澳大利亚。

    文森特·w·Lam邓肯•麦克劳德亨利•波里斯·c·阿瑟·理查森和弗吉尼亚州的詹姆斯

43. 皇家王子阿尔弗雷德医院Missenden路,Camperdown, 2050年新南威尔士,澳大利亚。

    詹姆斯·g·肯奇卡罗琳·l·库珀,大卫·约瑟夫Charbel Sandroussi,迈克尔·克劳福德和詹姆斯·加拉格尔

44. 西澳大利亚弗里曼特尔医院,阿尔玛街,弗里曼特尔,6959年,澳大利亚。

    迈克尔•Texler辛迪·福勒斯特,安德鲁·莱科克Krishna p . Epari莫Ballal,大卫·r·弗莱彻和桑杰Mukhedkar

45. 查尔斯爵士Gairdner医院,医院的大道,Nedlands, 6009年,澳大利亚西部,澳大利亚

    奈杰尔•a .敏捷Bastiaan DeBoer &明茶

46. 神的圣约翰医疗、12 Salvado路,Subiaco, 6008年澳大利亚西部,澳大利亚。

    贝林Nikolajs齐柏林飞艇,玛丽亚& Kynan捐助

47. 皇家阿德莱德医院,北阳台,5000年,南澳大利亚,澳大利亚阿德莱德

    南问:阮,安德鲁·r·Ruszkiewicz克里斯•Worthley栓p . Tan & Tamara Debrencini

48. 弗林德斯医疗中心,弗林德斯驱动,贝德福德公园,5042年,南澳大利亚,澳大利亚

    马克·e·约翰·陈中华&弗吉尼亚Papangelis

49. Greenslopes Greenslopes私人医院,Newdegate街4120年昆士兰,澳大利亚。

    唐英年和安德鲁·p·巴伯

50. suyinn chong使节病理学,1/49巴特菲尔德街4006年昆士兰,澳大利亚。

    安德鲁·d·Clouston &帕特里克·马丁

51. 亚历山大公主医院,康沃尔街和伊普斯维奇,Woolloongabba, 4102年昆士兰,澳大利亚。

    托马斯·j . O’rourke艾米蒋介石,乔纳森·w·福西特里,斯莱特迈克尔·希恩Yeung Hatzifotis &彼得·哈吉金森

52. 奥斯汀医院,Studley路145号,海德堡3084年维多利亚,澳大利亚。

    克里斯托弗•Christophi人士Nikfarjam &安琪拉山维多利亚癌症生物

53. 维多利亚癌症生物1 Rathdowne街,卡尔顿,3053年维多利亚,澳大利亚。

    安琪拉山维多利亚癌症生物

54. 约翰霍普金斯大学医学研究院,沃尔夫大街600号,巴尔的摩,马里兰州21287,美国。

    詹姆斯·r·Eshleman拉尔夫·h·Hruban Anirban Maitra, Christine a . Iacobuzio-Donahue理查德·d·Schulick克里斯托弗·l·沃尔夫冈·理查德·a·摩根与玛丽Hodgin

55. ARC-NET应用研究中心癌症,维罗纳大学通过戴尔'Artigliere, 19 37129维罗纳37134,意大利。

    阿尔多斯卡帕,丽塔·t·Lawlor Paola卡佩里,普Beghelli, Vincenzo Corbo,玛丽亚Scardoni, Paolo Pederzoli Giampaolo Tortora &克劳迪奥·低音部

56. 加州大学,旧金山,Divisadero街1600号,旧金山,加州94115,美国。

    玛格丽特·a·Tempero

财团

贡献

组成澳大利亚胰腺癌症基因组计划的研究网络,贝勒医学院的癌症基因组项目和安大略癌症研究所胰腺癌症基因组研究(ABO血型协作)为这项研究提供集体作为国际癌症基因组协会的一部分。Biospecimens附属医院收集和处理在每个biospecimen核心资源中心。数据生成和分析基因组测序中心,癌症基因组鉴定中心和基因组数据分析中心。调查员贡献如下:smg,A.V.B.,J.V.P.,R.L.S.,R.A.G.,D.A.W.,M.-C.G., J.D.M., L.D.S and T.J.H. (project leaders); A.V.B., S.M.G. and R.L.S. (writing team); A.L.J., J.V.P., P.J.W., J.L.F., C.L., M.A., O.H., J.G.R., D.T., C.X., S.Wo., F.N., S.So., G.K. and W.K. (bioinformatics/databases); D.K.M., I.H., S.I., C.N., S.M., A.Chr., T.Br., S.Wa., E.N., B.B.G., D.M.M., Y.Q.W., Y.H., L.R.L., H.D., R. E. D., R.S.M. and M.W. (sequencing); N.W., K.S.K., J.V.P., A.-M.P., K.N., N.C., M.G., P.J.W., M.J.C., M.P., J.W., N.K., F.Z., J.D., K.C., C.J.B., L.B.M., D.P., R.E.D., R.D.B., T.Be. and C.K.Y. (mutation, copy number and gene expression analysis); A.L.J., D.K.C., M.D.J., M.P., C.J.S., E.K.C., C.T., A.M.N., E.S.H., V.T.C., L.A.C., E.N., J.S.S., J.L.H., C.T., N.B. and M.Sc. (sample processing and quality control); A.J.G., J.G.K., R.H.H., C.A.I.-D., A.Cho., A.Mai., J.R.E., P.C. and A.S. (pathology assessment); J.W., M.J.C., M.P., C.K.Y. and mutation analysis team (network/pathway analysis and functional data integration); K.M.M., N.A.J., N.G.C., P.A.P.-M., D.J.A., D.A.L., L.F.A.W., A.G.R., D.A.T., R.J.D., I.R., A.V.P., E.A.M., R.L.S., R.H.H. and A.Maw. (functional screens); E.N., A.L.J., J.S.S., A.J.G., J.G.K., N.D.M., A.B., K.E., N.Q.N., N.Z., W.E.F., F.C.B., S.E.H., G.E.A., L.M., L.T., M.Sam., K.B., A.B., D.P., A.P., N.B., R.D.B., R.E.D., C.Y., S.Se., N.O., D.M., M-S.T., P.A.S., G.M.P., S.G., L.D.S., C.A.I.-D., R.D.S., C.L.W., R.A.M., R.T.L., S.B., V.C., M.Sca., C.B., M.A.T., G.T., A.S. and J.R.E. (sample collection and clinical annotation); D.K.C., M.P., C.J.S., E.S.H., J.A.L., R.J.D., A.V.P. and I.R. (preclinical models).

相应的作者

对应到肖恩·m·Grimmond。

相互竞争的利益

作者声明没有竞争的经济利益。

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