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设计矩阵为肠道干细胞和瀑样的文化gydF4y2Ba

自然gydF4y2Ba体积gydF4y2Ba539年gydF4y2Ba,gydF4y2Ba页面gydF4y2Ba560 - 564 (gydF4y2Ba2016年gydF4y2Ba)gydF4y2Ba引用这篇文章gydF4y2Ba

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文摘gydF4y2Ba

上皮瀑样概括的多个方面真正的器官,使其承诺的器官模型发展,功能和疾病gydF4y2Ba1gydF4y2Ba,gydF4y2Ba2gydF4y2Ba,gydF4y2Ba3gydF4y2Ba。然而,瀑样的全部潜力研究和治疗仍未实现,由于矩阵定义糟糕的动物在它们成长gydF4y2Ba4gydF4y2Ba。在这里我们使用了模块化的合成水凝胶网络gydF4y2Ba5gydF4y2Ba,gydF4y2Ba6gydF4y2Ba定义的关键细胞外基质(ECM)参数控制肠道干细胞(ISC)扩张和瀑样的形成,和显示过程的不同阶段需要不同的力学环境和ECM组件。特别是,fibronectin-based附着力满足ISC生存和增殖。矩阵高刚度显著增强ISC扩张yes-associated蛋白1 (YAP)端依赖机制。ISC分化和瀑样的形成,另一方面,需要软矩阵和laminin-based附着力。我们使用这些信息来建立一个充分定义的文化系统,老鼠和人类isc的扩张。我们也生产机械动态矩阵对ISC最初最优扩张和随后宽容和肠道瀑样分化形成,从而创建定义良好的替代动物文化矩阵的老鼠和人类stem-cell-derived瀑样。我们的方法克服了多个当前瀑样文化的局限性,极大地扩大他们在基础和临床研究的适用性。这里介绍的原则可以扩展识别设计师矩阵最优长期文化的其他类型的干细胞和瀑样。gydF4y2Ba

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图1:建立一个合成ISC利基。gydF4y2Ba
图2:矩阵力学性能控制ISC扩散。gydF4y2Ba
图3:ISC蛋白水解活性影响细胞增殖,形态和命运。gydF4y2Ba
图4:肠道内瀑样形成良好定义的矩阵。gydF4y2Ba

引用gydF4y2Ba

  1. 聪明的,h .建模发展同瀑样和疾病。gydF4y2Ba细胞gydF4y2Ba165年gydF4y2Ba1586 - 1597 (2016)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  2. 兰开斯特·m·a·& Knoblich j . a .器官形成一道菜:建模使用瀑样技术发展和疾病。gydF4y2Ba科学gydF4y2Ba345年gydF4y2Ba1247125 (2014)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  3. Sasai, y Cytosystems动态自组织的组织架构。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba493年gydF4y2Ba318 - 326 (2013)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  4. Fatehullah,。,Tan, S. H. & Barker, N. Organoids as an在体外gydF4y2Ba人类的发展模式和疾病。gydF4y2BaNat,细胞生物。gydF4y2Ba18gydF4y2Ba246 - 254 (2016)gydF4y2Ba

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  5. Lutolf, m . P。,Gilbert, P. M. & Blau, H. M. Designing materials to direct stem-cell fate.自然gydF4y2Ba462年gydF4y2Ba433 - 441 (2009)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  6. Ranga, et al。3 d利基系统性分析微阵列的细胞命运。gydF4y2BaCommun Nat。gydF4y2Ba5gydF4y2Ba4324 (2014)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  7. 佐藤,t &聪明,h .自组织mini-guts从单个肠道干细胞:机制和应用程序。gydF4y2Ba科学gydF4y2Ba340年gydF4y2Ba1190 - 1194 (2013)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  8. 佐藤,t . et al .单一Lgr5就干细胞构建crypt-villus结构gydF4y2Ba在体外gydF4y2Ba间充质利基。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba459年gydF4y2Ba262 - 265 (2009)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  9. Dekkers j . f . et al . CFTR功能检测试验用主要囊性纤维化肠道瀑样。gydF4y2BaNat,地中海。gydF4y2Ba19gydF4y2Ba939 - 945 (2013)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  10. Yui, s . et al。功能移植结肠上皮细胞体外从一个成人Lgr5就扩大gydF4y2Ba+gydF4y2Ba干细胞。gydF4y2BaNat,地中海。gydF4y2Ba18gydF4y2Ba618 - 623 (2012)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  11. Kleinman h . k . &马丁,g . r .基底膜基质:基底膜矩阵与生物活性。gydF4y2BaSemin。癌症医学杂志。gydF4y2Ba15gydF4y2Ba378 - 386 (2005)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  12. Jabaji, z . et al . I型胶原蛋白的细胞外基质gydF4y2Ba在体外gydF4y2Ba人类小肠上皮细胞的增长。gydF4y2Ba《公共科学图书馆•综合》gydF4y2Ba9gydF4y2Bae107814 (2014)gydF4y2Ba

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  13. 休斯,c . S。,Postovit, L. M. & Lajoie, G. A. Matrigel: a complex protein mixture required for optimal growth of cell culture.蛋白质组学gydF4y2Ba10gydF4y2Ba1886 - 1890 (2010)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  14. Vukicevic、et al。识别多个活性生长因子的基底膜基底膜基质建议谨慎的解释细胞与细胞外基质成分相关的活动。gydF4y2BaExp。细胞Res。gydF4y2Ba202年gydF4y2Ba1 - 8 (1992)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  15. Seliktar, d设计cell-compatible水凝胶的生物医学应用。gydF4y2Ba科学gydF4y2Ba336年gydF4y2Ba1124 - 1128 (2012)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  16. Ehrbar, m . et al。生物分子形成的水凝胶,通过特有的酶降解反应。gydF4y2Ba《生物高分子gydF4y2Ba8gydF4y2Ba3000 - 3007 (2007)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  17. Benoit, y D。,Groulx, J. F., Gagné, D. & Beaulieu, J. F. RGD-dependent epithelial cell-matrix interactions in the human intestinal crypt.j .钙信号。gydF4y2Ba2012年gydF4y2Ba248759 (2012)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  18. 极点,p . et al。在肠道发育层粘连蛋白的表达变化。gydF4y2Ba发展gydF4y2Ba112年gydF4y2Ba477 - 487 (1991)gydF4y2Ba

    中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  19. Simon-Assmann, p . et al .微分表达层粘连蛋白亚型和α6-β4整合素亚单位在发展中人类和小鼠小肠。gydF4y2BaDev,直流发电机。gydF4y2Ba201年gydF4y2Ba71 - 85 (1994)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  20. 王,f . et al .隔离和表征肠道干细胞的表面标记组合和集落形成试验。gydF4y2Ba胃肠病学gydF4y2Ba145年gydF4y2Ba383 - 395 (2013)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  21. 山本,s . et al .硫酸乙酰肝素在肠道上皮细胞中起关键作用肠道隐窝内稳态通过Wnt /β-catenin信号。gydF4y2Ba点。j .杂志。Gastrointest。肝脏杂志。gydF4y2Ba305年gydF4y2BaG241-G249 (2013)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  22. Fernandez-Sanchez, m . e . et al .机械诱导的肿瘤发生的β-catenin通路在肿瘤生长的压力。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba523年gydF4y2Ba92 - 95 (2015)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  23. Guilak, f . et al .控制干细胞的命运的物理与细胞外基质相互作用。gydF4y2Ba细胞干细胞gydF4y2Ba5gydF4y2Ba17-26 (2009)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  24. Gregorieff,。刘,Y。,Inanlou, M. R., Khomchuk, Y. & Wrana, J. L. Yap-dependent reprogramming of Lgr5+gydF4y2Ba驱动器肠道干细胞再生和癌症。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba526年gydF4y2Ba715 - 718 (2015)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  25. Imajo, M。,Ebisuya, M. & Nishida, E. Dual role of YAP and TAZ in renewal of the intestinal epithelium.Nat,细胞生物。gydF4y2Ba17gydF4y2Ba7-19 (2015)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  26. 阿拉戈纳,m . et al .机械检查点控制多细胞增长通过actin-processing YAP /小胡子监管因素。gydF4y2Ba细胞gydF4y2Ba154年gydF4y2Ba1047 - 1059 (2013)gydF4y2Ba

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  27. 杜邦、s等。YAP /小胡子的转导作用。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba474年gydF4y2Ba179 - 183 (2011)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  28. Sternlicht m . d . & Werb z,基质金属蛋白酶如何调节细胞的行为。gydF4y2Ba为基础。启细胞Dev。杂志。gydF4y2Ba17gydF4y2Ba463 - 516 (2001)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  29. 哈尔德,G。,Dupont, S. & Piccolo, S. Transduction of mechanical and cytoskeletal cues by YAP and TAZ.Nat。启摩尔。细胞杂志。gydF4y2Ba13gydF4y2Ba591 - 600 (2012)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  30. 尼哥底母、gdp和科比,s . j .细胞组织工程应用程序封装在生物可降解水凝胶。gydF4y2Ba组织中。B部分牧师。gydF4y2Ba14gydF4y2Ba149 - 165 (2008)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  31. Matano, m . et al .建模人类肠道瀑样的结直肠癌使用CRISPR-Cas9-mediated工程。gydF4y2BaNat,地中海。gydF4y2Ba21gydF4y2Ba256 - 262 (2015)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  32. 佐藤,t . et al。从人类结肠上皮瀑样的长期扩张,腺瘤、腺癌,巴雷特的上皮。gydF4y2Ba胃肠病学gydF4y2Ba141年gydF4y2Ba1762 - 1772 (2011)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  33. 多布林,a . et al .明星:超速普遍RNA-seq对准器。gydF4y2Ba生物信息学gydF4y2Ba29日gydF4y2Ba15至21 (2013)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  34. 安德斯·S。,Pyl, P. T. & Huber, W. HTSeq—a Python framework to work with high-throughput sequencing data.生物信息学gydF4y2Ba31日gydF4y2Ba166 - 169 (2015)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  35. 王,L。,Wang, S. & Li, W. RSeQC: quality control of RNA-seq experiments.生物信息学gydF4y2Ba28gydF4y2Ba2184 - 2185 (2012)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  36. 李,b &杜威,c . n . RSEM:准确记录从RNA-Seq数据量化有或没有参考基因组。gydF4y2BaBMC生物信息学gydF4y2Ba12gydF4y2Ba323 (2011)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  37. 罗宾逊,m D。,McCarthy, D. J. & Smyth, G. K. edgeR: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data.生物信息学gydF4y2Ba26gydF4y2Ba139 - 140 (2010)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  38. 法律,c W。陈,Y。,Shi, W. & Smyth, G. K. voom: Precision weights unlock linear model analysis tools for RNA-seq read counts.基因组医学杂志。gydF4y2Ba15gydF4y2BaR29 (2014)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  39. 里奇,m . e .等人limma权力分析RNA-sequencing与微阵列研究微分表达式。gydF4y2Ba核酸Res。gydF4y2Ba43gydF4y2Bae47 (2015)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  40. 萨勃拉曼尼亚,等。基因集富集分析:一个基于知识的方法解释全基因组表达谱。gydF4y2BaProc。《科学。美国gydF4y2Ba102年gydF4y2Ba15545 - 15550 (2005)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  41. Sadanandam, A . et al。一个结直肠癌分类系统,将细胞表型和对治疗的反应。gydF4y2BaNat,地中海。gydF4y2Ba19gydF4y2Ba619 - 625 (2013)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  42. Nomizu, m . et al .识别细胞层粘连蛋白的结合位点α1链羧基末端的球状域的系统筛选合成肽。gydF4y2Ba生物。化学。gydF4y2Ba270年gydF4y2Ba20583 - 20590 (1995)gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学术搜索gydF4y2Ba

  43. Nomizu, m . et al .细胞绑定序列在鼠标层粘连蛋白α1链。gydF4y2Ba生物。化学。gydF4y2Ba273年gydF4y2Ba32491 - 32499 (1998)gydF4y2Ba

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下载参考gydF4y2Ba

确认gydF4y2Ba

我们感谢m . Knobloch(苏黎世大学)有益的讨论,答:黑人(EPFL)帮助PEG-alginate混合水凝胶的发展,d . Ossipov(乌普萨拉大学)提供透明质酸,洛桑基因组技术设备(k . Harshman表示)RNA-seq和d Pioletti (EPFL)流变仪使用。净收益EMBO长期支持的博士后奖学金。这项工作也支持资金从洛桑联邦理工(EPFL)。工作在实验室的H.C. NWO转化成人干细胞研究拨款支持的40-41400-98-1108和NWO像格兰特916.15.182。gydF4y2Ba

作者信息gydF4y2Ba

作者和联系gydF4y2Ba

  1. 实验室的干细胞生物工程,生物工程学院,生命科学学院(SV)和工程学院(STI),洛桑联邦理工(EPFL),瑞士洛桑gydF4y2Ba

    Nikolce Gjorevski,安德里亚·Manfrin Sonja生姜,Maiia大肠Bragina &马提亚Lutolf页gydF4y2Ba

  2. Hubrecht研究所和乌得勒支大学医学中心,Uppsalalaan 8, 3584 ct、荷兰乌特勒支gydF4y2Ba

    诺曼(goldman Sachs)和汉斯聪明gydF4y2Ba

  3. 瑞士实验癌症研究所(他),欧洲,瑞士洛桑gydF4y2Ba

    帕洛玛Ordonez-MorangydF4y2Ba

  4. 化学科学与工程学院、学校的基础科学,洛桑联邦理工(EPFL),瑞士洛桑gydF4y2Ba

    马蒂亚斯·p·LutolfgydF4y2Ba

作者gydF4y2Ba
  1. Nikolce GjorevskigydF4y2Ba
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  2. 诺曼·萨克斯gydF4y2Ba
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  3. 安德里亚ManfringydF4y2Ba
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  4. 索尼娅生姜gydF4y2Ba
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  5. Maiia大肠BraginagydF4y2Ba
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  6. 帕洛玛Ordonez-MorangydF4y2Ba
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  7. 汉斯聪明gydF4y2Ba
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  8. 马蒂亚斯·p·LutolfgydF4y2Ba
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贡献gydF4y2Ba

净收益和M.P.L.构思研究,设计实验,分析数据和写的手稿。净收益参与执行和分析所有实验手稿除了涉及人类瀑样。RNA-seq P.O.M.帮助设计实验和分析数据。点执行qPCR基因表达实验和分析数据和产生慢病毒。信号发生器进行流式细胞术分析整合素的表达isc文化基底膜基质和RGD挂钩。M.E.B.设计和特征PEG-alg水凝胶系统,并帮助这些矩阵的isc净收益进行实验。含硝酸钠和H.C.设计实验和分析数据与人类细胞。n。用人类细胞进行实验。gydF4y2Ba

相应的作者gydF4y2Ba

对应到gydF4y2Ba马蒂亚斯·p·LutolfgydF4y2Ba。gydF4y2Ba

道德声明gydF4y2Ba

相互竞争的利益gydF4y2Ba

洛桑联邦理工(M.P.L.和净收益)提起专利申请有关合成凝胶上皮干细胞和瀑样的文化。H.C.是几个专利的发明家瀑样技术。gydF4y2Ba

额外的信息gydF4y2Ba

审核人信息gydF4y2Ba

自然gydF4y2Ba由于l . Li j·米尔斯,另一个匿名的评论家(s)为他们的贡献的同行评审工作。gydF4y2Ba

扩展数据数据和表gydF4y2Ba

扩展数据图1主墓穴文化综合矩阵,描述isc生长在盯住RGD文化有或没有CHIR99021和丙戊酸。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Baisc培养在人工基底膜和普通的挂钩凝胶24 h。gydF4y2BabgydF4y2Ba,ISC殖民地由新鲜分离小鼠肠道隐窝嵌入RGD挂钩。gydF4y2BacgydF4y2Ba相对肠道基因的mRNA水平,由qPCR量化。gydF4y2BadgydF4y2Ba在基底膜基质,ISC殖民地培养自我更新的条件下,但不是盯住凝胶,含有lysozyme-expressing Paneth细胞。gydF4y2BaegydF4y2Ba,Stiffness-dependent殖民地的形成和量化isc培养EGF,‘诺金’,R-spondin Wnt3a。图表显示数据点来自个人gydF4y2BangydF4y2Ba= 3独立实验和手段。酒吧、规模50μm。gydF4y2Ba

源数据gydF4y2Ba

扩展数据图2的影响矩阵控制软化ISC菌落形态,YAP活动和增长。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba海藻酸、力学性能控制和软化挂钩(PEG-alg)混合凝胶通过选择性降解海藻酸的网络。图表显示单个数据点来自3独立准备凝胶。gydF4y2BabgydF4y2Ba第一天菌落的形态控制和软化PEG-alg凝胶。gydF4y2BacgydF4y2Ba,gydF4y2BadgydF4y2Ba在第一天殖民地狂吠的分布控制和软化PEG-alg凝胶(gydF4y2BacgydF4y2Ba)和量化(gydF4y2BadgydF4y2Ba)。gydF4y2BangydF4y2Ba= 28殖民地(控制)gydF4y2BangydF4y2Ba= 31(软化)。数据被表示为均值±s.e.m。gydF4y2BaegydF4y2Ba海藻酸裂解酶治疗不影响殖民地挂钩RGD凝胶的增长。软化PEG-alg凝胶alginate-lyase-mediated消化块殖民地的增长。gydF4y2BafgydF4y2Ba、量化shRNA-mediated击倒的狂吠。图表显示单个数据点来源于两个独立实验和手段。gydF4y2BaggydF4y2Baverteporfin对ISC集落形成的影响,RGD挂钩。图表显示单个数据点来自3独立实验和手段。*gydF4y2BaPgydF4y2Ba< 0.05;* *gydF4y2BaPgydF4y2Ba< 0.01;* * *gydF4y2BaPgydF4y2Ba< 0.01。酒吧、规模50μm。gydF4y2Ba

源数据gydF4y2Ba

扩展数据矩阵图3的降解诱发isc inflammation-like状态。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba、基因集富集分析(GSEA)比较RNA-seq基因表达数据的isc培养降解而非降解矩阵发表基因签名(见方法)。gydF4y2BabgydF4y2Ba、功能注释的明显信号通路调节降解矩阵(细节和统计所示gydF4y2Ba扩展数据表2gydF4y2Ba,gydF4y2Ba3gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba

扩展数据图4比较瀑样人工基底膜形成和YAP活动和RGD挂钩。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba,瀑样的形成并不发生在合成RGD矩阵挂钩。ISC殖民地培养非降解(N-DG挂钩)和降解(挂钩DG)挂钩RGD矩阵,有或没有GM6001 4 d,随后瀑样形成条件下培养的2 d。gydF4y2BabgydF4y2Ba期间,时间进程分析形态学和Lgr5-eGFP表达瀑样的形成。ISC殖民地形成于基底膜基质和水凝胶挂钩监控48 h,之后切换到分化和瀑样的形成条件。gydF4y2BacgydF4y2Ba、本地化每天1和4的YAP ISC殖民地成立于300年宾夕法尼亚州和1.3 kPa RGD凝胶挂钩。gydF4y2BadgydF4y2Ba、量化的核易位YAP作为时间的函数在300年Pa, 1.3 kPa挂钩RGD和基底膜基质。数据显示为意味着±s.e.m。评估YAP核易位的程度,gydF4y2BangydF4y2Ba= 21(第一天,1.3 kPa);27日(第二天,1.3 kPa);22日(第三天,1.3 kPa);22日(第四天,1.3 kPa);27日(第一天,300 Pa);6(第二天,300 Pa);23日(第三天,300 Pa);22日(第四天,300 Pa);30日(第一天,人工基底膜);28日(第二天,人工基底膜); 30 (day 3, Matrigel); 30 (day 4, Matrigel). *PgydF4y2Ba< 0.05;* *gydF4y2BaPgydF4y2Ba< 0.01;* * *gydF4y2BaPgydF4y2Ba< 0.001。酒吧、规模50μm。gydF4y2Ba

源数据gydF4y2Ba

扩展数据图5 laminin-derived肽对瀑样形成的影响,和人类瀑样扩张RGD挂钩。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba,效果不同的层粘连蛋白- 111衍生序列在肠道瀑样可行性。gydF4y2BabgydF4y2Ba肠道瀑样生长在基底膜基质的形态,平原或PEG-AG73凝胶挂钩。gydF4y2BacgydF4y2Ba,AG73-conjugated矩阵显著提高肠道瀑样的增长挂钩。gydF4y2BadgydF4y2Ba,AG73对肠道瀑样生存和增长的影响浓度。gydF4y2BaegydF4y2Ba、量化的肠道瀑样可行性在基底膜基质,TG PEG-AG73和太PEG-AG73。gydF4y2BafgydF4y2Ba在肠道,形态和Lgr5-eGFP表达式瀑样生长在基底膜基质和太PEG-AG73凝胶。gydF4y2BaggydF4y2Ba、量化Lgr5-eGFP表达在基底膜基质肠道瀑样扩张,TG PEG-AG73和太PEG-AG73。gydF4y2BahgydF4y2Ba,建立apicobasal极性和Paneth(溶菌酶)细胞在瀑样生长在MT PEG-AG73。gydF4y2Ba我gydF4y2BaAG73肽不能够支持差异化和瀑样形成ISC殖民地,而长篇层粘连蛋白- 111。gydF4y2BajgydF4y2Ba、量化的核易位YAP作为时间的函数在细胞内cultiured机械稳定和软化凝胶。数据显示为意味着±s.e.m。评估YAP核易位的程度,gydF4y2BangydF4y2Ba= 21 (sPEG第一天,100%),27 (sPEG第二天,100%),22 (sPEG 3天,100%),22 (sPEG第四天,100%),30 (dPEG第一天,75%),30 (dPEG第二天,75%),30 (dPEG 3天,75%),30 (dPEG第四天,75%)殖民地进行分析。gydF4y2BakgydF4y2Ba,gydF4y2BalgydF4y2Ba相衬的图片(gydF4y2BakgydF4y2Ba)和Ki67表达式(gydF4y2BalgydF4y2Ba)的人类ISC殖民地和patient-derived大肠癌瀑样生长在RGD挂钩。图表显示数据点来自个人gydF4y2BangydF4y2Ba= 2 (gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba),gydF4y2BangydF4y2Ba= 3 (gydF4y2BacgydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2BaegydF4y2Ba,gydF4y2BaggydF4y2Ba)独立实验和手段。*gydF4y2BaPgydF4y2Ba< 0.05;* *gydF4y2BaPgydF4y2Ba< 0.01;* * *gydF4y2BaPgydF4y2Ba< 0.001。酒吧、规模50μm。gydF4y2Ba

源数据gydF4y2Ba

扩展数据表1引物用于qPCR肠道基因表达分析gydF4y2Ba
全尺寸表gydF4y2Ba
扩展数据表2功能注释的基因显著调节降解挂钩RGD矩阵和非降解挂钩RGD矩阵,根据细胞的途径gydF4y2Ba
全尺寸表gydF4y2Ba
扩展数据表3的基因功能注释显著调节降解挂钩RGD矩阵和非降解挂钩RGD矩阵,细胞过程gydF4y2Ba
全尺寸表gydF4y2Ba
扩展数据表4 Laminin-derived肽gydF4y2Ba
全尺寸表gydF4y2Ba

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Gjorevski, N。(goldman Sachs)、N。,Manfrin, A.et al。gydF4y2Ba设计矩阵为肠道干细胞和瀑样的文化。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba539年gydF4y2Ba,560 - 564 (2016)。https://doi.org/10.1038/nature20168gydF4y2Ba

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