摘要
为了确定中国人群中乙型肝炎病毒(HBV)相关肝细胞癌(HCC)的遗传易感性位点，我们在2514例慢性HBV携带者(1161例HCC病例和1353例对照组)中进行了全基因组关联研究(GWAS)，随后在6个独立慢性HBV携带者人群(4319例病例和4966例对照组)中进行了2期验证。联合分析显示，HCC风险与两个独立的基因座显著相关:rs7574865 atSTAT4，P元= 2.48 × 10−10，比值比(OR) = 1.21;和rs9275319在HLA-DQ，P元= 2.72 × 10−17，或= 1.49。rs7574865位点的风险等位基因G与低mRNA水平显著相关STAT4155例hbv相关HCC患者的肝细胞癌组织和非肿瘤组织中(P趋势分别为0.0008和0.0002)。我们还发现mRNA的表达明显降低STAT4与相邻配对的非肿瘤组织相比(P= 2.33 × 10−14）.
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确认
我们感谢所有参与这项研究的受试者。同时，我们也感谢上海交通大学Bio-X研究所的石勇和何磊对中国典型人口控制学科数据分析的帮助，以及金磊、钟勇、h - h。小王和W.-Y。复旦大学生命科学学院的颜晓燕教授和h . b。武汉大学生命科学学院的舒教授对本研究提出了建议。本研究获得国家自然科学基金创新研究小组项目(30024001 / L.Y.)、国家科技重点专项(2013ZX10002010、2008ZX10002-020 / L.Y.)、上海市科委项目(L.Y.)、国家自然科学基金(31071193 / L.Y.、31100895 / d.k.j)、遗传工程国家重点实验室主任基金(L.Y.)、x - j基金资助。曲和北京长安资本(致L.Y.)，基金由s.j。江苏颜天英S.T.组(授予L.Y.)，张孔氏学者计划教育部基金(授予J.L.和q.y)，复旦大学华山医院校级科研经费(授予j.x)，复旦大学复旦- vari遗传流行病学中心校级科研经费(授予j.x)。国家自然科学基金项目(30800946)、国家优秀博士学位论文作者基金项目(201081)、新世纪高校优秀人才计划项目(NCET-10-0178)、江苏省高校重点学科建设项目(hs.s)资助。
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贡献
L.Y.和j.x设计并指导了这项研究。d - k.j进行全面的项目管理。D.-K.J X.-P.M。,H.-X.H D.W。L.-S.T, B.P, T.-T.L。p .周B.W. H.-X.G.S.-Y。管理的DNA样本。张平,S.L.Z, D.-K.J X.-P.M.和H.-X.H.基因分型。j.s.， Z.W, d.k.j, H.Y.和Y.Y.S.进行了数据分析。w.j.， d.k.j.， x.p.m.和H.C.做了功能分析。d - k.j, Z.W, j.x和L.Y.总结了结果。d - k - j, j。x。j。s。写了手稿。来自不同合作小组的作者在各自地区进行病例对照系列汇编并收集数据和样本:上海的g.c.、J.Y.和张宏伟，南京的刘莹、h.s.、L.L.和z.h; D.L., C.W., J.C. and K.Z. in Beijing; Y.-Z.G. in Suzhou; W.-H.R. and Y.P. in Luoyang; X.-D.L. and Y.-F.Z. in Baise; G.Z., Hongxing Zhang, Y.Z. and X.G. in Fusui; and T.-Y.C. and P.-X.L. in Qidong. The following authors collected partial control subjects in their respective regions: Z.M., Y.G. and A.T. in Guangxi Province. The following authors provided genotype data of typical Chinese population control subjects: X.-J.Z., L.-D.S., X.-B.Z., Y. Li, X.-O.S., W.Z., J.-R.L., Y.X., R.S., F.L., X.L, S.T., Q.D. and J.X. The following authors collected tissue samples of HCC cases: T.-Y.C. and N.-J.W. (major part); L.-X.Q., J.F. and Y.-K.L. (minor part). L.Y., J.X., J.L., Q.Y., D.-K.J. and H.S. obtained funding for the study.
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江,DK。，Sun, J., Cao, G.et al。基因变异的STAT4和HLA-DQ基因授予乙型肝炎病毒相关肝细胞癌的风险。Nat麝猫45, 72 - 75(2013)。https://doi.org/10.1038/ng.2483
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