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全基因组协会IL28B对聚乙二醇interferon-α和利巴韦林治疗慢性丙型肝炎

文摘

推荐的治疗慢性丙型肝炎患者,聚乙二醇interferon-α(PEG-IFN-α)联合利巴韦林(各类单体),不提供持续病毒学应答(SVR)在所有的病人。我们报告一个全基因组关联研究(GWAS)为null病毒学应答(极)治疗患者丙型肝炎病毒(HCV)基因型1在一个日本人。我们发现两个snp基因附近IL28B19号染色体与极密切相关(rs12980275,P= 1.93×10−13rs8099917, 3.11×10−15)。我们复制这些联系在一个独立队列(的总和P值,2.84×10−27(OR = 17.7;95% CI = 10.0 - -31.3)和2.68×10−32(OR = 27.1;95% CI = 14.6 - -50.3),分别)。极相比,这些单核苷酸多态性也与SVR (rs12980275,P= 3.99×10−24rs8099917,P= 1.11×10−27)。在进一步细映射地区,七个snp (rs8105790、rs11881222 rs8103142, rs28416813, rs4803219, rs8099917和rs7248668)位于IL28B区域显示最重要的关联(P= 5.52×10−28-2.68×10−32;或= 22.3 - -27.1)。实时定量PCR检测外周血单核细胞显示低IL28B个人带着轻微的等位基因表达水平(P= 0.015)。

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图1:全基因组关联结果与PEG-IFN-α/各类单体治疗丙肝患者在142年,日本(78极和64 VR样本)。
图2:基因组结构,P价值和关联分析和LD地图或情节IL28BIL28A(对应。19,nucleotide positions 44421319–44461718; build 35).
图3:量化的IL28信使rna表达。

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确认

这项研究是由来自卫生部的补助金,日本的劳动力,和福利(段h19 - kannen - 013)。这项研究是基于15多中心医院在日本北海道地区(北海道大学医院),日本关东地区(埼玉县大学医院;Konodai医院;武藏野红十字医院;东京医疗和牙科大学医院),Koshin区(信州大学医院;金泽大学医院),东海区域(城市名古屋大学医院),近畿地区(京都全州大学医学医院;大阪国立医院组织国家医院;兵库县医学院医院)和Chugoku /四国地区(各级大学医院;特别大学医院;山口大学医院; Kawasaki Medical College Hospital). We thank Y. Uehara-Shibata, Y. Ogasawara, Y. Ishibashi and M. Yamaoka-Sageshima (Tokyo University) for technical assistance; A. Matsumoto (Shinshu), K. Naiki (Saitama), K. Nishimura (Kyoto), H. Enomoto (Hyogo), K. Oyama (Tottori) and the Ochanomizu Liver Conference Study Group for collecting samples; M. Watanabe (Tokyo Medical and Dental University), S. Kaneko (Kanazawa University) and M. Onji (Ehime University) for their advice throughout the study; and H. Ito (Aichi Cancer Center) for conducting statistical analyses.

作者信息

作者和联系

作者

贡献

研究设计和讨论:Y.T.,N.N.新墨西哥州,,K.T.M.M.;样本收集:Y.T.纳瑞雅南K.M.,n。,M.N.纳瑞雅南,K.H.,萨达姆政权,Y.I.,。,E.T.,克里,Y.M.,M.H.、可靠,Y.H.,S.N.,安全火花型,M.I.,K.I.,K.Y.,F.S.,N.I.; genotyping: N.N.; statistical analysis: N.N., A.K., K.I.; quantitative RT-PCR: M.S.; manuscript writing: Y.T., N.N., K.T., M.M.

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田中,Y。,Nishida, N。,Sugiyama, M.et al。全基因组协会IL28B对聚乙二醇interferon-α和利巴韦林治疗慢性丙型肝炎。Nat麝猫41,1105 - 1109 (2009)。https://doi.org/10.1038/ng.449

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