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全基因组关联识别多个溃疡性结肠炎易感性位点

一个勘误表这篇文章在2011年发表于3月29日

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溃疡性结肠炎是一种慢性、复发性炎症状态的胃肠道与一个复杂的遗传和环境病因。为了确定遗传变异溃疡性结肠炎的潜在风险,我们提出两种截然不同的溃疡性结肠炎的全基因组关联研究及其与先前发表的共同分析扫描1组成,总体来说,2693溃疡性结肠炎患者和6791名对照组。59来自14个独立的单核苷酸多态性位点达到一个协会的意义P< 10−5。7这些位点超过全基因组意义(P< 5×10−8)。测试一个独立后的2009例溃疡性结肠炎和1580控制,我们确定了13个位点,与溃疡性结肠炎(显著相关P< 5×10−8),包括免疫球蛋白受体基因FCGR2A5 p15 2 p16和ORMDL3(orosomucoid1-like 3)。我们之前确认与14发现溃疡性结肠炎易感性位点,并承认克罗恩病位点的分析表明,大约一半的已知的克罗恩病协会与溃疡性结肠炎共享。这些数据表明大约30个基因座在溃疡性结肠炎,从而了解疾病的发病机理。

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  • 2011年3月29日

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确认

这项研究的部分支持由美国国家研究资源中心(NCRR)授予西奈M01-RR00425通用型研究中心核心;美国国立卫生研究院/趋势,格兰特P01-DK046763;格兰特DK063491糖尿病内分泌学研究中心;西奈医疗中心炎症性肠病的研究基金。额外的资金捐款DK76984 (M.C.D.)和DK084554 (M.C.D.和D.P.B.M.)。心血管健康研究本文研究报告支持通过合同编号N01 - hc - 85079 N01 - hc - 85086, N01 - hc - 35129, N01 hc - 15103, N01 hc - 55222, N01 - hc - 75150和N01 - hc - 45133;格兰特数字U01 HL080295和R01 HL087652来自美国国家心脏、肺和血液研究所;和额外的贡献来自美国国家神经疾病和中风研究所。主要的心血管健康研究的完整列表可以发现调查人员和机构http://www.chs-nhlbi.org/pi.htm。A.G.支持美国的克罗恩氏和结肠炎基金会。R.J.X. M.J.D. DK83756赠款支持,DK086502和DK043351 (NIDDK)。

NIDDK IBD遗传学财团是由下列补助:DK062431 (S.R.B.) DK062422 (J.H.C.) DK062420 (R.H.D.) DK062432 (J.D.R.) DK062423 (M.S.S.) DK062413 (D.P.B.M.)和DK062429 (J.H.C.)。J.H.C.也是由Bohmfalk基金用于医学研究,布罗威康医疗基金会和美国的克罗恩氏和结肠炎基金会。J.D.R.也资助来自美国国家过敏症和传染病研究所(AI065687;AI067152)和美国国家糖尿病、消化和肾脏疾病研究所(DK064869)。

活动在瑞典被瑞典医学社会支持,为您的基金会,卡罗林斯卡医学院,瑞典国家计划IBD遗传学、瑞典IBD组织瑞典医学研究理事会,索德伯格基金会和瑞典癌症基金会。基因型和基因数据分析支持提供的新加坡国家癌症中心,新加坡总医院和新加坡年基金会(……)和科学技术和研究机构(* *),新加坡(M.L.H.和硕士)。pcr和DNA处理在新加坡进行的基因组研究所W.Y. Meah,株式会社亨,到了(音),x,拉贾拉姆,d .晒黑和黄h。我们感谢资助者的风湿性关节炎的流行病学调查和调查人员提供从瑞典健康个体基因型数据。

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贡献

D.P.B.M.,M.J.D.,R.J.X.,J.D.R.,J.H.C.,打开,R.H.D. and M.S. participated in the study design and conception. D.P.B.M., A.G., M.J.D., R.J.X., J.D.R. and M.S. wrote the manuscript with contributions from R.H.D. and J.I.R. D.P.B.M., L.T., K.D.T., C.Li, C.B., P.R.F., M.C., M.D., J.H., M.L.H., M.L., L.P., A.A., E.C., A.L., O.P., E.-J.B., C.D., D.W.H., D.J.d.J., P.C.S., R.K.W., Y.S., M.S.S., J.H.C., S.R.B., L.P.S., R.H.D., M.C.D., N.L.G., T.H., A.I., G.Y.M., D.S.S., E.A.V., S.R.T., V.A., C.W. and S.P. performed patient diagnosis, patient enrollment and collection of clinical data. Replication genotyping was performed by C. Lagacé, C.R.S. and C.B. in the laboratory of J.D.R. Expression analysis, immunohistochemistry and shRNA studies were designed by A.G. and R.J.X. and performed by C. Li and A.G. M.J.D., J.E., B.M.N., K.R., J.W., J.D.R., P.G., T.G. and R.T.H.O. provided statistical analyses. All authors contributed to the final paper.

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国家糖尿病、消化和肾脏疾病研究所(NIDDK)。

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麦戈文,D。Gardet,。,Törkvist, L.et al。全基因组关联识别多个溃疡性结肠炎易感性位点。Nat麝猫42,332 - 337 (2010)。https://doi.org/10.1038/ng.549

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