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的变化DEPDC5在慢性丙型肝炎病毒携带者中,基因座与肝细胞癌进展相关

摘要

慢性病毒性肝炎是发展为肝细胞癌(HCC)最重要的危险因素。为了确定慢性丙型肝炎病毒(HCV)患者进展为HCC的遗传危险因素,我们分析了212名日本慢性HCV合并HCC患者和765名慢性HCV无HCC患者的467,538个snp。我们发现了一个内含子SNPDEPDC5染色体22上的位点与HCC风险相关,并使用独立病例-对照人群(710例和1625例对照组)证实了相关性。当我们分别和一起分析这些阶段时,这种关联是非常显著的(rs1012068,P结合= 1.27 × 10−13,优势比= 1.75)。在对性别、年龄和血小板计数进行调整后,相关性的显著性水平进一步提高(P= 1.35 × 10−14,优势比= 1.96)。我们的研究结果表明,常见的变异DEPDC5日本慢性HCV感染个体中基因座对HCC易感性的影响。

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图1:病例-对照关联图和连锁不平衡(LD)图和基因组结构DEPDC5染色体22q12.2-3。

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确认

作者感谢同意参与本研究的受试者。我们也感谢Toranomon医院,札幌Kosei总医院,广岛大学医院和广岛肝脏研究小组的临床样本收集团队成员。我们感谢T. Yokogi, Y. Hayashida和K. Izumoto的技术援助,J. Sakamiya的文书援助,以及RIKEN基因组医学中心和广岛大学的其他成员在本研究的各个方面提供的帮助。

作者信息

作者及隶属关系

作者

贡献

K.C.构思了这项研究。d.m., H.O.和K.C.设计了这项研究。D.M.和H.O.进行了基因分型。D.M, H.O, C.N.H.和K.C.写了手稿。t.m., t.t., M.K.和N.K.在全基因组阶段进行了数据分析。H. Abe和T.Y.进行了功能分析。H. Aikata, K.I, h.k., J.T.和K.C.管理DNA样本。d.m., H.O.和K.C.总结了整个结果。y.n., N.K.和K.C.获得了这项研究的资金。

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对应到Kazuaki Chayama

道德声明

相互竞争的利益

作者声明没有相互竞争的经济利益。

补充信息

补充文字及图表

补充图1-6和补充表1-12。(PDF 820kb)

权利和权限

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关于本文

引用本文

美琪,D,大池,H,海耶斯,C。et al。的变化DEPDC5在慢性丙型肝炎病毒携带者中,基因座与肝细胞癌进展相关。Nat麝猫43, 797-800(2011)。https://doi.org/10.1038/ng.876

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  • DOIhttps://doi.org/10.1038/ng.876

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