摘要
慢性病毒性肝炎是发展为肝细胞癌(HCC)最重要的危险因素。为了确定慢性丙型肝炎病毒(HCV)患者进展为HCC的遗传危险因素,我们分析了212名日本慢性HCV合并HCC患者和765名慢性HCV无HCC患者的467,538个snp。我们发现了一个内含子SNPDEPDC5染色体22上的位点与HCC风险相关,并使用独立病例-对照人群(710例和1625例对照组)证实了相关性。当我们分别和一起分析这些阶段时,这种关联是非常显著的(rs1012068,P结合= 1.27 × 10−13,优势比= 1.75)。在对性别、年龄和血小板计数进行调整后,相关性的显著性水平进一步提高(P= 1.35 × 10−14,优势比= 1.96)。我们的研究结果表明,常见的变异DEPDC5日本慢性HCV感染个体中基因座对HCC易感性的影响。
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参考文献
杨,J.D.和罗伯茨,L.R.肝细胞癌:全球视野。胃肠醇。乙醇。7, 448-458(2010)。
巴雷拉,J.M.等人。急性自限性丙型肝炎输血后持续丙型肝炎病毒血症。肝脏病学21, 639-644(1995)。
Welzel, T.M.等人。丙肝抗病毒长期治疗肝硬化试验中α干扰素通路基因变异及对聚乙二醇化α干扰素加利巴韦林治疗慢性丙肝病毒感染的反应肝脏病学49, 1847-1858(2009)。
吉田,H.等。干扰素治疗可降低肝细胞癌的风险。安。实习生。地中海。131, 174-181(1999)。
清泽,K.等。肝细胞癌:日本的最新趋势。胃肠病学127, s17-s26(2004)。
陶拉,N.等人。丙型肝炎病毒相关肝细胞癌患者的老龄化:日本的长期趋势肿瘤防治杂志。代表。16, 837-843(2006)。
Miki, D.等。老年丙型肝炎病毒相关肝细胞癌的临床病理特征j .杂志。43, 550-557(2008)。
高田,A.等。在HCV感染的老年慢性肝病患者中,HCC甚至在早期就会发生。Int。J. Mol. Med。26, 249-256(2010)。
袁敏芳,侯俊林,李志强,李志强。亚太地区肝细胞癌的研究进展。j .杂志。乙醇。24, 346-353(2009)。
曼斯,M.P.等人。聚乙二醇干扰素α -2b加利巴韦林与干扰素α -2b加利巴韦林初步治疗慢性丙型肝炎:一项随机试验《柳叶刀》358, 958-965(2001)。
张,H.等。全基因组关联研究确定1p36.22为慢性乙型肝炎病毒携带者肝细胞癌新的易感位点。Nat,麝猫。42, 755-758(2010)。
Ura, S.等。乙型肝炎和丙型肝炎之间差异microRNA表达导致疾病发展为肝细胞癌肝脏病学49, 1098-1112(2009)。
Pe'er, I., Yelensky, R., Altshuler, D. & Daly, M.J.对几乎所有常见变异全基因组关联研究的多重测试负担的估计。麝猫。论文。32, 381-385(2008)。
山内,T.等。在日本人群中进行的一项全基因组关联研究确定了UBE2E2和C2CD4A-C2CD4B的2型糖尿病易感位点。Nat,麝猫。42, 864-868(2010)。
小野,等人。血小板计数反映慢性丙型肝炎的分期。乙醇。Res。15, 192-200(1999)。
Poynard, T. & Bedossa, P.年龄和血小板计数:预测丙型肝炎病毒抗体患者存在组织学病变的简单指标。J.病毒肝。4, 199-208(1997)。
Forns, x等人。用一个简单的预测模型鉴别无肝纤维化的慢性丙型肝炎患者。肝脏病学36, 986-992(2002)。
Wai, ct等。一个简单的非侵入性指标可以预测慢性丙型肝炎患者明显的纤维化和肝硬化。肝脏病学38, 518-526(2003)。
波尔等人。血清转氨酶水平和血小板计数是慢性丙型肝炎病毒感染纤维化程度的预测因素点。j .杂志。96, 3142-3146(2001)。
Seng, T.J.等。星形细胞肿瘤中复杂染色体22重排的微卫星和染色体22瓦路径阵列分析。Chromosom基因。癌症43, 181-193(2005)。
卡拉特,A.等人。pleckstrin DEP结构域的构象稳定性研究:结构域边界的定义。Biochim。Biophys。学报1385, 157-164(1998)。
原田,Y.等。细胞透性肽DEPDC1-ZNF224干扰膀胱癌细胞的转录抑制和致癌性。癌症Res。70, 5829-5839(2010)。
Kanehira等人。DEPDC1 (DEP结构域含1)上调参与膀胱癌的发生。致癌基因26, 6448-6455(2007)。
原发性肝癌临床病理研究的一般规律。日本肝癌研究小组第三版英语。(金原株式会社,东京,日本,2010)。
Yamaguchi-Kabata, Y.等。日本人口结构,基于来自7003个个体的SNP基因型与其他种族群体的比较:对基于人群的关联研究的影响。点。j .的嗡嗡声。麝猫。83, 445-456(2008)。
Ohnishi, Y.等人。用于全基因组关联研究的高通量SNP分型系统。j .的嗡嗡声。麝猫。46, 471-477(2001)。
一种用于检测比例线性趋势的计算样本量的简单近似。生物识别技术43, 701-705(1987)。
马戈林,B.H.比例趋势试验。在统计科学百科全书.(eds。Klotz, S. & Johnson, N.L.) 334-336 (John Wiley & Sons, Inc., New York, New York, USA, 1988)。
Menashe, I., Rosenberg, P.S. & Chen, B.E. PGA:病例-对照遗传关联分析的幂计算器。BMC麝猫。9, 36(2008)。
Purcell, S.等人。PLINK:全基因组关联和基于人群的连锁分析工具集。点。j .的嗡嗡声。麝猫。81, 559-575(2007)。
巴雷特,j.c.,弗莱,B.,马勒,J. &戴利,M.J.单倍型图:LD和单倍型图的分析和可视化。生物信息学21, 263-265(2005)。
确认
作者感谢同意参与本研究的受试者。我们也感谢Toranomon医院,札幌Kosei总医院,广岛大学医院和广岛肝脏研究小组的临床样本收集团队成员。我们感谢T. Yokogi, Y. Hayashida和K. Izumoto的技术援助,J. Sakamiya的文书援助,以及RIKEN基因组医学中心和广岛大学的其他成员在本研究的各个方面提供的帮助。
作者信息
作者及隶属关系
贡献
K.C.构思了这项研究。d.m., H.O.和K.C.设计了这项研究。D.M.和H.O.进行了基因分型。D.M, H.O, C.N.H.和K.C.写了手稿。t.m., t.t., M.K.和N.K.在全基因组阶段进行了数据分析。H. Abe和T.Y.进行了功能分析。H. Aikata, K.I, h.k., J.T.和K.C.管理DNA样本。d.m., H.O.和K.C.总结了整个结果。y.n., N.K.和K.C.获得了这项研究的资金。
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相互竞争的利益
作者声明没有相互竞争的经济利益。
补充信息
补充文字及图表
补充图1-6和补充表1-12。(PDF 820kb)
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关于本文
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美琪,D,大池,H,海耶斯,C。et al。的变化DEPDC5在慢性丙型肝炎病毒携带者中,基因座与肝细胞癌进展相关。Nat麝猫43, 797-800(2011)。https://doi.org/10.1038/ng.876
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DOI:https://doi.org/10.1038/ng.876
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