摘要
宿主和肠道菌群之间复杂的相互作用控制着肠道内稳态，但人们对其了解甚少。本研究揭示了肠道菌群与caspase募集结构域家族成员9 (CARD9)，是炎症性肠病(IBD)的易感基因，在对抗微生物的免疫反应中起作用。CARD9通过促进白细胞介素(IL)-22的产生，促进结肠炎的恢复Card9−−/老鼠更容易得结肠炎。微生物群发生了变化Card9−−/小鼠，并从转移菌群Card9−−/对于野生型，无菌接受者增加了他们对结肠炎的易感性。的微生物群Card9−−/小鼠不能将色氨酸代谢成作为芳基烃受体(AHR)配体的代谢物。小鼠接种3乳酸菌能够代谢色氨酸或用AHR激动剂处理的菌株。在IBD患者的菌群中也观察到AHR配体的减少，特别是在IBD患者CARD9与IBD相关的风险等位基因我们的研究结果表明，宿主基因影响肠道菌群的组成和功能，改变微生物代谢物的产生和肠道炎症。
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确认
我们感谢ANAXEM无菌平台的成员、INRA动物设施的成员和圣安东尼医院动物设施的T. Ledent在老鼠护理方面提供的协助;来自CRB GADIE核心设施的M. Moroldo和J. Lecardonnel，为执行微阵列分析提供技术援助;S. Dumont在组织和免疫化学方面提供技术帮助;C. Aubry、N.M. Breyner、F. Chain、S. Le Guin、C. Cherbuy、N. Lapaque和D. Skurnik进行了富有成效的讨论和技术帮助。我们也感谢E. Drouet和Unité de Recherche Clinique de l'Est paris临床研究助理团队在获得IBD患者样本方面的帮助。Ido1−−/而且Il22−−/小鼠分别由S. Taleb (INSERM Unit 970)和B. Ryffel (CNRS, UMR7355)提供。h1l1.1 . c2细胞系由M.S.丹尼森(加州大学戴维斯分校)提供。资金由2012年ATIP-Avenir Equipe (H.S.)、2013年INSERM-ITMO SP (H.S.)和2012年ECCO赠款(H.S.)提供。
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贡献
b.l.， M.L.R和H.S.构思并设计了这项研究，进行了数据分析，并撰写了手稿;B.L.设计和进行了所有实验，除非另有说明;V.L.设计并实施了AHR活性实验;g.d.c.、c.b.、s.j.、t.w.h.、J.M.N、l.b Brot、f.m.和m.l.m.提供了技术帮助在体外而且在活的有机体内实验;hp - p.p.进行了生物信息学研究并分析了微阵列实验;j.m.l.进行并分析了高效液相色谱实验;S.T.提供了材料Ido1−−/并对实验结果进行了讨论;A.C.-M。b。r。提供了来自Il22−−/并对实验结果进行了讨论;临睡时,李鸿源I.N.-L。，A.B., L. Beaugerie, and P.S. provided data and samples for the patients with IBD; B.L., M.L.R., R.J.X., P.L., and H.S. discussed the experiments and results.
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喇嘛，B，理查德，M，勒杜克，V。et al。CARD9通过改变肠道菌群的色氨酸代谢为芳基烃受体配体而影响结肠炎。Nat地中海22, 598 - 605(2016)。https://doi.org/10.1038/nm.4102
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