文摘
我们描述一个方法,filter-aided样品制备(FASP),为胶液的优点相结合,为大规模spectrometry-based蛋白质组学在溶液中消化。我们在十二烷基硫酸钠完全可溶性蛋白质组,然后我们交换的尿素标准过滤设备。肽筛选了消化后过滤器是纯粹的,允许单道分析细胞器和蛋白质组的前所未有的深度报道。
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确认
我们感谢美国任生物信息学支持。这项工作得到了马普学会科学的进步,高通量表观遗传在染色质监管组织(英雄),泛素和Ubiquitin-like修饰符在细胞调节作用(卢比孔河)第六框架授予欧盟委员会和慕尼黑中心的综合蛋白质科学(CIPSM)。
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补充信息
补充文本和数字
补充图1 - 11、补充表1 - 4、补充协议(PDF 1745 kb)
补充数据1
分析总海拉细胞溶解产物(XLS 6405 kb)
补充数据2
总溶解产物分析海拉细胞分级能源论坛的合作。(XLS 8640 kb)
补充数据3
一只老鼠大脑的总溶解产物的分析。(XLS 2253 kb)
补充数据4
分析小鼠肝脏的总溶解产物。(XLS 3026 kb)
补充数据5
总溶解产物分析海拉细胞消化endoproteinases不同。(XLS 10876 kb)
补充数据6
分析海拉细胞消化在不同条件下的总溶解产物。(XLS 6731 kb)
补充数据7
总溶解产物分析线粒体分离小鼠肝脏。(XLS 236 kb)
权利和权限
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Wiśniewski, J。Zougman,。Nagaraj, N。et al。通用的蛋白质组分析的样品制备方法。Nat方法6,359 - 362 (2009)。https://doi.org/10.1038/nmeth.1322
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DOI:https://doi.org/10.1038/nmeth.1322
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