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放大的标志基因序列可用于理解微生物群落结构,但是他们受到高水平的测序和放大工件。UPARSE管道运营报告分类单元(OTU)序列≤1%错误的基地在人工微生物群落的测试中,相比之下,> 3%错误的基地的常见的其他方法。提高精度导致更少的辣子鸡,不断接近预期的一个社区的物种数量。
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确认
作者感谢n.a Bokulich J.G. Caporaso和d . Gevers有用的讨论和提供正式出版前的数据;警察局与mothur城堡寻求帮助;c .海棠与AmpliconNoise寻求帮助;l . Dethlefsen和克里休斯有用的讨论;美国Yourstone手稿草案的一个深刻的批判;斯隆基金会和微生物学的建筑环境项目(,马丁·索金说海洋生物实验室)提供计算资源。
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R.C.E.研究的构思,进行分析和写的手稿。
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作者声明没有竞争的经济利益。
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埃德加,r . UPARSE:高精度OTU从微生物扩增子序列读取。Nat方法10,996 - 998 (2013)。https://doi.org/10.1038/nmeth.2604
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DOI:https://doi.org/10.1038/nmeth.2604
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