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一种新的冠状病毒与人类呼吸道疾病在中国

一个作者修正这篇文章发表于2020年4月02

这篇文章被更新

文摘

新发传染病,如严重急性呼吸系统综合症(SARS)和Zika病毒疾病,目前对公众健康的一大威胁1,2,3。尽管激烈的研究工作,如何,何时何地出现新的疾病仍然是一个相当大的不确定性的来源。严重呼吸道疾病在武汉最近报道,湖北省,中国。截至2020年1月25日,至少已报告1975例住院以来,第一个病人于2019年12月12日。流行病学调查表明,爆发与武汉的海鲜市场。这里我们研究一个病人是一个工人在市场和考入武汉中心医院2019年12月26日在经历严重呼吸道综合征,包括发烧、头晕和咳嗽。宏基因组RNA序列4样本的支气管肺泡灌洗液从病人发现了一个新的RNA病毒株的家庭Coronaviridae,也就是这里指定WH-Human 1冠状病毒(也被称为“2019 - ncov”)。系统发育分析完整的病毒基因组核苷酸(29903)显示,病毒是最密切相关(89.1%核苷酸相似性),一群类似非典冠状病毒(属Betacoronavirus,亚属Sarbecovirus)以前发现蝙蝠在中国5。爆发了持续的病毒从动物溢出导致严重疾病的能力。

主要

病人研究是一个没有历史的41岁男子的肝炎、肺结核或糖尿病。他承认,在医院,2019年12月26日武汉的中心医院,疾病的发病后6天。据病人发热、胸闷、干咳、疼痛和虚弱表现(表1周1)。体检的心血管、腹部和神经系统特征,这些都是正常的。轻度lymphopoenia(定义为小于9×105观察细胞每毫升),但白细胞和血小板计数在一个完整的血细胞计数正常测试。l c反应蛋白水平升高(41.4毫克−1的血液;参考范围0 - 6毫克l−1)观察和天冬氨酸转氨酶水平,乳酸脱氢酶和肌酸激酶略升高血液中化学测试。病人有轻度低氧血氧水平的67毫米汞柱,由一个动脉血液气体测试。在入学的第一天(疾病的发病后6天),胸片异常与大气空间阴影如毛玻璃的透明,焦整合和不完整的整合两肺(扩展数据图。1)。胸部电脑断层扫描显示双边焦整合,大叶性整合和不完整的整合,特别是在低肺(扩展数据图。1模拟)。胸片显示双边弥漫性斑片状模糊阴影5天入院后(天11疾病发生之后)(扩展数据图。1 e)。病原学的初步调查排除流感病毒的存在,衣原体肺炎肺炎支原体使用商业病原体抗原检测试剂盒,PCR证实了此事。其他常见的呼吸道病原体,也包括人类腺病毒测试呈阴性反应的定量PCR (qPCR)(扩展数据图。2)。尽管抗生素、抗病毒和糖皮质激素治疗管理,病人呼吸衰竭和展出了高速流非侵入式通风。病人的状况没有改善3天的治疗后,他被送进重症监护室。病人被转移到另一个在武汉医院进一步治疗入院后6天。

表1临床症状和患者数据

武汉流行病学调查的疾病控制和预防中心透露,患者在当地工作室内海鲜市场。值得注意的是,除了鱼类和贝类,各种各样的野生动物包括刺猬生活,獾,蛇和鸟(斑鸠)则可供销售的市场爆发之前开始,以及动物尸体和动物肉。没有可供销售的蝙蝠。虽然病人可能有接触野生动物,他回忆起没有接触活禽。

调查可能与这种疾病相关病原学的代理,我们收集支气管肺泡灌洗液(BALF)和深meta-transcriptomic测序完成。临床标本处理在生物安全三级实验室在上海公共卫生临床中心。总RNA提取200μl BALF和构建了pair-end meta-transcriptomic库(150 - bp读取)测序使用Illumina公司MiniSeq如前所述4,6,7,8。总的来看,我们生成56565928序列读取de novo-assembled和筛选潜在的病原学的代理。384096年热卖重叠群装配9最长(30474核苷酸(nt))丰度高,蝙蝠密切相关类似非典冠状病毒(x) isolate-bat SL-CoVZC45(加入基因库MG772933)——以前采样在中国,89.1%的核苷酸身份(补充表1,2)。这种病毒的基因组序列,以及它的终点,测定,证实了逆转录聚合酶链反应(rt - PCR)10和5′和3′快速放大cDNA结束(种族),分别。这种病毒株被指定为WH-Human 1冠状病毒(WHCV)(也被称为“2019 - ncov”)和它的整个基因组序列(29903元)分配基因库加入MN908947数量。重新映射RNA-sequencing数据的完整基因组WHCV导致123613读的组装,提供99.99%的基因组覆盖率平均深度6.04×(范围0.01 - -78.84×)(扩展数据图。3)。的病毒载量BALF样本估计qPCR 3.95×108拷贝/毫升(扩展数据图。4)。

WHCV的病毒基因组的组织是由序列比对的两个代表成员属Betacoronavirus:一个与人类相关的冠状病毒(冠Tor2,基因库加入AY274119)和冠状病毒与蝙蝠(蝙蝠SL-CoVZC45,加入基因库MG772933数量)。un-translational地区和WHCV个开放阅读框(ORF)映射序列比对和开放的基础上预测。WHCV病毒基因组是类似于这两个冠状病毒(无花果。1和补充表3)。基因的顺序(5′,3′)如下:复制酶ORF1ab,斯派克(年代),信封(E),(),核衣壳(N)。WHCV 5′和3′末端序列,是典型的betacoronaviruses, 265元的5′终端和229 nt 3′末端。预测的复制酶ORF1ab基因WHCV 21291元的长度,包含16个预测非结构性蛋白(补充表4),其次是(至少)13下游羊痘疮。此外,WHCV共享一个高度保守的域(LLRKNGNKG:氨基酸122 - 130)nsp1冠。预测的年代,ORF3a,E,N基因WHCV的3822、828、228年,分别为669和1260元的长度。除了这些子区域,由亚属的所有成员共享Sarbecovirus, WHCV类似于冠,它预测ORF8基因的长度(366元),位于之间的NORF的基因。的功能WHCV orf预测的基础上那些已知的冠状病毒和补充表中描述5。领导人的方式类似于冠Tor2转录调控序列(TRS)和9个公认的身体TRS可以容易地确定上游的5′末端WHCV开放框架中,和假定的守恒的TRS核心序列出现在两个forms-ACGAAC或CUAAAC(补充表6)。

图1:基因组组织非典和类似非典浸。
图1

WHCV基因的组织,蝙蝠SL-CoVZC45和冠Tor2。

确定WHCV之间的进化关系和之前确定冠状病毒,我们估计系统发育树的基础上,全基因组序列的核苷酸序列,非结构性蛋白基因ORF1aORF1b,主要结构蛋白编码的年代,E,N基因(图。2和扩展数据图。5)。在所有的发展史,WHCV集群成员的亚属Sarbecovirus,包括冠状,负责全球SARS流行病1,22002 - 2003年,已获得大量的类似非典的冠状病毒蝙蝠5,11,12,13。然而,WHCV改变拓扑位置在亚属Sarbecovirus这取决于基因,这表明重组发生在这群病毒在过去(无花果。2和扩展数据图。5)。具体地说,在年代基因树(扩展数据图。5),蝙蝠WHCV最密切相关的冠状病毒SL-CoVZC45氨基酸标识(82.3%和77.2%左右的氨基酸身份冠;补充表3)而在ORF1b发展史,WHCV亚属内的基底位置Sarbecovirus(无花果。2)。这个拓扑划分,这可能反映了蝙蝠sarbecoviruses重组,也观察到在系统发育树估计复制酶的保守域多蛋白pp1ab(扩展数据图。6)。

图2:最大似然的核苷酸序列的系统发育树ORF1a,ORF1b,EWHCV及相关冠状病毒基因。
图2

一个的系统发育树ORF1ab的系统发育树ORF1bc的系统发育树Ed的系统发育树。EriCoV Erinaceus冠状病毒。数字(> 70)高于或低于分支显示引导百分比值相关联的节点。树木是中点的清晰。比例尺表示替换每个站点的数量。

为了更好地理解WHCV感染人类的潜力,受体结合域(RBD)的峰值蛋白质与冠和蝙蝠类似非典浸。RBD WHCV序列更密切相关的冠状氨基酸身份(73.8 -74.9%)和类似非典浸,包括菌株Rs4874 Rs7327和Rs4231氨基酸身份(75.9 -76.9%),能够使用人力ACE2受体细胞条目11(补充表7)。此外,RBD WHCV只有一个峰值蛋白质的氨基酸的RBD超过峰值蛋白质从冠(扩展数据图。7一个)。相比之下,其他蝙蝠类似非典CoVs-including不能绑定到人类ACE2的Rp3应变14——氨基酸缺失在433 - 437和460 - 472位置序列相比冠(扩展数据图。7一个)。之前确定的15RBD的晶体结构,冠状的突起蛋白包裹着人类ACE2(蛋白质数据库(PDB) 2 ajf)显示区域433 - 437和460 - 472直接与人类交互ACE2,因此可能是重要的在确定物种特异性(扩展数据图。7 b)。我们预测的RBD的三维蛋白质结构域的蛋白质的WHCV Rs4874和Rp3蛋白质同源性建模使用瑞士模式服务器和比较它们的晶体结构RBD域冠状的突起蛋白(PDB 2 ghv)(扩展数据图。七氟)。按照序列比对,RBD的预测蛋白质结构域WHCV和Rs4874密切相关的冠状和不同的预测从Rp3 RBD的结构域。此外,N末端的突起蛋白WHCV更类似于冠比其他人类冠状病毒(HKU1和OC43)(扩展数据图。8可以结合唾液酸)16。总之,相似性高的氨基酸序列和蛋白质结构预测的RBD域WHCV和冠表明WHCV可能有效地使用人力ACE2作为受体细胞,这可能会促进人与人之间传播11,17,18

进一步描述假定的重组事件的进化史sarbecoviruses, WHCV的全基因组序列和四个代表coronaviruses-bat类似非典浸Rp3, CoVZC45 CoVZXC21和冠Tor2-were分析v使用复合检测程序。4 (RDP4)19。尽管相似情节暗示WHCV之间可能的重组事件发生和冠状或类似非典浸(扩展数据图。9),没有明显的证据在整个基因组的重组。然而,一些过去的重组中检测出的证据年代基因的WHCV、冠状和蝙蝠类似非典浸(WIV1和RsSHC014) (P< 3.147×10−3P< 9.198×10−9),相似的情节提出重组的存在断点在核苷酸1029年和1652年,分离年代基因WHCV分成三个区域(图。3)。发展史的核苷酸片段从1到1029年,从1652年到序列的最后,WHCV是大多数蝙蝠SL-CoVZC45和蝙蝠SL-CoVZXC21密切相关,而在该地区的核苷酸1030 - 1651 (RBD地区)WHCV分组冠和蝙蝠类似非典浸(WIV1和RsSHC014)能够直接的人类传播17,20.。尽管这些重组事件,似乎sarbecoviruses中相对普遍,没有证据表明重组推动了WHCV的出现。

图3:可能的重组事件年代sarbecoviruses的基因。
图3

一个,序列相似性情节揭示了两个假定的复合断点(黑色虚线),它们的位置显示在底部。情节显示的相似性比较年代WHCV基因(查询)的序列与冠Tor2和蝙蝠类似非典浸WIV1, Rf1 CoVZC45。b的发展史主要的父母的地区(1 - 1028和1653 - 3804)和次要的地区(1029 - 1652)。的发展史是使用最大似然估计法和中点的清晰。数字高于或低于分支显示引导百分比值。比例尺表示替换每个站点的数量。

冠状病毒与人类传染病疫情,包括2002 - 2003年SARS和中东呼吸综合症(即2012年1,21。其他四个coronaviruses-human冠状病毒HKU1 OC43, NL63和229 e也与呼吸道疾病有关22,23,24,25。广泛发现虽然类似非典的冠状病毒在哺乳动物包括蝙蝠在中国自2005年以来10,26,27,28的确切起源human-infected冠状病毒仍不清楚。在这里,我们描述一个新的coronavirus-WHCV-in BALF从一个病人经历了严重的呼吸道疾病在武汉,中国。系统发育分析表明,WHCV属于属Betacoronavirus(亚属Sarbecovirus),有一些基因和冠状系统的相似之处1蛋白质,尤其是RBD的飙升。这些基因和SARS临床相似之处,以及其高大量临床样本,提供证据WHCV与呼吸道疾病的疫情在武汉和世界各地。虽然从只有一个病毒的隔离病人不足以得出结论,这导致这些呼吸道症状,我们的研究结果已经在进一步独立证实患者在一个单独的研究29日

多个类似非典的识别浸在蝙蝠已导致这些动物作为东道主的这些病毒的自然宿主22,23。虽然类似非典病毒已确定在中国广泛的蝙蝠,冠状病毒一样尚未记录。值得注意的是,WHCV大多数蝙蝠冠状病毒密切相关,显示100%的氨基酸相似性蝙蝠SL-CoVZC45 nsp7和E蛋白(补充表3)。因此,这些数据表明,蝙蝠是一种可能的主机病毒WHCV水库。然而,随着各种动物物种在市场出售这种疾病首先报道的时候,还需要进一步的研究来确定WHCV的自然宿主和任何中间宿主。

注意添加在证明:由于本文是接受,SARS-CoV-2 ICTV指定了病毒30.;此外,世卫组织发布了官方的名字由病毒引起的疾病,这是COVID-1931日

方法

数据报告

没有统计方法被用来预先确定样本容量。实验并不随机,调查人员没有被分配在实验和结果评估。

患者信息和收集临床资料和样品

病人呈现急性发热(温度超过37.5°C),咳嗽,胸闷,考入武汉中心医院,在武汉,中国被认为是一个疑似病例。录取期间,BALF收集和储存在−80°C,直到进一步的处理。人口统计学、临床和实验室数据检索病人的临床记录。研究伦理委员会审查和批准的传染病预防与控制研究所,中国疾病预防控制中心。从病人签署书面知情同意了。

RNA图书馆建设和测序

从BALF中提取总RNA样本使用RNeasy +通用迷你包(试剂盒)后,制造商的指示。RNA溶液的数量和质量是评估使用Qbit机和一个安捷伦2100生物分析仪(安捷伦科技)在图书馆建设和测序。RNA图书馆然后使用聪明链构造总RNA-Seq工具包v。2(豆类)。核糖体RNA损耗进行了在图书馆建设遵循制造商的指示。Paired-end (150 - bp读取)测序RNA图书馆进行MiniSeq平台(Illumina公司)。图书馆准备和排序进行了在上海市公共卫生临床中心,复旦大学,上海,中国。

数据处理和识别病毒的代理

测序读第一次削减使用Trimmomatic适配器和质量计划32。剩下的56565928读组装新创使用热卖(v.1.1.3)9和三一(v.2.5.1)33使用默认参数设置。热卖384096组装产生重叠群(尺寸范围200 - 30474元),而三一生成1329960叠连群尺寸范围为201 - 11760元。所有这些重叠群装配比较(使用BLASTn和钻石BLASTx)对整个冗余(nr)核苷酸和蛋白质数据库,e值设置为1×10−10和1×10−5,分别。识别可能的病原学的特工出现在测序数据,聚集的大量重叠群第一次被评为使用RSEM项目预期的数量34在三一实现。非人类读(23712657读),由过滤主机读取使用人类基因组(人类释放32,GRCh38。由Bowtie2 p13从Gencode下载)35用于RSEM丰度的评估。

最长的叠连群热卖(30474元)和生成的三位一体(11760元)均显示高相似性蝙蝠类似非典冠状病毒隔离蝙蝠SL-CoVZC45和被发现在较高丰度(补充表1,2),时间越长序列(30474元)——几乎覆盖整个病毒基因组用于PCR引物设计确认和决心的基因组末端。引物用于PCR, qPCR和种族实验补充表中列出8。进行了PCR检测如前所述10和完整的基因组末端决心使用豆类智能种族的5′和3′工具包(豆类)后,制造商的指示。随后,基因组覆盖率和测序深度测定重新映射所有的适配器,quality-trimmed读取整个基因组的使用Bowtie2 WHCV35和Samtools36

WHCV的病毒载量BALF实时定量rt - pcr测定使用豆类一步PrimeScript rt - pcr试剂盒(豆类RR064A)后,制造商的指示。实时rt - PCR进行使用2.5μl RNA与每个引物和4 8 pmol pmol探针在下列条件:逆转录42°C 10分钟,95°C 1分钟,其次是40 95°C的周期为1分钟15秒和60°C。反应进行,检测到ABI 7500实时PCR系统。PCR产品覆盖Taqman引物和探针地区被克隆到拉钮向量使用基于致命的简单快速克隆工具(TianGen)作为标准定量病毒负荷试验。

病毒基因组特征和系统发育分析

新发现的病毒基因组,潜在的orf预测和注释使用乳沟的守恒的签名网站被冠状病毒蛋白酶,和处理Lasergene软件包(v.7.1 DNAstar)。病毒基因一致使用L-INS-i算法实现MAFFT (v.7.407)37

系统发育分析被执行使用各种x基因的核苷酸序列数据集:(1)全基因组,(2)ORF1a, (3) ORF1b, (4) nsp5 (3 clpro), (5) RdRp (nsp12), (6) nsp13 (Hel), (7) nsp14(外显子),(8)nsp15 (NendoU), (9) nsp16 (O-MT)、(10)峰值(S)和(11)核衣壳(N)系统发育树推断使用最大似然方法实现PhyML项目(v.3.0)38,使用广义时间可逆的替代模型和子树修剪,再接枝于分支交换。从1000年pseudo-replicate树引导支持值计算。核苷酸替换的最佳拟合模型确定了使用大型(5节)39。氨基酸序列之间的身份使用MegAlign计算程序中实现Lasergene软件包(v.7.1 DNAstar)。

基因组重组分析

潜在的重组事件的历史sarbecoviruses RDP4评估使用19和Simplot (v.3.5.1)40。RDP4分析是基于完整的基因组序列(核苷酸),使用RDP GENECONV, BootScan,最大的x平方分布,妄想,SISCAN和3 seq方法。假定的重组事件被确定Bonferroni纠正P价值截止0.01。相似的情节推断使用Simplot进一步描述潜在的重组事件,包括可能的断点的位置。

分析RBD域WHCV突起蛋白的

RBD的氨基酸序列比对序列从WHCV冠和蝙蝠类似非典浸了使用肌肉41。预测蛋白质结构RBD的峰值估计基于target-template对齐在瑞士模式使用ProMod3服务器(https://swissmodel.expasy.org/)。RBD的序列域WHCV飙升,Rs4874和Rp3搜查了爆炸对瑞士模式模板库中包含的主要氨基酸序列(最后更新2020年1月9日;去年包括PDB发布,2020年1月3日)。模型构建基于使用ProMod3 target-template对齐。全球和per-residue质量评估使用QMEAN得分函数模型42。预测蛋白质结构的PDB文件显示并与晶体结构的峰值RBD的冠(PDB 2 ghv)43的晶体结构的峰值RBD的冠状包裹着人类ACE2 (PDB 2 ajf)15

报告总结

进一步研究信息设计是可用的自然研究报告摘要与本文有关。

数据可用性

生成的序列读取在这项研究可从NCBI序列读取存档(SRA)数据库下BioProject加入号码PRJNA603194。WHCV的完整基因组序列已经沉积在基因库加入号码MN908947

改变历史

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确认

本研究特别国家项目支持的中国基本资源调查(2019年格兰特fy101500)和中国国家自然科学基金(拨款81861138003和81861138003)。支持E.C.H.弧形澳大利亚奖得主奖学金(FL170100022)。

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作者和联系

作者

贡献

Y.-Z.Z.构思和设计研究。S.Z.,Y.H., Z.-W.T. and M.-L.Y. performed the clinical work and sample collection. B.Y. and J.-H.T. performed the epidemiological investigation and sample collection. F.W., Z.-G.S., L.X., Y.-Y.P., Y.-L.Z., F.-H.D., Y.L., J.-J.Z. and Q.-M.W. performed the experiments. Y.-M.C., W.W., F.W., E.C.H. and Y.-Z.Z. analysed the data. Y.-Z.Z., E.C.H. and F.W. wrote the paper with input from all authors. Y.-Z.Z. led the study.

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道德声明

相互竞争的利益

作者宣称没有利益冲突。

额外的信息

同行审查的信息自然谢谢尼古拉斯·鲁曼,另一个匿名的,审稿人(s)为他们的贡献的同行评审工作。

出版商的注意施普林格自然保持中立在发表关于司法主权地图和所属机构。

扩展数据数据和表

扩展数据图1患者的胸片。

一个- - - - - -d,电脑断层扫描的胸部得到入学那天疾病的发病后(6天)。双边焦整合,叶的整合和不完整的整合显然是观察,尤其是在较低的肺。e,获得了一个胸部x光在5天入院后疾病的发病后(11天)。双边弥漫性斑片状模糊阴影观察。

扩展数据图2其他呼吸道病原体并非由实时rt - pcr检测BALF中样本。

一个- - - - - -e,BALF样本检测甲型流感病毒(一个),乙型流感病毒的维多利亚血统(b),乙型流感病毒的山形血统(c),人类腺病毒(d),衣原体肺炎(e)。病人的样本1是BALF示例,水被用作负(底片)控制和积极的(POS)控制样本包括质粒覆盖Taqman甲型流感的引物和探针地区,维多利亚和山形血统乙型流感病毒,人类腺病毒和衣原体肺炎

图3扩展数据映射读计数WHCV基因组的情节。

直方图显示覆盖深度/ WHCV基因组的基础。平均WHCV基因组的测序深度为604.21元。

扩展数据图4量化WHCV临床样本的实时rt - pcr。

一个WHCV引物的特异性评估。测试样品由临床样本阳性病例至少下列病毒之一:甲型流感病毒(09年h1n1和H3N2),乙型流感病毒,人类腺病毒、呼吸道合胞病毒、鼻病毒、副流感病毒病毒类型1 - 4,人类bocavirus人类metapneumovirus,冠状病毒OC43,冠状病毒NL63,冠状病毒229 e和冠状病毒HKU1。唯一的标准质粒WHCV (WHCV 15704 - 16846 bp拉钮向量)导致积极的放大(棕色曲线)。bWHCV DNA扩增曲线的标准。从左到右,DNA浓度分别为1.8×108,1.8×107,1.8×106,1.8×105,1.8×104和1.8×103c线性拟合曲线Ct值WHCV DNA的浓度标准。d、量化的WHCV BALF样本的实时rt - pcr。WHCV DNA标准作为积极的控制(POS),水(底片)和空白被用作消极的控制。BALF的扩增曲线示例所示绿色。

扩展数据图5最大似然整个基因组核苷酸序列的系统发育树,和年代NWHCV及相关冠状病毒基因。

数字(> 70)高于或低于引导分支显示百分比值。树木是中点的清晰。比例尺表示替换每个站点的数量。

扩展数据图6最大似然的核苷酸序列的系统发育树3氯,RdRp,冥界,外显子,NendoUO-MTWHCV及相关冠状病毒基因。

数字(> 70)高于或低于引导分支显示百分比值。树木是中点的清晰。比例尺表示替换每个站点的数量。

扩展数据图7分析RBD WHCV突起蛋白的冠状病毒。

一个氨基酸序列比对RBD序列类似非典的浸。三个蝙蝠类似非典CoVs-which可以有效地使用人力ACE2 receptor-had RBD的大小和冠相似序列。WHCV包含单个Val470插入。关键氨基酸残基参与了与人类ACE2的橙色方块。相比之下,五只蝙蝠类似非典浸,包括Rp3,它曾被发现不是ACE2绑定14——氨基酸缺失两个主题(氨基酸433 - 437和460 - 472年,突出了红框)相比SARS-CoV.11b,两个图案(氨基酸433 - 437和460 - 472年)所示红色的晶体结构RBD冠状的突起蛋白与人类ACE2在复杂的受体(PDB 2 ajf)。人类ACE2的RBD所示蓝色和绿色所示冠状的突起蛋白。重要的人类ACE2与残留的RBD冠状的突起蛋白明显。c预测蛋白质结构的RBD的突起蛋白WHCV基于target-template对齐在瑞士模式使用ProMod3服务器。dRBD的预测,结构类似非典的峰值蛋白质浸Rs4874。eRBD的预测,结构类似非典的峰值蛋白质浸Rp3。f的晶体结构,RBD冠状的突起蛋白(绿色)(PDB 2 ghv)。主题类似氨基酸433 - 437和460 - 472的峰值蛋白质冠红色所示。

扩展数据图8 n端结构域的氨基酸序列比较的蛋白质。

n端结构域的氨基酸序列比较WHCV突起蛋白,牛冠状病毒(BCoV),鼠肝炎病毒(MHV)和人类冠状病毒(HCoV OC43和HKU1),可以结合唾液酸和冠不能(SZ3、WH20 BJ0和Tor2)。的关键残基16对唾液酸结合BCoV、MHV HCoV OC43和HKU1强调橙色方块。

扩展数据图9所示

WHCV重组事件。序列相似性WHCV,类似非典浸和蝙蝠类似非典浸揭示了假定的重组事件。

补充信息

补充表

这个文件包含补充表1 - 8。

报告总结

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吴,F。,Zhao, S., Yu, B.et al。一种新的冠状病毒与人类呼吸道疾病在中国。自然579年,265 - 269 (2020)。https://doi.org/10.1038/s41586 - 020 - 2008 - 3

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