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区域差异限制了健康肠道微生物组参考范围和疾病模型的应用

一个作者修正本文发表于2018年9月24日

本文已被更新

摘要

生态失调,即肠道微生物组脱离健康状态,已被认为是疾病发病率和进展的有力生物标志物123..已提出在炎症性肠病诊断和预后方面的诊断应用4,结直肠癌预检5以及黑色素瘤的治疗选择6.无创采样可以促进大规模的公共卫生应用,包括代谢的早期诊断和风险评估7心血管疾病8.为了了解基于微生物群的代谢性疾病诊断模型的广泛性,我们对来自中国一个省14个地区的7,009人的肠道微生物群进行了特征分析。在表型中,宿主定位与菌群变异的相关性最强。在一个地方开发的基于微生物群的代谢疾病模型在其他地方使用时失败了,这表明这种模型不能外推。插值模型表现得更好,特别是在具有明显微生物群相关特征的疾病中。插值效率随着地理规模的增加而降低,这表明需要建立局部基线和疾病模型来预测代谢风险。

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图1:采样区域概况和肠道菌群的区域差异。
图2:评估基于肠道微生物群的疾病模型在不同地点之间的交叉适用性。
图3:用于插值和外推MetS模型的难度梯度说明。

改变历史

  • 2018年9月24日

    在本文最初发表的版本中,在“将相同的方法应用于肥胖(图2b), MetS(图2c)和脂肪肝(图2d)产生了类似的结果”这句话中,两个图面板被错误引用。肥胖数据见图2c,代谢当量数据见图2b。这句话已经在文章的印刷版、PDF版和HTML版中得到了正确的引用。

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确认

我们感谢308名当地疾控中心调查员和注册护士在收集点维护、元数据和粪便样本收集方面的帮助。我们感谢所有参与这个项目的志愿者。国家重大传染病预防控制项目(2017ZX10103011 (H.W.Z.))、国家自然科学基金(NSFC31570497 (H.W.Z.)、31322003 (H.W.Z.)、81671171 (J.Y.))、中国博士后科学基金(C1090132 (Y.H.))、广东省科技计划项目(2015A030401055 (W.W.))资助。

作者信息

作者及隶属关系

作者

贡献

y.h.、w.w.、w.j.m.和h.w.z.设计了这项研究;w.w.、c.z. h .、z - h.c .、g.y.j .、y.j.x .和w.j.m .组织数据收集和培训当地疾控中心调查员;M.-X.C Z.-D.-X.Z。下午,X.-J.C, Z.-H.R, L.-Y.L.和纽约州处理样品;,12 H.-M.Z。,P.L H.-F.S, X.W, C.-B.W,古滑坡体,J.Y. H.-W.Z.分析数据;y.h.、d.m.、w.j.m.、R.K.和h.w.z.起草了手稿;R.K.和J.R.就研究设计、数据分析和手稿写作提供了建议。

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l.y.l .、X.W.及c.b.w .为深圳市Fun-Poo生物科技有限公司员工。

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何,Y.,吴,W.,郑,HM.。et al。区域差异限制了健康肠道微生物组参考范围和疾病模型的应用。Nat地中海24, 1532-1535(2018)。https://doi.org/10.1038/s41591-018-0164-x

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