活动性克罗恩病粪便菌群移植后肠道微生物多样性增加

背景

克罗恩病(CD)患者腔内的微生物群的特点是多样性减少，特别是厚壁菌门和拟杆菌门。目前尚不清楚从健康个体引入肠道微生物群是否能纠正这种生态失调并逆转粘膜炎症。我们调查了健康个体对粪便微生物移植(FMT)对活动性乳糜泻受试者的反应。

方法

我们进行了一项前瞻性的开放标签研究(无对照)，研究对象为健康供体和活动性乳糜泻患者。在12周内测量接受者的微生物多样性、粘膜t细胞表型、临床和炎症参数，并在26周内测量安全性。

结果

19名受试者接受FMT治疗并完成研究随访。58%(11/19)在FMT后表现出临床反应(Harvey-Bradshaw指数下降>3)。15名受试者有足够的粪前/粪后样本进行分析。FMT后微生物多样性显著增加(P= 0.02)。这在临床有反应者中比无反应者更明显。出现临床反应的患者在4周时通过Bray-Curtis指数评估粪便微生物成分向供体特征的显著转变(P= 0.003)。调节性T细胞(CD4)增加⁺CD25⁺CD127lo)在FMT术后受者固有椎板中也可见。在26周的研究期间，没有发现严重的不良事件。

结论

在这项开放标签研究中，FMT导致活动性CD患者微生物细菌多样性的扩大。FMT总体上是安全的，尽管临床反应是可变的。在CD的FMT随机临床试验之前，需要确定影响临床反应的供体微生物因素。

克罗恩病(CD)是一种慢性炎症疾病，其特征是基因易感个体对未知环境或微生物刺激的异常免疫反应。^1，2虽然还没有发现引起乳糜泻的特定病原体，但已经注意到与肠道微生物组的明显关联。^{3.，- - - - - -5}最常见的是细菌门的多样性减少，包括厚壁菌门和拟杆菌门。⁶最近一项针对未接受治疗的小儿乳糜泻受试者的大型队列研究表明，大量的细菌家族如Veillonellaceae，肠杆菌科，巴斯德氏菌科，Fusobacteriaceae同时，与疾病活动相关的丹毒菌、拟杆菌和梭状芽孢杆菌也在减少。⁴除了微生物组组成的改变外，微生物组的功能也明显不同，氧化应激途径和碳水化合物代谢都发生了变化。⁵

这些关联使得研究者将肠道生态失调作为乳糜泻的治疗目标。中心假设是，乳糜泻的炎症和/或症状与生态失调有关，并且可以通过恢复健康的微生物群来改善。粪便菌群移植(FMT)是一种将不同的细菌家族混合引入患病肠道的方法，可以恢复肠道多样性。^7，8FMT彻底改变了多发性复发性Clostridium固执的感染治愈率90%以上。⁹FMT后为复发梭状芽孢杆菌感染后，受者倾向于在FMT后立即接受供者的微生物群，尽管后来与供者的特征明显不同，并在个体水平上恢复多样性。^10，11总体而言，短期内FMT似乎是安全的梭状芽孢杆菌；然而，它对炎症性肠病(IBD)患者疾病过程的影响更不可预测。^12，13两项针对溃疡性结肠炎患者的随机对照试验产生了混合结果，其中一项试验发现FMT后有显著益处，而另一项试验在FMT和安慰剂之间没有统计学差异。^14，15与溃疡性结肠炎不同，乳糜泻的特点是结肠分布有限，与与细菌感应相关的基因有很强的联系(如NOD2而且CARD9)，¹⁶还有对抗生素治疗特别敏感的亚群。¹⁷因此，乳糜泻的疾病过程可能对微生物多样性的改变更敏感。考虑到这一点，我们进行了一项前瞻性的、开放标签的活动性乳糜泻研究，以评估接受者对FMT的微生物和临床反应。

方法

病人的选择

符合条件的受试者需要结肠或结肠和回肠CD的典型组织病理学文件，>疾病持续3个月，哈维-布拉德肖指数(HBI)≥5。受试者必须在美沙拉明>2周、硫嘌呤>3周、抗肿瘤坏死因子抗体>12周或类固醇依赖的标准治疗中失败。使用环孢素、他克莫司、英夫利昔单抗、阿达木单抗、certolizumab pegol或纳他珠单抗的患者需要12周洗脱期。在FMT前60天服用抗生素，在FMT前30天服用益生菌。在FMT前至少2周，类固醇逐渐减少到每天20毫克强的松(或等效)。

排除标准包括年龄<18岁、不确定结肠炎、孤立性直肠炎、孤立性回肠或小肠疾病、突发性结肠炎、感染性结肠炎、孕妇或哺乳期、美国麻醉医师协会(ASA) >II级、失代偿性肝硬化、糖尿病、活动性恶性肿瘤、狼疮、慢性肾病(肾小球滤过率[GFR] < 60 mL/min)、心脏瓣膜病(包括风湿性心脏病和心内膜炎)病史。符合条件的患者在FMT前2周进行筛查梭状芽孢杆菌粪便培养，卵子和寄生虫粪便分析。FMT前2周需要稳定的药物治疗方案。

供选择

捐赠者是与病人没有任何关系的健康男性。选择无亲缘关系的供体是因为乳糜泻患者的兄弟姐妹可能具有生物多样性降低等异常特征。¹⁸使用AABB供者史工作组编制的供者史问卷对供者进行筛查，并进行HIV、甲型肝炎IgM、乙型肝炎表面抗原和核心抗体、丙型肝炎抗体、巨细胞病毒(CMV)病毒载量、快速血浆反应素(RPR)、全血细胞计数(CBC)、谷丙转氨酶(ALT)、天门冬氨酸转氨酶(AST)、碱性磷酸酶和总胆红素的血液检测。如果供体通过了初步筛选，就会检测粪便样本沙门氏菌，志贺氏杆菌，鼠疫，弯曲杆菌，弧菌，大肠杆菌，梭状芽孢杆菌聚合酶链式反应，贾第鞭毛虫和隐孢子虫DFA，显微镜检查虫卵和寄生虫，环孢子虫，微孢子虫和等孢子虫。每个供者提供5等份50克粪便菌群材料，供者与受者1:5配对。选择四名捐赠者是为了减少偶然选择无效捐赠者的可能性，并提供捐赠者情况的可变性。

供体粪便处理

根据Hamilton等人的方案，在收集供体粪便后数小时内进行了处理。¹⁹简单地说，将50克供体粪便与250毫升无菌生理盐水混合在不锈钢搅拌器中15分钟。由此产生的浆液通过筛子去除持久性颗粒物质。然后以6000转/分的转速离心15分钟。丢弃上清液，剩余沉淀剂用10%甘油重悬至原来体积的一半，并立即在−80°C冷冻。FMT当天，将供体样本从冰箱中取出，放在水浴中4小时。在给药前1小时，加入无菌生理盐水，使供体材料的总体积达到250厘米^3.．

粪便移植

所有患者均在结肠镜检查前一天用柠檬酸镁进行充分的肠道准备。FMT前未使用抗生素。对回肠末端进行结肠镜检查，从回肠末端和右结肠开始给予供体排泄物，并继续远端。结肠镜检查后，患者服用4mg易蒙停，并向右侧卧20分钟。

结果测量

收集FMT后12周的临床参数，包括HBI、短炎症性肠病问卷(sIBDQ)、克罗恩病内镜严重程度指数(CDEIS)和血液工作。临床反应定义为第4周时HBI改变为>3，而cd相关药物的使用没有增加。如果受试者需要增加cd相关药物，则将临床参数保持在治疗开始前的值进行统计分析。对于缺失的数据，之前的值将被结转。临床参数的变化采用重复测量方差分析，然后采用Tukey的多重比较事后检验，而实验室参数和CDEIS的变化采用Wilcoxon配对符号秩检验。使用Prism版本5对临床参数进行统计分析。收集三份粪便样本:FMT前、FMT后4周和FMT后8周。在FMT时和FMT后12周进行黏膜活检。没有收集12周的粪便样本，因为人们认为结肠镜检查的准备工作可能会影响微生物组。

固有层细胞分离

在第0周(FMT前)和第12周从新鲜获得的结肠活检中分离固有层单个核细胞。简单地说，结肠活检组织在Hank’s平衡盐溶液(HBSS)-无钙镁溶液中洗涤，然后在含有0.75 mM EDTA (Sigma-Aldrich, Natick, MA)和1mm二硫苏糖醇(Sigma-Aldrich)的HBSS中37°C孵育约30分钟以去除上皮。组织在RPMI-1640培养基(Cellgro;Mediatech Inc.， Manassas, VA)含有400 U/mL的胶原酶IV (Sigma-Aldrich)和0.01 mg/mL的DNase I (Sigma-Aldrich)，在37°C的震动培养箱中。这个步骤重复3到5次。从组织中释放的固有层单个核细胞用40% ~ 100% Percoll (GE Healthcare, Marlborough, MA)梯度纯化，并在含有10%胎牛血清、2 mM谷氨酰胺、25 mM HEPES、100 U/mL青霉素和100 μg/mL链霉素的完整rmi -1640培养基中培养。

流式细胞术

对于细胞表面染色，制备单细胞悬液，并在4°C下以每种单克隆抗体的最佳稀释量标记15分钟。使用了以下抗人单克隆抗体:异硫氰酸荧光素小鼠抗人CD39 (BU-61;Ancell Corp.， Bayport, MN);藻红菊酯小鼠抗人CD73 (AD2;BD pharingen，圣何塞，加州);同种藻蓝蛋白小鼠抗人CD25 (BC96;eBioscience，圣地亚哥，加州);太平洋蓝鼠抗人CD127 (eBioRDR5;eBioscience);藻红菊酯- cychrome 7小鼠抗人CD4 (RPA-T4; eBioscience), An isotype-matched control monoclonal antibody (murine IgG1) was used to determine nonspecific staining for gating. Expression of cell surface or intracellular markers was assessed using a flow cytometer (LSRII; Becton Dickinson, Mountain View, CA). After gating on live cells determined by scatter characteristics, data were analyzed using FlowJo software (Tree Star, Ashland, OR). The number of CD73⁺CD4细胞⁺群体以流式细胞术细胞数的百分比表示。

全基因组霰弹枪测序

全基因组霰弹枪测序文库制备如下。使用QIAamp DNA stool Mini Kit (QIAGEN, Inc.， Valencia, CA)从粪便中提取DNA。宏基因组DNA样品采用quantum - it PicoGreen dsDNA Assay (Life Technologies)定量，归一化浓度为50 pg/μL。Illumina测序文库使用Nextera XT DNA文库制备试剂盒(Illumina)，按照制造商推荐的方案制备100至250 pg DNA，反应量相应扩大。使用安捷伦生物分析仪DNA 1000试剂盒(安捷伦科技)确定每个池库的插入物大小和浓度。宏基因组文库在Illumina HiSeq 2500平台上测序，每个样品的目标序列为~ 5.0 Gb，末端配对reads为101 bp。

全基因组霰弹枪数据中微生物分类群的定量研究

读取的质量控制使用KneadData管道(https://bitbucket.org/biobakery/kneaddata)．该流程包括去除低质量碱基，将读数降至60个核苷酸以下，并过滤掉潜在的人类污染。质量控制样本使用MetaPhlAn 2.0进行分类分析，^20.后领结2至2.1.0²¹与metaphlan2.0唯一标记数据库(http://huttenhower.sph.harvard.edu/metaphlan2)．

主坐标分析图

使用t-分布式随机邻居嵌入(t-SNE, R包Rtsne)生成主坐标分析图²²利用布雷-柯蒂斯不相对性，⁠,在那里x_如果表示物种的丰度年代在示例我，作为距离的度量。在下游分析中比较受体和供体样本时，使用1 - BC作为相似性度量。

微生物多样性

微生物丰富度(α多样性)使用香农多样性指数测量，⁠在物种层面的数据上。有反应者和无反应者之间的差异使用Student's进行测试t测试。

全基因组霰弹枪数据的功能量化

使用HUMAnN2对样本进行功能分析(http://huttenhower.sph.harvard.edu/humann2）²³由此产生的基因家族特异性丰度测量被映射到基因本体论(GO)术语。^24，25我们专注于GO中的“生物过程”层次结构，允许蛋白质注释通过GO术语之间的子-父关系向上传播。根据之前的工作，^26，27我们分离了一个“有信息的”GO术语子集，定义为与>k蛋白相关的术语，其后代术语与>k蛋白相关(这里，k = 2000，相当于每5000个UniRef50蛋白家族中的~ 1个)。该程序产生了一个全面但易于管理的247个非冗余氧化石墨烯生物过程术语集，用于后续分析。

有反应者和无反应者的分类和功能差异

有反应者和无反应者之间的微生物差异使用MaAsLin，⁵适用于微生物群落数据的线性建模系统(http://huttenhower.sph.harvard.edu/maaslin，使用默认参数)。简而言之,MaAsLin应用广义线性模型，使用每个分支作为独立的目标变量后，离群值去除(Grubbs检验)，方差稳定的arcsin平方根变换的二项数据，和错误发现率多重假设修正。以相对丰度为目标变量，拟合各类群的混合效应模型。治疗应答(应答者/无应答者)和治疗状态(治疗前/治疗后)的二元预测因子被用作固定效应。供体ID和受试者ID分别作为随机效应(MaAsLin R包中的strRandomCovariates参数)来解释供体和受试者之间的差异。

结果

所有19例患者的人口统计资料均已提交表1．所有19例患者均成功完成FMT，术中无不良事件发生。1例FMT前病情严重，FMT后8周行结肠切除术。除此之外，所有患者都完成了12周的研究期。总体而言，19名受试者中有11名(58%)在FMT后第4周表现出临床反应(HBI >3下降，cd相关药物没有升级)，并被归类为“反应者”。在“无反应者”中，有7人在研究期间需要增加与cd相关的药物。在19名受试者中，15名受试者有足够的fmt前和fmt后粪便样本进行进一步的探索性分析。

微生物相似性和多样性的全球变化

基于Bray-Curtis差异的主坐标分析显示，与健康供体相比，活动性CD患者无系统性趋势(图1一个)．供体门分布如图1所示补充数字内容1，http://links.lww.com/IBD/B320)．拟杆菌门和厚壁菌门在微生物组中占主导地位，这是健康个体的预期。一个供体有大约10%的Verrucomicrobia相对丰度，这是一种已知的肠道微生物群的正常变体。对于大多数受试者，包括许多反应者，FMT前后的样本聚集在一起，而一些反应者表现出对供体的实质性转移(图1 b)．然而，在FMT后的第4周和第8周，临床应答者与无应答者相比，移植后供者和受体之间的物种水平相似性显著更高(P分别< 0.003和0.008，图2)．接下来，我们分析了将供体物种纳入受体微生物群是否会改变其物种水平的多样性(用香农多样性衡量)。FMT后8周内，所有受试者的细菌多样性(α多样性)显著增加(P< 0.02)， FMT后临床应答者与无应答者的多样性增加更大(P< 0.03) (图3)．这些数据表明，单次结肠镜FMT可以在短期内改变活动性乳糜泻患者的粪便细菌组成，这些改变增强了肠道菌群的多样性。

特定细菌家族和代谢途径的转变

在FMT前后对受试者进行了先前与乳糜泻相关的特定细菌家族的评估。⁴在基线,Veillonellaceae在所有实验中都存在，肠杆菌科在93%的受试者中发现，巴斯德氏菌科60%的人Fusobacteriaceae在27%。在供体中，与CD患者相比，这4个细菌家族在基线时的丰度较低(供体/ CD患者的平均±SD丰度:Veillonellaceae, 2.2e⁻³±4.2 e⁻³/0.034±0.056;肠杆菌科,7.3 e⁻³±8.7 e⁻³/0.022±0.027;Pasteurellaeae 6.7 e⁻⁵±1.3 e⁻⁴/ 8.9 e⁻⁴±1.2 e⁻³；Fusobacteriaceae 3.4 e⁻⁵±6.8 e⁻⁵/ 2.4 e⁻³±8.1 e⁻³)．然而，我们没有观察到FMT后这些家庭的丰度有显著变化。受体科和属水平在FMT前后的变化见图2和图3补充数字内容2而且3.，http://links.lww.com/IBD/B321而且http://links.lww.com/IBD/B322分别)。当在fmt前和fmt后的粪便样本中分析更广泛的细菌种类时，注意到显著的变化(P< 0.05，错误发现率[Q] <0.25，见表1补充数字内容，http://links.lww.com/IBD/B323)．

与无反应者相比，FMT后反应者的多种代谢途径增加(见图4，补充数字内容，http://links.lww.com/IBD/B324)．这些途径包括丝氨酸和谷氨酰胺代谢途径、叶酸代谢途径和脂质A生物合成途径。大多数应答者通路的增加与细菌细胞表面或细胞壁所需的能量代谢或成分的增加有关。本文报道的微生物数据的登录号可以在NCBI BioProject上找到:PRJNA290380。

粘膜t细胞反应

由于微生物肽影响肠粘膜中的t淋巴细胞表型，我们接下来试图确定fmt后黏膜免疫是否有改变。²⁸调节性T细胞(CD4⁺CD25⁺和CD4⁺与健康对照组相比，外周血中的Foxp3+)在IBD中的功能或数量有所下降。^29，30.然而，treg通常具有t效应细胞，因此CD127lo被认为是treg的另一个标记物。^{31，- - - - - -33}基于之前的工作，我们检查了黏膜CD4⁺CD25⁺FMT前后CD127lo T细胞。与基线比较，黏膜CD4比例明显升高⁺CD25⁺流式细胞术检测FMT后12周CD127lo T细胞(平均5% vs 2%基线，P< 0.05;图4)．临床应答者CD4比例不高⁺CD25⁺与无反应者相比，第12周CD127lo T细胞(平均5% vs 5.3%)。与Th17细胞分化相关的效应T细胞CD4(+)CD39(+)CD161(+)细胞³⁴在FMT后12周没有下降(图4 b)．

临床反应

随时间变化的疾病活动性临床指标(HBI和sIBDQ)显示在图5A、B．总体而言，随着时间的推移，HBI有显著的改善趋势(P< 0.0001)。Tukey's多重比较测试显示fmt前和fmt后HBI评分时间点的显著差异(图5)和生活质素(sIBDQ;图5 b)．虽然临床指标有所改善，但FMT后12周CDEIS或CRP评分未见变化(图5C, D)．第4周，58%(11/19)的受试者出现临床缓解(HBI下降≥3)，53%的受试者处于临床缓解(HBI <5)。在第4周有临床反应的受试者中，73%(8/11)在第8周有持续临床反应，55%(6/11)在第12周有持续临床反应。没有临床特征似乎对临床反应有任何影响(性别、疾病分布、疾病持续时间或既往用药)，尽管所有亚组分析都受到小规模的限制(数据未显示)。

安全

总体而言，FMT在活动性CD的情况下耐受良好(见表2补充数字内容，http://links.lww.com/IBD/B325)．最常见的不良事件是胃肠道相关的，典型的是轻度腹部绞痛或便秘。正如其他地方报道的那样，FMT后注意到低度和主观发烧。一名患者在FMT后一周出现荨麻疹，需要口服类固醇治疗。另一位患者对FMT无临床反应，并在FMT后8周进行手术。

讨论

这项研究首次报道了结肠镜下FMT对活动性乳糜病患者微生物和免疫参数的影响。数据表明，该技术可以增强接受者的微生物多样性，并且在这项未受控的观察性试验中，这一进展与临床反应相关。在整个研究期间，FMT对大多数参与者是安全的。然而，一些患者在FMT后出现临床恶化或无反应，需要增加cd相关药物的使用，1例患者进行了手术。由于所有患者在基线时都经历了乳糜泻耀光，我们无法确定那些没有反应的患者是单纯的疾病进展还是FMT使病情恶化。值得注意的是，进行手术的受试者在FMT前患有内科难治性疾病。

总体而言，通过临床指标衡量，参与者在FMT后症状有所改善，尽管炎症参数没有变化。这种观察有多种原因。首先，考虑到参与者数量较少，缺乏对照组，这可能是因为安慰剂效应或疾病的自然变异。后者不太可能，因为FMT前HBI评分在2周内保持稳定。FMT的剂量也可能起作用。可能需要更高或更频繁的供体微生物群剂量来改善移植和影响炎症。类似地，可能某些细菌门或家族对填充很重要，应该在fmt前富集以获得最佳反应。最后，改变肠道菌群可能只会减轻炎症症状，而不会影响潜在的炎症。乳糜泻的许多症状，如腹部绞痛、胀气、腹泻，都可能是由于炎症引起的生态失调。因此，干预生态失调可以在不调节炎症的情况下缓解症状。 Although our study has suggested a signal for FMT in active CD, more work needs to be done to elucidate the mechanisms, optimal dosing, and delivery of microbiota before being studied in large clinical trials.

IBD中FMT的数据是有限的，与2个溃疡性结肠炎中FMT的随机临床试验结果相矛盾。^14，15之前的两项观察性试验发现FMT对乳糜泻有一定疗效。^35，36这两项研究都是通过鼻胃给药供体排泄物进行的，对宿主的微生物反应描述有限，尽管Suskind等³⁵注意到没有植入的受试者没有临床获益。尽管宿主对FMT的反应是可变的，但我们的数据表明，结肠多样性的恢复与CD的临床改善有关。基线时活跃性CD的受试者结肠微生物组有显著的变异性，这可能反映了活跃性CD中注意到的生态失调。此外，我们注意到与临床反应相关的多种代谢变化可能反映了微生物多样性的改善。

先前的研究指出了与乳糜泻相关的特定家族。肠杆菌科革兰氏阴性细菌通常包括致病物种，如沙门氏菌，志贺氏菌，变形杆菌和大肠杆菌．该家族成员与结肠炎症有关，特别是通过NLRP3炎症小体增加IL-1b。^37，38在一项研究中，90%的乳糜泻患者表现为细胞内大肠杆菌．³⁹在我们的队列中，大量的肠杆菌科被发现时经常处于耀斑状态。虽然Fusobacteriaceae已被报道与囊炎患者病情严重程度增加有关⁴⁰在我们的队列研究对象中，该家族的存在最少，与疾病状态无相关性。的增加巴斯德氏菌科(主要嗜血杆菌parainfleunzae)与乳糜泻的疾病活动性相关。⁴在我们的队列中，存在巴斯德氏菌科更常出现在燃烧状态。虽然先前的观察性研究已经证明这些家族与乳糜泻的生态失调有关，但我们无法将这些细菌家族的变化与临床反应联系起来。目前尚不清楚这些关联的意义，但单个细菌家族不太可能成为疾病状态或对FMT等干预反应的强有力预测因素。

粘膜T细胞分析表明，Tregs (CD4⁺CD25⁺CD127lo)，而Th17表型细胞(CD4⁺CD39⁺CD161⁺)在FMT之后。这些变化可能是由微生物组的改变引起的，但在没有对照组的情况下，这些假设无法从本研究中得到证实。

结肠镜FMT治疗活动性乳糜泻总体上是安全的。不良事件与其他FMT研究相似，主观性发热和寒战以及腹部绞痛和肠道模式改变是常见的。一名患者在FMT后出现荨麻疹，强调了供体粪便中生物活性成分的重要性。只有1名受试者在FMT后症状明显恶化。FMT后两周，患者的HBI从9增加到20，患者在2个月内进行了手术。该患者在FMT前患有难治性疾病。据报道，高达四分之一的IBD患者在FMT后出现IBD耀斑梭状芽孢杆菌虽然尚不清楚这是否与FMT、感染、手术过程或疾病的自然进展有关。^12，13然而，鉴于这一发现，告知患者FMT有可能导致乳糜泻发作是很重要的。

我们的研究由于缺乏对照组和样本量小而受到限制。然而，这项研究是探索性的，因此，并不是为了评估FMT是否是一种有效的CD治疗方法。FMT后的临床反应可能与疾病的自然变异或安慰剂效应有关。尽管微生物图谱增加的相似性之间的联系令人兴奋，但重要的是要注意我们不能推断因果关系。得到改善的受试者可能会自然地发展出更多样化的微生物群。此外，我们无法完全解释在研究期间饮食和非ibd药物的使用，这可能会对微生物组产生影响。虽然我们的微生物分析是可靠的，但它是基于粪便样本，这可能不如粘膜活检准确。我们选择在FMT前不使用抗生素，因为这种策略在IBD中没有得到证实。虽然这可能会减少微生物群的植入，但FMT前的抗生素也可能会影响潜在的CD，因此很难评估抗生素或FMT是否会导致FMT后的变化。最后，7名受试者需要增加与cd相关的药物，这可能是导致微生物组变化的原因。所有这些受试者都被归类为无应答者，因此，与cd相关的药物增加了微生物多样性，这可能会使我们的结果偏向零假设。

我们证明FMT治疗乳糜泻是安全的，并通过增加结肠微生物群的整体多样性潜在地改善特定患者的症状。临床反应者更有可能拥有fmt后的微生物群，与他们的供体相似，而非反应者则没有转向他们的供体。虽然最终需要进行FMT的随机对照试验来评估FMT在乳糜泻中的临床疗效，但我们的研究结果表明，未来的研究应集中于确定供体微生物群的组成部分，从而减少潜在的致病性细菌家族，并确定细菌群落和肠道炎症之间的联系。总之，FMT在活动性CD中是安全的，并且可以通过增加微生物组的多样性来诱导特定患者的临床缓解。

致谢

作者感谢Ciaran Kelly, Dan Leffler和David Yassa对这项研究的监管监督，以及David Rubin和Stacey Kahn对IND的帮助。

参考文献

作者指出