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利用宽范围(通用)探针和引物组实时PCR测定细菌负荷
摘要
设计和评价一套用于16S rDNA扩增的通用引物和探针细菌用实时荧光定量PCR法估计细菌总载量。通过测试从34种细菌中分离出的DNA,确认了通用检测系统的广泛特异性《伯吉测定细菌学手册》.然而,作为标准的染色体DNA的性质是至关重要的。由于16S rDNA拷贝数的变化和细菌生成时间对该数量的影响,代表在特定生境中最可能占主导地位的细菌的DNA标准对于更准确地确定细菌总负载很重要,因为快速生长可能导致多个复制分叉,因此,实际上,染色体部分的多个副本。通过列举人工混合样品中的细菌数量,证实了应用这些警告估计细菌负荷的有效性在体外并且在临床龋齿牙本质样本中。考虑到这些参数,在龋牙本质中设置的通用探针和引物估计的厌氧菌数量比培养方法检测到的细菌总负荷大40倍,显示了实时PCR在这种环境分析中的实用价值。
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6-FAM, 6-carboxyfluorescein,ANGIS,澳大利亚国家基因组信息服务,腐烂的牙本质,CT,阈值周期,检测细菌,rDNA拷贝数,实时PCR (TaqMan),RTF,运输液减少,TAMRA, 6-carboxy-tetramethylrhodamine,Td,细菌倍增时间,Tm, DNA的熔化温度而且普遍调查
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/内容/杂志/微/ 10.1099 / 00221287-148-1-257
2002-01-01
2022-10-02
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利用宽范围(通用)探针和引物组实时PCR测定细菌负荷
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