文摘

背景。实验数据表明减少Faecalibacterium prausnitzii(f . prausnitzii)是在粪便样本证实炎症性肠病(IBD)患者。大量的观察性研究有疑似失调,一个不平衡保护和有害细菌与炎症性肠病的病因和发病机理有关。方法。Medline和EMBASE, Pubmed等等。2搜查了独立的评论家。48抽象了,11个研究满足我们的入选标准(主题 )。荟萃分析与审查经理执行5.2。结果。的细菌数f . prausnitzii在IBD患者显著降低( 比健康对照组)log10 CFU / g粪便( )log10 CFU / g粪便; 。标准化意味着差异f . prausnitzii在IBD患者−0.94(95%可信区间[CI]:−1.07 - 0.80−)。亚组分析显示趋势更大影响乳糜泻(SMD:−1.13, 95%置信区间CI: 1.32 - 0.94−−)相比,加州大学(SMD:−0.78, 95%置信区间CI: 0.97 - 0.60−−)。结论。丰富的f . prausnitzii在IBD患者与健康对照组相比下降。此外,减少f . prausnitzii和肠道菌群的misbalance尤其在CD患者回肠参与。

1。介绍

IBD怀疑来自宿主之间的相互作用的遗传背景、粘膜免疫,常驻菌群(1]。全基因组关联研究(GWAS)已经确定了160多宿主的遗传变异。许多有关人类肠道微生物群(2]。在炎症性肠病(IBD)患者,微生物群的组成和多样性总是改变(3]。潜在的“有益的”之间的不平衡和潜在的有害细菌,也称为生态失调,扮演一个角色在慢性粘膜炎性病变的炎症性肠病的发病机制4]。

f . prausnitzii属于厚壁菌门的门的主要细菌leptum梭状芽胞杆菌组。人类肠道的荟萃分析显示的项目f . prausnitzii是最丰富的厌氧细菌之一在人类肠道微生物群,与粪便中的细菌总数的5%左右的比例(5]。f . prausnitzii扮演着一个重要的角色在提供能源colonocytes和维护肠道健康6]。此外,还有新兴的实验室证据说明强大的抗炎效果f . prausnitzii在体外和体内。和不足f . prausnitzii可能会引发和增强炎症(7]。特别,显著负相关关系的疾病活动和计数的f . prausnitzii被发现在UC患者中,即使在静止的疾病(8]。的损耗f . prausnitzii未经治疗的患者中观察到的CD,但不是慢性腹泻患者,建议pathomechanisms CD[的关系9]。最后,减少患病率和丰富的f . prausnitzii显示在IBD患者的粪便样本。的f . prausnitzii水平低得多的疾病活动增加时(10]。

进一步调查之间可能的联系f . prausnitzii减少和炎症性肠病,我们进行了一项荟萃分析和系统评价来估计的相对风险f . prausnitzii减少患者和没有炎症性肠病。鉴于之前提到的实验数据,我们假设之间的关系f . prausnitzii减少和炎症性肠病。

2。材料和方法

2.1。搜索策略

本文根据执行标准指南荟萃分析和观察性研究的系统评价11]。找到相关文章的评论,我们搜索以下数据库(从开始到2013年11月):MEDLINE、EMBASE,谷歌学者,Pubmed、ACP杂志俱乐部,科克伦中央注册的对照试验,CMR,敢和水平。自由文本单词使用的搜索策略搜索的敏感性增加。使用以下搜索条件:“炎症性肠病”,“克罗恩氏病,”“溃疡性结肠炎”,“炎症性肠病”,“CD”,“加州大学,Faecalibacterium prausnitzii,”“f . prausnitzii”和“FP。“布尔操作符(或没有)被用来扩大和缩小搜索结果。搜索结果的标题和摘要检查潜在的包容。此外,引用从选定的文章进行进一步的搜索工具。

2.2。研究选择

包含在系统综述,研究必须符合下列标准建立的研究团队:(1)f . prausnitzii计数以聚合酶链reaction-denaturing梯度凝胶电泳(PCR-DGGE),终端限制片段长度多态性(T-RFLP)或荧光原位杂交(FISH),(2)对人类的研究,(3)包含一个对照组,(4)炎症性肠病和对照组相似年龄和性别相同的排水区,和(5)数据被报道,足够的计算f . prausnitzii减少炎症性肠病和对照组。研究被排除在外,如果他们使用数据从一个先前发表的研究。

2.3。数据提取

减少数据收集、报告错误和偏差2评论者独立提取数据从选定的研究使用标准化的数据提取形式。由研究团队,这些形式包括(a)标题、作者(b)、(c)日报》(d)出版,(e)研究设计,(f)纳入和排除标准,被诊断为炎症性肠病(g)方法,(h)的方法f . prausnitzii减少被诊断出,(i)的溃疡性结肠炎(UC)患者(j)的患者数量与克罗恩病(CD)、(k)的患者数量在对照组,(l)报道前使用抗生素,益生菌,或益生元IBD和控制组织,和之前(m)报道使用类固醇,5-aminosalicylates (5-ASAs)和肿瘤坏死因子-α(TNF -α炎症性肠病组)抗体药物。研究被排除在外,如果参与者使用类固醇,5-ASAs, TNF -α抗体抗生素、益生菌、益生元在过去一个月前粪便取样,这可能会影响肠道微生物群。如果需要,作者是联系关于特定问题有关他们的研究。独立评论员授予数据提取完成后,不符点被确定和审查的相关文章导致共识。

2.4。统计分析

这一分析的主要结果是标准化平均差(SMD)f . prausnitzii在IBD和控制。Std.平均差是用来描述的计数f . prausnitzii在IBD患者和控制。我们计算了SMD 95%可信区间(CI)基于随机模型像Mantel-Haenszel所描述的那样。荟萃分析与审查经理执行5.2。用漏斗图分析用于评估发表偏倚。一个 数据被用来衡量个人研究的比例不一致,无法解释的机会。任何异质性确定将促使亚组分析试图解释这些发现。

2.5。评估研究质量

每个研究选择评审是仔细评估研究质量的研究团队。研究质量评估使用以下标准:(1)研究设计,(2)炎症性肠病诊断方法,(3)病人登记(连续与选择)的方法,(4)的方法f . prausnitzii计数测量,(5)f . prausnitzii减少是主要或次要的研究结果。

3所示。结果

3.1。搜索结果

我们最初的搜索策略产生了58为包含潜在的文章。详细分析选定的文章后,27日详细综述了文章。随后,16篇文章不符合入选标准(1,21- - - - - -35]。排斥的原因包括:12个研究没有提供数据f . prausnitzii数量(1,21- - - - - -23,25,29日- - - - - -35]。儿科患者[2的研究只提供数据24,28]。2研究动物研究[26,27]。因此,研究[118,9,12- - - - - -20.)与1180例满足入选标准审查(图1)。


图1
流程图的研究确定了系统的审查。
3.2。研究特点

的特点,总结了包括研究表1和2。每一个研究的结果在表3。f . prausnitzii数量被表示为每克粪便log10值。最大、最早的研究之间的关系f . prausnitzii减少和炎症性肠病是在德国进行Swidsinski et al。13]。作者调查的部分石蜡包埋穿孔粪缸使用荧光原位杂交(鱼)。f . prausnitzii与高浓度内计算 μ米区域的微观领域的代表感兴趣的地区。f . prausnitzii整体低浓度不均匀分布或枚举在更大的领域 μm。

表1
包括研究的特点。
表2
质量评估纳入研究的特征。
表3
研究的结果。

8的包括研究证实的存在或强度的差异f . prausnitzii计数后变性梯度凝胶电泳(DGGE)实时聚合酶链反应(rt - PCR) [8,12,14- - - - - -18,20.]。f . prausnitzii不能培养由于其要求复杂的厌氧环境(19]。通过rt - pcr,他们能够放大,克隆,序列的细菌16 s核糖体RNA基因,分别分析粪便样本,以避免可能的错误(36]。

包括三个研究对IBD的活动和发表评论f . prausnitzii计数。王等人发现大幅下降f . prausnitzii在活跃的CD和UC患者的粪便16]。索科尔等人,Andoh等人报道低的项f . prausnitzii活跃的CD患者相比,CD患者在缓解期(18,19]。

1包括的研究检查了f . prausnitzii计数饮食治疗前后的元素(17]。这表明复苏后基本饮食是归因于低水平的肠道菌群。

1包括的研究报道之间的关系维护的临床缓解和恢复f . prausnitzii复发后人口万利拉等人发现低项f . prausnitzii有关少于12个月的缓解和复发超过1 /年(12]。

3.3。SMD的荟萃分析

总体而言,细菌计数的f . prausnitzii在IBD患者显著降低( 比健康对照组)log10 CFU / g粪便( )log10 CFU / g粪便; 。的SMDf . prausnitzii在IBD患者−0.94(95%可信区间[CI]:−1.07 - 0.80−)(图2)。亚组分析显示趋势更大影响乳糜泻(SMD:−1.13, 95%置信区间CI: 1.32 - 0.94−−)相比,加州大学(SMD:−0.78, 95%置信区间CI: 0.97 - 0.60−−)。有显著的异质性研究(包括 )。此外,发表偏倚的漏斗图分析提出了一个可能的偏见小型研究表明高SMD(图3)。


图2
森林的阴谋f . prausnitziiIBD患者减少和控制。

图3
漏斗图分析。

4所示。讨论

我们的系统回顾和荟萃分析的文献已经确定最近的研究研究之间的关系f . prausnitzii减少和炎症性肠病。大多数的最近的研究发现更高的速度f . prausnitzii减少IBD患者比控制。包括所有的11个研究发现显著降低f . prausnitzii计数在IBD患者和控制。我们的荟萃分析显示可能与减少f . prausnitziiandmisbalance肠道菌群与IBD的患者,尤其是CD患者回肠参与。的水平f . prausnitzii在两项研究极低(19,28]。王等人从活跃了活检样本CD患者,发现极低f . prausnitzii数量比凳子(28]。Andoh等人证明了不同的肠道微生物群的日本人,这表明环境因素如卫生、饮食、卫生、塑造和种族是重要的肠道微生物群(19]。然而,显著的异质性和发表偏倚的可能性限制我们确定在这个协会。此外,汉森等人挑战当前模型的保护作用f . prausnitzii在CD [24]。他们报道一个必读书粘膜Faecalibacterium儿科CD患者与控制相比,这提出了一个更动态的作用比先前成人IBD中描述的这种生物。有可能是小儿炎症性肠病的微生物特征明显不同于成人的疾病。此外,早期的宿主和微生物群对IBD可能诱导扩散f . prausnitzii扭转炎性改变,仍有待解释。

机械理论之间的微生物发病机理可能保护的好处f . prausnitzii对炎症性肠病。邓肯等人表明,葡萄糖发酵的主要终端产品f . prausnitzii菌株的大量丁酸盐(37]。丁酸肠道生理中起着重要作用,免疫系统抵御病原体入侵,调制(38]。丁酸是肠道上皮细胞的主要能量来源,这是基本元素屏障完整性的维护26]。因此,丁酸盐可能导致抗炎的效果。此外,丁酸可能通过抑制组蛋白脱乙酰酶活性抑制炎症反应,导致抑制NF -κB组蛋白的活性和hyperacetylation [12]。此外,Himmel等人发现f . prausnitzii可能诱发相对少量的il - 12和大量的il - 10和亚群在上皮和PBMC模型抑制炎症的进展(39]。而科尔等人报道,f . prausnitzii导致显著降低il - 12和干扰素-γ生产水平和更高的分泌il - 10在体外外周血单核细胞(26]。

数据的发生率f . prausnitzii减少和IBD发现文献中也有一些局限性。大部分的研究没有对参与者的治疗之前的历史如抗生素、益生菌、或可能会影响肠道微生物群益生元。因此,研究参与者被治疗失调进入研究之前,从而产生一个错误f . prausnitzii减少。另外,我们没有评估的混杂因素包括饮食和吸烟在我们的研究中,尽管这些因素可能会减少f . prausnitzii水平和粪便丁酸盐值(40]。此外,一些包括研究不清楚鉴别炎症性肠病诊断的标准。一些评论内窥镜发现或组织学的个人评论。我们也没有相关微生物群的地理和种族差异。最后,大多数研究在一个医疗中心进行。

未来的研究应该解决这些限制。确认后通过内镜和组织学炎症性肠病的诊断结果,PCR-DGGE T-RFLP或鱼f . prausnitzii数量将会启动。患者中发现f . prausnitzii减少,益生菌和益生元可以用来恢复肠道菌群的“生态平衡”。Dorffel等人报道rifaximin与水平的增加有关f . prausnitzii(9]。英夫利昔单抗和高剂量皮质醇等特定的治疗疗法被证明反向的损耗f . prausnitzii(13]。逆机制之间的联系f . prausnitzii减少和起始及延续炎症性肠病尚未定义。健康对照组年龄,sex-matched IBD的组会选择从同一地区作为炎症性肠病组和测试f . prausnitzii同样的方法。在两个组,一个彻底的历史考察以前的治疗如抗生素、益生菌、益生元,类固醇,5-aminosalicylates (5-ASAs)和肿瘤坏死因子-α(TNF -α)抗体。普利多等人报道,无论种族或地理、节段性回肠炎导致减少细菌的多样性。然而,在溃疡性结肠炎,多样性减少中国主题。它还表明种族可能发挥重要作用在炎症性肠病的发病机制41]。

5。结论

总之,我们荟萃分析和系统评价建议一个可能的防护效益f . prausnitzii对炎症性肠病的发展。然而,重大变化的研究和发表偏倚的可能性限制这个协会的确定性。因此,益生菌和益生元等进一步治疗来增加的水平f . prausnitzii在炎症性肠病导致的尝试。如果f . prausnitzii发现确实防止炎症性肠病,我们可以等方法治疗补充的微生物产生丁酸。

利益冲突

作者宣称没有利益冲突有关的出版。

作者的贡献

所有作者的贡献同样研究。

承认

这项研究是由美国国家科学基金会支持中国。81170362和81170362)。