严格素食者粪便微生物多样性的分子分析和培养测定
- PMID:12597356
- DOI:10.1111 / j.1348-0421.2002.tb02769.x
严格素食者粪便微生物多样性的分子分析和培养测定
摘要
采用16S rDNA文库法、末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)分析和基于培养的方法测定了一名严格素食妇女的粪便微生物多样性。16S rDNA文库是用细菌特异性引物从提取的粪便DNA中生成的。随机选择克隆进行部分测序。使用扩增的16S rDNA进行T-RFLP分析。用HhaI和MspI消化后分析T-RF的长度。培养的菌株进行16S rDNA部分测序。在获得的183个克隆中，约29%的克隆属于13个已知物种。剩下的无性系中约71%为新的“系统型”(克隆序列相似性至少为98%)。16S rDNA文库共鉴定出55个种或系统型，培养菌株共鉴定出22个种或系统型。此外，从16S rDNA文库中检测到许多新的系统型。 The 16S rDNA library and isolates commonly included the Bacteroides group, Bifidobacterium group, and Clostridium rRNA clusters IV, XIVa, XVI and XVIII. T-RFLP analysis revealed the major composition of the vegetarian gut microbiota were Clostridium rRNA subcluster XIVa and Clostridium rRNA cluster XVIII. The dominant feature of this strictly vegetarian gut microbiota was the detection of many Clostridium rRNA subcluster XIVa and C. ramosum (Clostridium rRNA cluster XVIII).
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