用于分解代谢基因分离的环境宏基因组文库的底物诱导基因表达筛选
生物科技Nat》.
2005年1月.
摘要
最近人们意识到,环境中的大多数微生物对培养具有抗药性,这促使科学家直接从环境宏基因组中克隆有用的基因。宏基因组方法目前有两种筛选方法,即基于核苷酸序列的筛选和基于酶活性的筛选。在此,我们引入并优化了分离新型分解代谢操纵子的第三种方法,即底物诱导基因表达筛选(SIGEX)。这种方法是基于这样一种知识,即分解代谢基因的表达通常是由相关底物诱导的,在许多情况下,由靠近分解代谢基因的调控元件控制。为了使SIGEX具有高通量,我们构建了一个操作子陷阱gfp表达载体,可用于霰弹枪克隆,允许通过荧光激活细胞分选在液体培养中选择阳性克隆。通过对地下水宏基因组库中芳烃诱导基因的克隆和随后的基因组信息学分析,证明了SIGEX的实用性。
评论
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宏基因组筛选的问题。Nat biotechnology . 2005 9月23日(9):1045;作者回复1045 - 6。doi: 10.1038 / nbt0905 - 1045 a。 生物科技Nat》。2005。 PMID:16151386 没有可用的抽象。
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