血清蛋白分析炎性肠道疾病患者使用选择性固相体积提取,matrix-assisted激光解吸/电离飞行时间质谱分析和最优化的数据分析
从属关系
- PMID:18022963
- DOI:10.1002 / rcm.3323
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血清蛋白分析炎性肠道疾病患者使用选择性固相体积提取,matrix-assisted激光解吸/电离飞行时间质谱分析和最优化的数据分析
快速Commun质量范围。
2007年。
文摘
新生物标志物的鉴定或疾病相关蛋白质指纹和炎症性肠病(ibd)代表的一个主要任务诊断、预后和药物治疗。为了解决这些问题,一个简单而快速的分析蛋白质组学方法血清蛋白分析基于选择性beads-based大部分固相萃取,matrix-assisted激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和最优化数据分析。从健康受试者血清蛋白质(22)和克罗恩病的患者(15)和溃疡性结肠炎(26)是根据反相(C18),选择性地提取强阴离子交换(SAX)和金属离子亲和(IDA-Cu (II))的原则。这种方法允许浓缩的血清蛋白质/多肽由于高交互分析物之间的表面和固相、高恢复由于洗脱步骤MALDI-target板上直接执行。MALDI-TOF血清蛋白的概要文件被收购了,女士,经过数据预处理步骤,分析了线性判别分析(LDA),一个最优化分类技术,为了在健康受试者血清样本进行分类和炎症性肠病(ibd)患者。自谱光谱中大量的变量(超过16000 m / z值)防止LDA的使用,这些变量被减少到10 - 20特征选择,从而使评价模式的m / z值判别高权力。血清蛋白通过反相萃取和20 m / z值的选择了最好的整体预测能力(96.9%)。这些m / z值的识别可能允许识别的蛋白质生物标记物参与炎症性肠病。
版权(c) 2007年约翰·威利& Sons有限公司
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