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。 2011年4月,17 (4):875 - 83。
doi: 10.1002 / ibd.21442。 Epub 2010年8月30日。

蛋白质组学分析的粘膜和粘膜下层的结肠组织收益率蛋白质区分炎性colitides签名

Amosy E M 'Koma1, 艾琳·H斯利, 玛丽K华盛顿, 大卫一个施瓦兹, 罗伯塔马尔登L, 艾伦·J Herline, 保罗·E明智, Richard M Caprioli
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蛋白质组学分析的粘膜和粘膜下层的结肠组织收益率蛋白质区分炎性colitides签名

Amosy E M 'Komaet al。 Inflamm肠说。 2011年4月。
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文摘

背景:区分溃疡性结肠炎(UC)克罗恩氏结肠炎(CC)是很困难的,可能导致高达30%的准确诊断炎症性肠病(IBD)患者。大部分的诊断的不确定性来自临床和组织学特征的重叠。Matrix-assisted激光解吸/电离质谱法(MALDI-MS)允许histology-directed细胞蛋白质分析的组织。作为一个试点研究,我们评估的能力histology-directed MALDI-MS来确定潜在的CC和加州大学之间的差异蛋白质组学模式标本。

方法:粘膜和粘膜下层的层CC和溃疡性结肠炎结肠切除术的组织学评估后样品进行了分析。确定MALDI-MS是否区分炎症,uninflamed (n = 21)和炎症黏膜下层(n = 22)比较在加州大学和uninflamed (n = 17)与炎症黏膜下层在CC (n = 20)。是否有colitides蛋白质组学差异,uninflamed UC的黏膜下层(n = 21)比较与uninflamed CC黏膜下层(n = 17),发炎的加州大学黏膜下层(n = 22)比较与发炎CC黏膜下层(n = 20),以及加州大学粘膜与CC粘膜发炎红肿。成对的子集进行统计比较。

结果:两两比较分析的临床组允许识别的特征子集重要分类。发炎和uninflamed CC黏膜下层的比较显示两个明显的峰值:m / z 6445 (P = 0.0003)和12692 (P = 0.003)。在发炎的情况下与uninflamed UC黏膜下层,几个重要的微分峰被发现,但分类则是更糟。加州大学之间的比较蛋白质组学光谱的炎症黏膜下层和CC确定了两个离散显著峰值:m / z 8773 (P = 0.006)和9245 (P = 0.0009)。加州大学之间的比较蛋白质组学光谱uninflamed黏膜下层和CC确定三个离散显著峰值:m / z 2778 (P = 0.005), 9232 (P = 0.005), 9519 (P = 0.005)。加州大学之间没有显著不同的特点被发现和CC粘膜发炎。

结论:MALDI-MS能够区分CC和加州大学的标本,同时分析结肠黏膜下层。进一步的分析和蛋白质鉴定差异蛋白峰可能帮助准确地诊断炎症性肠病和开发适当的个性化治疗。

数据

图1
图1
工作流对于histology-directed剖析MALDI女士结肠粘膜和粘膜下组织隔间。答:组织切片放在MALDI目标B:区域标记)的显微照片C:的)的照片覆盖在一幅MALDI板D:矩阵应用MALDI板上指定的)位置E:光谱矩阵产生的斑点
图2
图2
两个个体蛋白质峰(米/z之间的6445年和12692年)歧视性uninflamed与炎症黏膜下层CC。红(上)显示了炎症组和蓝色显示uninflamed组。每组的平均光谱显示在左边的第一列和个人光谱在第二列在右边。LNOCV统计分析显示稳定的错误率为14%(平均光谱中的轻痕迹表示25和75%百分位数)。
图3
图3
两个个体蛋白质峰(米/z之间的8773年和9245年),是歧视性的炎症黏膜下层在加州大学和CC。红线(下)显示了UC组和蓝线(上)显示了CC组。光谱每组的值显示在左边的第一列和个人光谱在第二列在右边。LNOCV统计分析显示80%的准确性。(轻的痕迹的平均光谱表明25和75%百分位数)。
图4
图4
三个个体蛋白质峰(米/z2778年、9232年和9519年)之间的歧视性uninflamed黏膜下层在加州大学和CC。红线(下)显示了UC组和蓝线(上)显示了CC组。光谱每组的值显示在左边的第一列和个人光谱在第二列在右边。LNOCV统计分析显示80%的准确性(轻的痕迹的平均光谱表明25和75%百分位数)。
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