doi: 10.1016 / j.ajhg.2010.11.011。
Epub 2010年12月17日。
GCTA:全基因组复杂特征分析的工具
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- PMID:21167468
- PMCID:PMC3014363
- DOI:10.1016 / j.ajhg.2010.11.011
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GCTA:全基因组复杂特征分析的工具
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对大多数人类复杂疾病和特征,单核苷酸多态性被全基因组关联研究(GWAS)解释遗传性的只有一小部分。这里我们报告一个用户友好的软件工具,称为全基因组复杂特征分析(GCTA),开发基于我们最近所开发的一种方法解决“遗传缺失”的问题。GCTA估计方差解释所有的单核苷酸多态性与染色体或基因组整体的一个复杂的特点,而不是测试协会的任何特定的SNP的特质。我们介绍GCTA的五个主要功能:数据管理、单核苷酸多态性的遗传关系,估计混合线性模型方差分析解释为单核苷酸多态性,连锁不平衡结构的估计,GWAS模拟。我们关注的功能估计方差解释为X染色体上所有的单核苷酸多态性和测试计量补偿的假设。GCTA软件是一个多功能的工具来估计和分区复杂性状变异大GWAS数据集。
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