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。 2012年1月,17 (1):171 - 80。
doi: 10.1111 / j.1369-1600.2011.00395.x。 Epub 2011年10月18日。

全基因组重要的酒精依赖之间的联系和ADH基因簇的一个变体

约瑟夫·弗兰克1, 斯文Cichon, Jens Treutlein, 莫妮卡骑, Manuel Mattheisen, 每霍夫曼, Stefan爱马仕, 诺伯特•Wodarz, 迈克尔Soyka, 彼得Zill, 沃尔夫冈•迈尔, Rainald Mossner, 沃尔夫冈Gaebel, 诺伯特•Dahmen, 诺伯特•Scherbaum, 克里斯汀Schmal, 迈克尔·斯蒂芬斯, Susanne Lucae, 马库斯·伊辛, 伯特伦Muller-Myhsok, 马库斯·M Nothen, 卡尔曼, 福尔克基弗, Rietschel玛塞拉
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全基因组重要的酒精依赖之间的联系和ADH基因簇的一个变体

约瑟夫·弗兰克et al。 成瘾医学杂志。 2012年1月。
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文摘

酒精依赖(广告)是一个重要的全球疾病负担的因素。广告涉及环境和遗传因素的病因,疾病有遗传可能性约为50%。本研究的目的是确定易感基因的广告执行全基因组关联研究(GWAS)。样本包括1333名男性住院病人有严重的广告根据精神障碍的诊断与统计手册第四版,2168控制。其中包括487名患者和1358名对照从先前的GWAS研究我们的集团。个人都是德国血统的。Single-marker测试和多基因参考分析评估多个标记的综合贡献进行小的影响。的单核苷酸多态性(SNP) rs1789891位于ADH1B之间和ADH1C基因,实现全基因组意义(P = 1.27 e-8,比值比(或)= 1.46)。其他标记从这个地区也与广告有关,和有条件的分析表明,这些部分独立的贡献。苏格兰民族党rs1789891与功能性Arg272Gln变体完全连锁不平衡(P = 1.24 e -,或= 1.31)的ADH1C基因,已报告修改的乙醇氧化乙醛体外。 A polygenic score-based approach produced a significant result (P = 9.66E-9). This is the first GWAS of AD to provide genome-wide significant support for the role of the ADH gene cluster and to suggest a polygenic component to the etiology of AD. The latter result may indicate that many more AD susceptibility genes still await identification.

数据

图1
图1
散点图显示前两个主成分的主成分分析(PCA)后删除离群值。
图2
图2
Quantile-quantile-plot预期和观察协会测试假定值之前——(红色)后(灰色)和质量控制(QC)。假定值< 1 e-8标有三角形顶端的阴谋。
图3
图3
曼哈顿的情节集中GWAS样本逻辑回归假定值的测试常染色体标记。红色虚线显示了基因组广泛意义的水平(p = 5 e-8)。
图4
图4
说明假定值的±500 kb间隔在最重要的发现rs1789891 4 q包括染色体上基因注释使用临时代理工具( http://www.broadinstitute.org/mpg/snap/)。国际人类基因组单体型图计划(连锁不平衡地图 http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/)。
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