doi: 10.1152 / ajpgi.00380.2011。
Epub 2012年1月12日。
结肠微生物改变酗酒
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- PMID:22241860
- PMCID:PMC3362077
- DOI:10.1152 / ajpgi.00380.2011
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结肠微生物改变酗酒
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文摘
几项研究表明结肠微生物群的重要性在代谢和炎症性疾病和饮食对微生物群组成的重要性。酒精的影响,饮食的重要组件之一,在结肠细菌的组成在很大程度上是未知的。越来越多的证据表明,gut-derived木糖醇是饮酒导致的组织损伤和器官衰竭代数余子式酒精性肝病(ALD),只有发生在酗酒者的一个子集。我们假设长期饮酒导致改变肠道微生物群的酗酒者,这可能是负责观察炎症状态和内毒素在酗酒者。因此我们审问mucosa-associated结肠微生物在48个酗酒者,没有退化以及18名健康受试者。结肠活检样本被试分析微生物群组成使用长度异质性PCR指纹和multitag焦磷酸测序。子群的酗酒者有一个改变结肠微生物(失调)。失调平均丰度较低的酗酒者拟杆菌门和更高的变形菌门。观察到的变化似乎与高水平的血清内毒素在样品的一个子集。网络拓扑结构分析表明,饮酒与降低微生物网络的连通性,这甚至改变被认为经过一段时间的清醒。 We show that the colonic mucosa-associated bacterial microbiome is altered in a subset of alcoholics. The altered microbiota composition is persistent and correlates with endotoxemia in a subgroup of alcoholics.
数据
通过研究小组内毒素值。内毒素值在内毒素单位每毫升。当3学习小组(健康对照组(HC)与酗酒者没有肝病(ALC)与酗酒者与肝脏疾病(ALD)]比较,内毒素值在统计学上显著不同(P= 0.001;克鲁斯卡尔-沃利斯)。事后比较结果作为酒吧在图的顶部。
主坐标分析(PCO)块长度的异质性(LH) pcr指纹丰度在三维数据。轴代表第一个最高歧视轴使用布雷柯蒂斯距离测量。HC是描绘成蓝色。酒精度是描绘成绿色。ALD描绘成红色。每个点对应于1例。圆圈表示70%的椭球为每个组。
任命的PCO情节类群丰富类级别的三维。轴代表了最高前3个不同的轴使用布雷柯蒂斯距离测量。HC是描绘成蓝色。酒精度是描绘成绿色。ALD描绘成红色。微生物集群核心是用一个手动插入循环。圆被归类为dysbiotic以外的情况下。
任命由加权Unifrac距离主题组。PCO情节的受试者按主题组织使用加权Unifrac距离显示。轴代表了最高前3个不同的轴。HC是描绘成蓝色。酒精度是描绘成绿色。ALD描绘成红色。每组圆圈表示70%的椭圆体。
任命由加权Unifrac距离识别dysbiotic病例。PCO阴谋,研究小组在一个不同的角度表示dysbiotic病例。HC是描绘成蓝色。酒精度是描绘成绿色。ALD描绘成红色。情况下,远离核心HC组椭球给出了2圈,表示加权Unifrac所确定的dysbiotic案例分析。Dysbiotic病例属于酒精度和ALD组。
任命由加权距离Unifrac清醒状态。PCO的情节主题通过清醒状态使用加权Unifrac距离显示。HC是描绘成蓝色。酒精度描绘成绿色:清醒的酗酒者和酒精度描绘成浅绿色和活跃的酗酒者与酒精度描绘成深绿色。ALD描绘成红色:清醒的酗酒者ALD描绘成光红色和活跃的酗酒者与ALD描绘成黑红色。dysbiotic病例没有歧视的清醒状态。
任命加权距离Unifrac内毒素四分位数。PCO的情节主题通过内毒素象限使用加权Unifrac距离显示。内毒素四分位数增加颜色变黑了:白色、淡黄色、橙色和红色表示1(最低),2日,3日,4日(最高)内毒素四分位数,分别。dysbiotic病例被内毒素四分位数不歧视。案件中内毒素水平没有描绘绿色。
饼图门multitag焦磷酸测序数据分析的水平。常见类群是一个非常小的比例的总可能没有在图表中可见即使他们存在于传说。
条形图的平均百分比丰富的类杆菌在家庭层面的学习小组±2 SE。意思是大量的类杆菌减少酒精组(P= 0.035;克鲁斯卡尔-沃利斯)。
酒吧图的差异主要类群dysbiotic vs nondysbiotic类级别的情况下的分析方法。11例发现dysbiotic配合使用的方法研究。Dysbiotic病例百分比意味着较低丰度的拟杆菌(P= 0.016;Metastats)和杆菌和梭状芽胞杆菌(P同时= 0.016;Gammaproteobacteria Metastats)和更高的百分比平均丰度(P= 0.016;Metastats)。
大量的拟杆菌门等级次序。堆积柱状图,y4轴显示了丰富的百分比为每一个研究主题和最丰富的类群x轴组标签显示为研究主题。SA表示一个主题是清醒的酒精没有肝病;SA + ALD代表一个主题是一个冷静的酒精肝病;AA代表一个主题是一个活跃的酒精没有肝病;AA + ALD代表一个主题与肝脏疾病是一个活跃的酒鬼。拟杆菌门的数量在每一个主题是排名上升的命令和画丰富百分比。拟杆菌门用的黄色部分为每个主题酒吧。在这个堆积柱状图,其他最丰富的类群在每个主题颜色编码为:放线菌门(绿色);厚壁菌门门(红色);变形菌门门(蓝色);Archea(粉色);和所有其他序列(布朗)。丰富的拟杆菌门在约30%的水平。丰度最低的13个样本拟杆菌门已经标记在图的左下角。
连接块dysbiotic和nondysbiotic组织网络分析。每个类群表示为节点在复杂的图,和一个边是由两个节点之间,如果他们出现在同一个类及以上定义的阈值。然后我们相比网络拓扑。我们现在连通性的阴谋节点(类群)2定义的类别。
累积分布函数(CDF)从网络分析的情节主题类。每个类群表示为节点在复杂的图,和2个节点之间的连接,如果他们出现在同一个类及以上定义的阈值。然后我们相比网络拓扑。我们现在提供的每个节点度分布(类群)3定义的类别。
典范对应分析(CCA)使用内毒素作为环境变量在类级别和细菌类群。HC是描绘成黑色方块。酒精度是描绘成灰色向上三角形。ALD描绘成开放向下的三角形。
稀疏曲线由研究小组使用chao1索引。曲线显示在α-diversity没有差异。
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