比较分析发炎和non-inflamed结肠活检显示强大的蛋白质组炎症在溃疡性结肠炎患者
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- PMID:22726388
- PMCID:PMC3441502
- DOI:10.1186 / 1471 - 230 x - 12 - 76
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比较分析发炎和non-inflamed结肠活检显示强大的蛋白质组炎症在溃疡性结肠炎患者
BMC杂志。
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文摘
背景:准确的诊断和监控工具对溃疡性结肠炎(UC)失踪。我们的目的是描述加州大学和搜索标记的蛋白质组剖面与疾病恶化。因此,我们的目的是描述特定的与炎症相关的蛋白质从急性UC患者结肠黏膜利用大众spectrometry-based蛋白质组学分析。
方法:活检取样从直肠、乙状结肠、左结肠弯曲从二十活跃proctosigmoiditis和从四个健康对照组患者蛋白质组学和组织学。蛋白质组学的整个结肠活检是使用2 d-gel电泳特点,和肽质量指纹使用matrix-assisted激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)申请鉴定不同表达的蛋白质斑点。
结果:总共有597点被注释的图像分析和222个统计不同蛋白质水平发炎和non-inflamed组织在病人组。主成分分析明确分组non-inflamed样品分开发炎样本表明结肠粘膜急性溃疡性结肠炎的蛋白质组学特征是强大的。完全,43个人蛋白质斑点,包括蛋白质参与能量代谢(glycerol-3-phosphate-dehydrogenase triosephosphate异构酶,α-烯醇酶和L-lactate脱氢酶B-chain)和氧化应激(超氧化物歧化酶、硫氧还蛋白和硒结合蛋白)。
结论:一种独特的蛋白质组学的发炎组织在UC患者被发现。特定的蛋白质参与能量代谢和氧化应激被当成潜在的候选标记加州大学。
数据
主成分分析的蛋白质组的健康控制人。结果是基于2-DGE现货卷。复制从直肠活检进行分析(RE),乙状结肠(SI)和左结肠弯曲(低频)。1(+),控制人控制人2(■),4人3(♦)和控制(▴)。
主成分分析的UC患者的蛋白质组配置文件。结果是基于结果2-DGE现货卷。从直肠活检被(重新)和左结肠弯曲(低频)。低频(▴)和再保险(■)。
不同蛋白质水平在直肠和左从控制人员和UC患者结肠弯曲。(一个)Glycerol-3-phosphate-dehydrogenase(位置1)和(B)Glycerol-3-phosphate-dehydrogenase(4)现货。代表2-DGE图像四组和正常的蛋白表达相同的组平均值±标准误差。控制人员(REC和利物浦)和UC患者(代表和联赛。
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