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． 2012; 7 (6): e39743。
doi: 10.1371 / journal.pone.0039743。 Epub 2012年6月28日。

结直肠癌患者的人肠腔和粘膜相关菌群

Weiguang陈1， Fanlong刘， Zongxin凌， 小娟通， 查理香
从属关系
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结直肠癌患者的人肠腔和粘膜相关菌群

Weiguang陈et al。 《公共科学图书馆•综合》． 2012．
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摘要

最近的报道表明肠道菌群参与结肠直肠癌(CRC)的进展。我们利用基于焦磷酸测序的16S rRNA基因分析来确定结直肠癌患者和健康对照组的菌群整体结构;我们研究了肠腔、癌变组织和匹配的正常非癌变组织的菌群。此外，我们使用直肠拭子样本调查了粘膜粘附的微生物组成，因为在肠道清洁后，组织粘附的细菌群落结构可能发生改变。我们的研究结果表明，肠道腔和癌组织的微生物结构有显著差异。增强从饮食中获取能量或与宿主进行代谢交换的系统型在腔内更为丰富。腔内厚壁菌门较多，拟杆菌门和变形菌门较少。癌组织和非癌组织的整体微生物结构是相似的;但肿瘤菌群多样性较低。结直肠癌患者的肠腔菌群和粘膜粘附菌群的结构与健康人的相匹配的菌群不同。 Lactobacillales was enriched in cancerous tissue, whereas Faecalibacterium was reduced. In the mucosa-adherent microbiota, Bifidobacterium, Faecalibacterium, and Blautia were reduced in CRC patients, whereas Fusobacterium, Porphyromonas, Peptostreptococcus, and Mogibacterium were enriched. In the lumen, predominant phylotypes related to metabolic disorders or metabolic exchange with the host, Erysipelotrichaceae, Prevotellaceae, and Coriobacteriaceae were increased in cancer patients. Coupled with previous reports, these results suggest that the intestinal microbiota is associated with CRC risk and that intestinal lumen microflora potentially influence CRC risk via cometabolism or metabolic exchange with the host. However, mucosa-associated microbiota potentially affects CRC risk primarily through direct interaction with the host.

利益冲突陈述书

利益冲突:作者宣称不存在竞争利益。

数据

图1
图1。7组样品微生物区系细菌门相对丰度。
“其他”代表未分类的细菌，氯黄杆菌、退流杆菌、氯黄菌、热球菌、酸菌、planctomyetes、Lentisphaerae、螺旋体、协同菌门、tenererutes、Verrucomicrobia和蓝藻门。前8个门在粪便样本中不明显，前四个门在拭子样本中不明显。
图2
图2。基于未加权Unifrac度量的PCA图。
每个符号代表一个样本。(A) cat、stp和swp组;(B)组猫、pa2t、pa10t;(C) swp和swc组;(D) stp和stc组。
图3
图3。不同结构的肠腔和癌组织菌群。
(A)癌组织和肠腔之间统计和生物学一致性差异的分类学表示。差异由最丰富的类别的颜色表示(红色表示癌变组织，黄色不显著，绿色肠腔)。每个圆的直径与分类单元的丰度成正比。(B)差异丰度属的LDA评分直方图。claadogram采用LEfSe计算，这是一种宏基因组分析方法，在Wilcoxon Mann-Whitney检验之后进行线性判别分析，以评估每个差异丰度分类单元或OTU的效应大小;根据效果大小显示脚本。
图4
图4。CRC患者与健康对照之间显著不同属的相对丰度。
(A) swp和swc的属数不同。(B) stp和stc之间不同的属。曼-惠特尼检验用于评估指示组间比较的重要性。* * * P < 0.05, P < 0.01。
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参考文献

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