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2014年3月28日,20 (12):3231 - 44。
doi: 10.3748 / wjg.v20.i12.3231。

生物标志物在炎症性肠病:现状和蛋白质组学鉴定策略

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生物标志物在炎症性肠病:现状和蛋白质组学鉴定策略

星期二Bennikeet al。 世界杂志
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文摘

明确诊断的两种主要形式的炎症性肠病(IBD):溃疡性结肠炎(UC)和克罗恩病(CD)是一个挑战在疾病的早期阶段。诊断可以设立几年后的首次症状。因此,蛋白质生物标记物早期、准确的诊断可以帮助临床医生个人的改善治疗的病人。此外,生物标志物可以帮助医生预测疾病课程,通过这种方式,确定需要强化治疗的患者。低风险患者疾病的耀斑可能会避免与随之而来的治疗药物不良事件的风险。此外,识别疾病和课程可以用来识别特定的生物的生物通路参与了疾病的发展和治疗。疾病机制的一般知识能够提高未来发展的预防和治疗策略。因此,生物标志物的临床使用小组代表一个诊断和预后可能很有价值的工具。近年来的技术发展在蛋白质组学研究(完整的蛋白质含量的确定和量化)使得小说的发现生物标志物的可行性。几个IBD-associated蛋白质生物标记物是已知的,但没有在日常使用中成功地实施了区分CD和UC患者。 The intestinal tissue remains an obvious place to search for novel biomarkers, which blood, urine or stool later can be screened for. When considering the protein complexity encountered in intestinal biopsy-samples and the recent development within the field of mass spectrometry driven quantitative proteomics, a more thorough and accurate biomarker discovery endeavor could today be performed than ever before. In this review, we report the current status of the proteomics IBD biomarkers and discuss various emerging proteomic strategies for identifying and characterizing novel biomarkers, as well as suggesting future targets for analysis.

关键词:生物标志物;Citrullination;克罗恩氏病;炎症性肠病;转译后的修改;蛋白质组学;溃疡性结肠炎。

数据

图1
图1
主要遇到增加蛋白质组的复杂性,从基因RNA转录并最终成熟,往往转译后的修改修改,蛋白质(proteoforms)。
图2
图2
两个常用的质谱技术。Matrix-assisted激光解吸/表面增强激光解吸/ ionizatio飞行时间质谱(MS),肽或蛋白质样品在哪里干目标板上。随后,使用激光蒸发干燥样品,和生成的气相离子由质谱仪进行分析;B:液相色谱(LC)女士电喷雾电离(ESI),液体的肽或蛋白质样品分离LC列,和顺序筛选了通常在几个小时。筛选了肽都是直接注射到质谱仪的ESI和分析。

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