。 2015;11 (1):9-26。

doi: 10.1007 / s11306 - 014 - 0707 - 1。 Epub 2014 7月25。

英国人口的分子表型出现:定义人类血清代谢物

沃里克B邓恩¹, Wanchang林², 大卫·布罗德赫斯特³, 保罗·贝格利², 玛丽布朗², 伊娃Zelena⁴, 安德鲁一个沃恩⁴, 安东尼Halsall⁴, Nadine哈丁⁴, 约书亚·D·诺里斯⁵, 苏Francis-McIntyre⁴, 安迪曾⁴, 大卫我埃利斯⁴, 史蒂夫·欧哈根⁴, 吉尔亚伦⁶, Boben本杰明⁷, Stephen Chew-Graham⁷, 卡莉·莫斯利⁸, 宝拉·波特⁸, 凯瑟琳L络筒机⁹, 凯瑟琳Potts¹⁰, 保拉•桑顿⁸, 琼娜麦克沃特¹⁰, 默罕默德祖拜尔⁷, 马丁锅¹¹, Alistair烧伤⁷, 肯尼迪J•克鲁克香克¹², 戈登·C杰森⁸, Nitin Purandare¹³, 弗雷德里克·C W吴¹⁰, 乔·D·芬恩¹⁰, 约翰·N Haselden¹⁴, 安德鲁·W尼科尔斯¹⁴, 伊恩·D·威尔逊¹⁵, 罗伊斯顿Goodacre⁹, 道格拉斯B凯尔⁹

从属关系

¹化学工程与物理科学学院、学校,曼彻斯特理工学院的生物技术,曼彻斯特大学,曼彻斯特,M1 7 dn英国;工程与物理科学学院、曼彻斯特综合系统生物学中心曼彻斯特理工学院生物技术、曼彻斯特大学,曼彻斯特,M1 7 dn英国;学院医学和人类科学、内分泌和糖尿病中心人类发展研究所曼彻斯特大学,曼彻斯特,英国;先进的发现和实验中心疗法(学员),曼彻斯特大学中央医院NHS信托基金会,曼彻斯特学术健康科学中心,曼彻斯特,M13 9王英国;伯明翰大学生物科学学院的睡床上,英国伯明翰去往B15 2 tt,。
²化学工程与物理科学学院、学校,曼彻斯特理工学院的生物技术,曼彻斯特大学,曼彻斯特,M1 7 dn英国;学院医学和人类科学、内分泌和糖尿病中心人类发展研究所曼彻斯特大学,曼彻斯特,英国;先进的发现和实验中心疗法(学员),曼彻斯特大学中央医院NHS信托基金会,曼彻斯特学术健康科学中心,英国曼彻斯特,M13 9西城。
³化学工程与物理科学学院、学校,曼彻斯特理工学院的生物技术,曼彻斯特大学,曼彻斯特,M1 7 dn英国;医学系,Katz集团中心药房&健康、阿尔伯塔大学,加拿大埃德蒙顿,AB T6G 2 r3。
⁴化学工程与物理科学学院、学校,曼彻斯特理工学院的生物技术,曼彻斯特大学,曼彻斯特,英国M1 7 dn。
⁵工程与物理科学学院、学校的计算机科学、曼彻斯特大学、英国曼彻斯特,M13 9 pl。
⁶医学与人文科学学院研究所的炎症和修复,索尔福德皇家Dermatopharmacology曼彻斯特大学,曼彻斯特,英国M6 8高清。
⁷临床与认知神经科学、医学和人文科学学院研究所的大脑,行为和心理健康,曼彻斯特大学,曼彻斯特,英国M13 9 pt。
⁸医学和人文科学学院、研究所癌症科学,克里斯蒂医院,曼彻斯特大学,曼彻斯特,英国4 M20 bx。
⁹化学工程与物理科学学院、学校,曼彻斯特理工学院的生物技术,曼彻斯特大学,曼彻斯特,M1 7 dn英国;工程与物理科学学院、曼彻斯特综合系统生物学中心曼彻斯特理工学院生物技术、曼彻斯特大学、英国曼彻斯特,M1 7 dn。
¹⁰学院医学与人文科学,人类发展研究所,曼彻斯特大学的英国曼彻斯特,M13 9西城。
¹¹神经学和药物发现肠胃卓越中心,葛兰素史克,第三大道,哈洛,英国埃塞克斯,CM19 5啊。
¹²医学与人文科学学院心血管科学研究所,曼彻斯特大学,曼彻斯特,M13 9 pt英国;圣托马斯医院,国王学院,伦敦大学国王健康&合作伙伴,伦敦,SE1 9 nh英国。
¹³医学与人文科学学院心血管科学研究所,曼彻斯特大学,曼彻斯特,英国M13 9 pt。
¹⁴调查临床前毒理学,葛兰素史克,大卫杰克研究和发展中心,公园路,器皿,赫特福德郡,SG12 0 dp英国。
¹⁵医学院、外科学系和癌症,亚历山大·弗莱明爵士大厦,伦敦帝国理工学院、伦敦、SW7 2 az,英国;DMPK创新药物,阿斯利康,英国柴郡,SK10 4 tf。

PMID:25598764
PMCID:PMC4289517
DOI:10.1007 / s11306 - 014 - 0707 - 1

免费的PMC的文章

英国人口的分子表型出现:定义人类血清代谢物

沃里克B邓恩et al。代谢组学。 2015年。

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。 2015;11 (1):9-26。

doi: 10.1007 / s11306 - 014 - 0707 - 1。 Epub 2014 7月25。

作者

从属关系

¹化学工程与物理科学学院、学校,曼彻斯特理工学院的生物技术,曼彻斯特大学,曼彻斯特,M1 7 dn英国;工程与物理科学学院、曼彻斯特综合系统生物学中心曼彻斯特理工学院生物技术、曼彻斯特大学,曼彻斯特,M1 7 dn英国;学院医学和人类科学、内分泌和糖尿病中心人类发展研究所曼彻斯特大学,曼彻斯特,英国;先进的发现和实验中心疗法(学员),曼彻斯特大学中央医院NHS信托基金会,曼彻斯特学术健康科学中心,曼彻斯特,M13 9王英国;伯明翰大学生物科学学院的睡床上,英国伯明翰去往B15 2 tt,。
²化学工程与物理科学学院、学校,曼彻斯特理工学院的生物技术,曼彻斯特大学,曼彻斯特,M1 7 dn英国;学院医学和人类科学、内分泌和糖尿病中心人类发展研究所曼彻斯特大学,曼彻斯特,英国;先进的发现和实验中心疗法(学员),曼彻斯特大学中央医院NHS信托基金会,曼彻斯特学术健康科学中心,英国曼彻斯特,M13 9西城。
³化学工程与物理科学学院、学校,曼彻斯特理工学院的生物技术,曼彻斯特大学,曼彻斯特,M1 7 dn英国;医学系,Katz集团中心药房&健康、阿尔伯塔大学,加拿大埃德蒙顿,AB T6G 2 r3。
⁴化学工程与物理科学学院、学校,曼彻斯特理工学院的生物技术,曼彻斯特大学,曼彻斯特,英国M1 7 dn。
⁵工程与物理科学学院、学校的计算机科学、曼彻斯特大学、英国曼彻斯特,M13 9 pl。
⁶医学与人文科学学院研究所的炎症和修复,索尔福德皇家Dermatopharmacology曼彻斯特大学,曼彻斯特,英国M6 8高清。
⁷临床与认知神经科学、医学和人文科学学院研究所的大脑,行为和心理健康,曼彻斯特大学,曼彻斯特,英国M13 9 pt。
⁸医学和人文科学学院、研究所癌症科学,克里斯蒂医院,曼彻斯特大学,曼彻斯特,英国4 M20 bx。
⁹化学工程与物理科学学院、学校,曼彻斯特理工学院的生物技术,曼彻斯特大学,曼彻斯特,M1 7 dn英国;工程与物理科学学院、曼彻斯特综合系统生物学中心曼彻斯特理工学院生物技术、曼彻斯特大学、英国曼彻斯特,M1 7 dn。
¹⁰学院医学与人文科学,人类发展研究所,曼彻斯特大学的英国曼彻斯特,M13 9西城。
¹¹神经学和药物发现肠胃卓越中心,葛兰素史克,第三大道,哈洛,英国埃塞克斯,CM19 5啊。
¹²医学与人文科学学院心血管科学研究所,曼彻斯特大学,曼彻斯特,M13 9 pt英国;圣托马斯医院,国王学院,伦敦大学国王健康&合作伙伴,伦敦,SE1 9 nh英国。
¹³医学与人文科学学院心血管科学研究所,曼彻斯特大学,曼彻斯特,英国M13 9 pt。
¹⁴调查临床前毒理学,葛兰素史克,大卫杰克研究和发展中心,公园路,器皿,赫特福德郡,SG12 0 dp英国。
¹⁵医学院、外科学系和癌症,亚历山大·弗莱明爵士大厦,伦敦帝国理工学院、伦敦、SW7 2 az,英国;DMPK创新药物,阿斯利康,英国柴郡,SK10 4 tf。

PMID:25598764
PMCID:PMC4289517
DOI:10.1007 / s11306 - 014 - 0707 - 1

文摘

表型出现1200年的“健康”来自英国的成年人的调查已经完成不同的亲水、亲脂性的类代谢产物存在于血清运用一系列色谱-光谱法的平台。这些数据强劲,通过数值校正仪器零点漂移;这是先决条件,允许检测微妙的代谢差异。观察到的差异代谢物之间的相对浓度1200例从不到5%至200%以上不等。代谢物的变化可能与不同性别、年龄、体重指数、血压、和吸烟。调查显示,600名受试者的样本大小是必要的和足够的健壮的分析这些数据。总的来说,这是一个大规模的一道色谱MS-based代谢组学研究中,使用样本超过1000个人,提供一个全面的测量血清代谢物。这项工作提供了一个重要的基准或引用数据集对于理解“正常”的相对浓度和人类血清代谢物的变化。这些可能与我们增加知识的人类代谢网络图。Husermet研究的信息可在http://www.husermet.org/获得。 Importantly, all of the data are made freely available at MetaboLights (http://www.ebi.ac.uk/metabolights/).

关键词:临床生物化学;人类血清;质谱;代谢表型出现;英国的人口。

数据

图2
热图系统树图的相关代谢产物,并用gc - ms检测到网络。二十个独特的代谢产物与一个或多个最高的相关性进行描述。的*较低的酒吧*代表了*颜色代码*从成对皮尔森系数的相关性(彩色图在线)

图3
分类分析,评估样本容量的影响。歧视的准确率为95%置信区间数据获得应用UPLC-MS(+)时代的三个参数(< 50与年龄> 65岁)、体重指数(BMI < 25与体重指数> 30)和性别(男性与女性)。随机森林(RF)分类器采用和100引导程序的样本集被用于分类精度的评估

图4
箱线图显示分布的蛋氨酸亚砜为男性和女性不同年龄类别。为*每个箱子*,*中央线*的边缘,中位数吗盒子上四分位数与下四分位数,胡须扩展吗盒子进一步±1.5×四分位范围(差),和离群值(> 1.5×差)是策划作为单独的点。数据分析使用双向方差分析显示男性和女性之间的显著差异,(F(1901)= 20.3,p= 7.7×10⁻⁶]。年龄类别之间没有显著差异,性别和年龄之间没有显著的交互类

图5
箱线图显示分布的柠檬酸为男性和女性不同年龄类别。为*每个箱子*,*中央线*的边缘,中位数吗盒子上四分位数与下四分位数,胡须扩展框进一步±1.5×四分位范围(差),和离群值绘制作为单独的点(> 1.5×差)。使用双向方差分析的数据进行了分析。男性和女性之间有显著性差异(F(1779)= 79.8,p= 3.1×10⁻¹⁸)。年龄类别之间没有显著差异,性别和年龄之间没有显著的交互类

图6
箱线图显示分布的酪氨酸和色氨酸男性和女性不同年龄类别。为*每个箱子*,*中央线*的边缘,中位数吗盒子上四分位数与下四分位数,胡须扩展吗盒子进一步±1.5×四分位范围(差),和离群值绘制作为单独的点(> 1.5×差)。使用双向方差分析的数据进行了分析。有显著差异在年龄类别(< 50年与> 64年)色氨酸(F(1778)= 11.7,p= 0.0007)和酪氨酸(F(1788)= 39.1,p= 6.8×10⁻¹⁰]。跨性别类别色氨酸有显著性差异(F(1788)= 55.4,p= 2.6×10⁻¹³]。性别和年龄之间没有显著的交互分类色氨酸和酪氨酸

图7
热图和系统树图代谢物之间的皮尔逊相关分析,并用gc - ms检测和临床化学数据。集群的安排是由分层聚类代谢物和临床化学数据。的*较低的酒吧*代表了*颜色代码*皮尔森系数从成对的gc - ms数据之间的相关性和临床化学数据(彩色图在线)

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