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． 1998年3月,21(1):65 - 71。
doi: 10.1016 / s0723 - 2020 (98) 80009 - x。

16S rrna靶向寡核苷酸探针的设计和评价，用于人类粪便拟杆菌种群的特异性检测和定量

J多尔1， 一个Sghir， G Hannequart-Gramet， G Corthier， P Pochart
从属关系

16S rrna靶向寡核苷酸探针的设计和评价，用于人类粪便拟杆菌种群的特异性检测和定量

J多尔et al。 Syst应用微生物． 1998年3月．

摘要

结肠拟杆菌包括几个种类，它们的种群水平和活动对人类和动物的代谢活动和健康有重要贡献。然而，由于缺乏高度具体和可靠的枚举技术，对它们生态的了解受到了阻碍。基于现有数据库中的16S rRNA序列比较，我们设计了一个18聚寡核苷酸，该寡核苷酸针对拟杆菌-卟啉单胞菌-普雷沃氏菌群的一个常见和特异性区域。我们已经测试了探针的特异性及其在人类粪便样本研究中的有用性。在实验优化的杂交条件下，该探针可以相似地识别来自拟杆菌-卟啉单胞菌-普雷沃氏菌组8种40株菌株的rDNA。重要的是，它没有识别出代表人类主要粪便菌群8个属的31株微生物。在选定的两个人粪便菌群优势菌群中，用种特异性单克隆抗体免疫印迹法鉴定为寻常芽孢杆菌的菌株均被探针检测到。采用菌落杂交法对儿童和成人粪便标本中拟杆菌群微生物总数进行计数。文中描述的探针进一步用于定量RNA印迹，以监测来自85至125日龄儿童的冷冻粪便样本中拟杆菌群与双歧杆菌属的波动。它将适用于其他厌氧环境的类似调查。

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