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附言
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大便频率与肠道微生物群组成
  1. 今天Hadizadeh1,2,
  2. 苏珊娜沃尔特3,
  3. Meriem Belheouane4,5,
  4. 费迪南Bonfiglio1,
  5. Femke-Anouska Heinsen6,
  6. 安娜Andreasson7,8,
  7. 佬司Agreus7,
  8. 佬司Engstrand9,10,
  9. 约翰·F·贝恩斯4,5,
  10. 约瑟夫椽1,
  11. 安德烈因特网6,
  12. 毛罗·D’amato1,11
  1. 1生物科学和营养,卡罗林斯卡医学院,斯德哥尔摩、瑞典
  2. 2学校的营养,伊斯法罕大学医学科学,伊斯法罕,伊朗
  3. 3胃肠病学分工,临床和实验医学机构,林雪平大学,林雪平、瑞典
  4. 4马克斯普朗克进化生物学,Plon、德国
  5. 5实验医学研究所Christian-Albrechts-University基尔,基尔、德国
  6. 6临床分子生物学研究所基尔大学,基尔、德国
  7. 7划分为家庭医学、神经生物学、保健科学和社会,卡罗林斯卡医学院,斯德哥尔摩、瑞典
  8. 8斯德哥尔摩大学压力研究所,斯德哥尔摩、瑞典
  9. 9微生物学、肿瘤和细胞生物学,卡罗林斯卡医学院,斯德哥尔摩、瑞典
  10. 10临床基因组学工具,生命科学实验室,斯德哥尔摩、瑞典
  11. 11BioCruces健康研究所和IKERBASQUE,巴斯克的基础科学,毕尔巴鄂、西班牙
  1. 对应到毛罗·D’amato教授BioCruces健康研究所,十字形大学医院,Barakaldo 48903年,西班牙;mauro.damato在{}osakidetza.eus,mauro.damato在{}ki.se

http://dx.doi.org/10.1136/gutjnl - 2016 - 311935

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    我们怀着极大的兴趣读两个Vandeputte最近的通讯等1和Tigchelaar等,2报道一个粪便一致性和肠道微生物群组成之间的联系。两项研究集中在凳子上的一致性,根据布里斯托粪便规模(BSS)为主要特征,由于其报道相关结肠转运时间(CTT)的临床相关性几个胃肠疾患。然而,大便频率,人类肠功能的另一个特点是容易测量和记录,也被证明与CTT,3,4比大便形状虽然在较小程度上,尚未调查与微生物群组成。

    我们检查了肠道微生物群和大便频率之间的关系在以人群为基础的结肠镜检查的研究中,一般以人群为基础的队列从斯德哥尔摩,瑞典,先前详细描述。5六十九人(21 48雄性和雌性,55.6±10.33岁)与可用冷冻粪便样品和日常的录音通便模式(排便数量和相关的BSS分数从1周日记)同期(12.2±16.8天)。平均每日大便频率和BSS参与者的分数1.38(范围0.57 - 3)和3.91(范围1.5 6),分别和这两个措施显著相关(斯皮尔曼p = 0.007, r = 0.32)。粪便细菌的DNA提取使用easyMAG NucliSens工具包(Biomerieux)和v2 v1 16 s rRNA基因高变区放大使用27个f (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和338 r (5′-TGCTGCCTCCCGTAGGAGT-3′)前引物测序的Illumina公司MiSeq平台。数据处理是使用Mothur执行(http://www.mothur.org/)的正常数据集10 000读/样本,这是用于分类分类和操作分类单位的任务。α-diversity计算使用素食和phyloseq R包。

    类似于Vandeputte等之间的负相关,我们发现粪便一致性和观察到的物种和Chao1α-diversity指数。信仰的系统发育多样性和Shannon-Weaver熵(也显示类似的负相关性图1)。然而,更强大和更显著的相关性观察每日大便频率(图1B)。类似的结果在排除患有肠易激综合症(n = 9),确定了基于共识罗马从问卷数据标准。

    Correlation between α-diversity indices, stool consistency and stool frequency. Observed species (Observed sp.), Chao1, Faith's phylogenetic diversity (PD) and Shannon–Weaver (Shannon) indices are plotted on the same graph, omitting relative scale units for simplicity, together with their respective statistics. (A) Mean daily stool consistency scores based on the Bristol Stool Scale. (B) Stool frequency expressed as mean nr of bowel movements per day.
    " data-icon-position="" data-hide-link-title="0">图1
    图1

    α-diversity指数之间的相关性,粪便一致性和大便频率。观察到的物种(sp。)、Chao1信仰的系统发育多样性(PD)和Shannon-Weaver (Shannon)指标是绘制在同一图,省略相对规模单位为简单起见,连同各自的统计数据。(A)意味着每天粪便一致性分数基于布里斯托尔的凳子上。(B)大便频率表示为代表的nr每天排便。

    在单独的分类水平,拟杆菌的比率:厚壁菌门和拟杆菌:unclassified_Ruminococcaceae显示与大便频率显著相关性(枪兵;p = 0.017;r = 0.29, p = 0.0001;分别为r = 0.45),但与一致性(p > 0.05)。类似于Tigchelaar等,我们不能复制Vandeputte等1BSS联想到特定的属,虽然其中的一些协会与大便频率在我们的样本(q = 0.015;r = 0.35拟杆菌和q = 0.021;r =−032Oxalobacter)。测试10时在我们的数据集最丰富的属,最高的(消极的)相关的意思是凳子被观察到的频率unclassified_Ruminococcaceae(r =−0.44 q = 0.002)。Alistipes和Oscillobacter也负相关(各自q = 0.049;r =−0.27和q = 0.0021;r =−0.42)。类似的结果观察粪便一致性(数据未显示)。最后,符合Tigchelaar BSS的发现,我们没有发现性别之间的相关性大便频率和微生物群组成。我们的结果添加到积累证据表明肠转运时间人类肠道微生物群组成,而权证大规模调查的潜在影响,更频繁的结肠内容更新可能在肠道生态系统,最终确定肠道粪便内容和相关的微生物群组成。

    总之,尽管个别人口属性固有的差异,粪便收集方法和分析协议,这和以前的报告提供令人信服的证据表明人类通便模式之间的相关性(粪便一致性和频率)和几个指标的粪便微生物群组成。尽管(最终)因果关系仍知之甚少,这些发现很重要,因为它们有助于描述肠道微生物群,研究它在健康和疾病中的作用。

    确认

    我们要感谢脱硫研究培训集团轮胎式龙门吊1743/1-Genes,环境和炎症(基尔大学)。

    引用

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      OpenUrl CrossRef PubMed

    脚注

    • 贡献者医学博士最初的想法,设计了研究与房颤;西南,AA, LE和LA收集材料,研究对象和获得的数据为特征的;F-AH,房颤与JFB微生物群进行测序;数据分析和解释由跳频,MB, FB, JR。FH, MD和JR起草与重要的修订手稿的作者。

    • 资金支持的资金从瑞典研究理事会(Vetenskapsradet)医学博士;欧盟第七框架计划(fp7/2007——2013年,格兰特数字262055,ESGI)医学博士和房颤;伊朗卫生部和医学教育跳频。

    • 相互竞争的利益没有宣布。

    • 伦理批准瑞典斯德哥尔摩卡罗林斯卡医学院。

    • 出处和同行评议不是委托;内部同行评议。