你在这里

  • 家
  • 存档
  • 72年卷4
  • 小说microenvironment-based肝内胆管癌的分类与治疗的影响

条文本

菜单条
下载PDF
肝脏病学
原始研究
小说microenvironment-based肝内胆管癌的分类与治疗的影响
  1. 米格尔的Martin-Serrano1,
  2. 本杰明Kepecs2,
  3. 米格尔Torres-Martin3,
  4. 艾米丽R Bramel1,4,
  5. 菲利普·K哈伯1,
  6. 艾略特梅里特2,5,
  7. 亚历山大Rialdi1,6,
  8. Nesteene欢乐参数4,6,
  9. Maeda Miho1,
  10. 凯瑟琳·E Lindblad1,4,5,6,
  11. 詹姆斯·K·卡特1,4,
  12. 玛丽娜Barcena-Varela1,5,6,
  13. Vincenzo Mazzaferro7,
  14. Myron施瓦茨8,
  15. 西尔维亚Affo9,
  16. 罗伯特F施瓦贝10,
  17. 奥古斯托。维兰纽瓦1,
  18. 埃内斯托古奇奥尼1,6,
  19. 斯科特·L·弗里德曼1,
  20. 基本上Lujambio1,4,5,6,
  21. 安娜Tocheva2,5,
  22. 约瑟米Llovet1,3,11,
  23. 天鹅N Thung12,
  24. 亚历山大·M Tsankov2,
  25. 丹妮拉新航1
  1. 1的肝脏疾病,医学系的Tisch癌症研究所,肝癌项目,伊坎在西奈山医学院,纽约,纽约美国
  2. 2遗传学和基因组科学,伊坎在西奈山医学院,纽约,纽约美国
  3. 3转化研究在肝肿瘤、肝单元,IDIBAPS、医院诊所,巴塞罗那大学,巴塞罗那,加泰罗尼亚、西班牙
  4. 4生物医学科学研究生院,伊坎在西奈山医学院,纽约,纽约美国
  5. 5精度免疫学研究所(PrIISM),伊坎在西奈山医学院,纽约,纽约美国
  6. 6肿瘤学系,Tisch癌症研究所,伊坎在西奈山医学院,纽约,纽约美国
  7. 7普通外科肝移植单位、部门的肿瘤学和Hemato-Oncology,米兰大学史重回肿瘤,IRCCS基础,米兰,伦巴蒂大区、意大利
  8. 8肝癌外科学系,Tisch癌症研究所项目,伊坎在西奈山医学院,纽约,纽约美国
  9. 98 d研究所'Investigacions Biomediquesπ纽约州立大学(IDIBAPS),巴塞罗那,加泰罗尼亚、西班牙
  10. 10医学系的,哥伦比亚大学,纽约,纽约美国
  11. 11Institucio Catalana de Recerca我Estudis Avancats,巴塞罗那、西班牙
  12. 12肝癌病理学系的程序,伊坎在西奈山医学院,纽约,纽约美国
  1. 对应到达妮埃拉新航博士的肝脏疾病,医学系,Tisch癌症研究所,肝癌项目,伊坎在西奈山医学院,纽约,纽约,美国;daniela.sia在}{mssm.edu

文摘

客观的肿瘤微环境的多样性(身上)的肝内胆管癌(iCCA)尚未全面评估。我们旨在产生一个新的分子iCCA基质的分类器,包含元素,肿瘤和免疫微环境(“敌人”分类)。

设计我们应用虚拟反褶积从~ 900 iCCAs转录组数据,使我们能够设计一种新型分类通过选择最相关的组件。通过水动力尾静脉注入小鼠模型生成并与人类疾病。

结果iCCA由五个健壮的机枪兵类包括发炎(35%)和non-inflamed概要(65%)。炎症类,命名经典的免疫(~ 10%)炎症性基质(~ 25%),在致癌粘连形成的途径和程度不同,炎症性基质显示T细胞疲劳,丰富的基质和喀斯特突变(p < 0.001)。信息交互的分析突出了癌症相关的纤维母细胞亚型为潜在的免疫逃避的介质。在non-inflamed类,荒凉的类(~ 20%)港口与充裕的调节性T细胞免疫渗透最低(p < 0.001),而肝干细胞类(~ 35%)在M2-like巨噬细胞,丰富的突变IDH1/2和BAP1,和FGFR2融合。其余的类(肿瘤古典:~ 10%)被定义为细胞周期通路和不良预后。比较分析揭示高之间的相似性喀斯特/ p19小鼠模型和炎症性基质类(p = 0.02)。KRAS-SOS抑制剂、BI3406 tslp喀斯特突变iCCA anti-PD1治疗小鼠模型。

结论我们描述一个全面TME-based iCCA分层。跨物种的分析建立了小鼠模型,使人类iCCA密切结合临床前测试的策略。

  • 胆管癌
  • 免疫反应
  • 分子生物学
  • 基因表达
  • 免疫疗法

数据可用性声明

数据在公共、开放访问存储库。RNA-sequencing在这项研究中已经生成的数据存入GEO数据库(GSE171443)。以前公布的数据集分析在这项研究中所示的主要方法和详细在网上补充表1。

http://dx.doi.org/10.1136/gutjnl - 2021 - 326514

来自Altmetric.com的统计

    请求的权限

    如果你想重用任何或所有本文的请使用下面的链接,这将带你到版权税计算中心的RightsLink服务。你将能够获得快速的价格和即时允许重用内容在许多不同的方式。

    数据可用性声明

    数据在公共、开放访问存储库。RNA-sequencing在这项研究中已经生成的数据存入GEO数据库(GSE171443)。以前公布的数据集分析在这项研究中所示的主要方法和详细在网上补充表1。

    查看全文

    脚注

    • BK, MT-M同样起到了推波助澜的作用。

    • 贡献者DS设计研究,获得资金和充当担保人的整体内容;MAM-S,毫米,圣、MB-V KL、NJP和EB进行了实验。MAM-S,毫米,JC和EB进行免疫组织化学分析。DS, AV、BK MT-M和PH值在网上进行了分析。基于“增大化现实”技术的,如在执行coculture实验。SA, RS和阿尔•提供质粒,建议在小鼠模型。VM,女士,SLF和JL收集组织和临床数据。BK scRNA-seq和配体散装RNA-seq相关性分析设计的AMT, DS, MAM-S, BK AMT,解释结果。DS、MAM-S BK AMT,解释结果。DS写的手稿。 All authors reviewed, edited and approved the manuscript.

    • 资金这项研究的部分资金由2019年博士科学家创新研究奖和富兰克林博士Klion青年科学家奖(DS)和胆管癌基金会(MAM-S)。支持MAM-S玛格丽特·m·布朗纪念研究胆管癌基金会的奖学金。PH值是由德国研究基金会的奖学金资助(DFG,哈8754/1-1)。JC支持由国家卫生研究院(T32GM007280和T32GM062754)。KL支持NIH T32 AI78892-12。支持MB-V Asociacion诺拉为什么el工厂化德尔,(AEEH)。SA支持从“la Caixa”奖学金基金会(ID 100010434)和欧盟地平线2020研究和创新计划根据玛丽Skłodowska-Curie赠款协议没有847648。支持艾尔达蒙Runyon-Rachleff创新奖(DR52-18) R37绩效奖(R37CA230636)和伊坎在西奈山医学院。Tisch癌症研究所和相关研究机构支持P30 CA196521。JML承认他从加速器研究经费奖(猎人,Ref。C9380 / A26813 CRUK之间的伙伴关系,AECC和现),塞缪尔·韦克斯曼癌症研究基金会,西班牙国家卫生研究所(pid2019 - 105378 - rb - 100), Generalitat de加泰罗尼亚/ AGAUR (sgr - 1358)。 DS is supported by the Tisch Cancer Institute and Icahn School of Medicine at Mount Sinai. SLF is supported by the US Department of Defense (CA150272P3) and NIDDK (R01 DK56621 and R01 DK128289). AMT is supported by US Department of Defense (W81XWH2210079) and Icahn School of Medicine at Mount Sinai.

    • 相互竞争的利益JML收到拜耳医疗制药研究支持,卫材公司,百时美施贵宝,勃林格殷格翰集团和伊普森,和咨询费用从礼来公司,拜耳医药保健有限公司的药品、百时美施贵宝,卫材公司,Celsion公司Exelixis),默克公司日常,基因泰克,罗氏,Glycotest, Nucleix Sirtex,米娜α有限公司和阿斯利康。从基因泰克AV已收到咨询费,Guidepoint,富士胶片,勃林格殷格翰的发言,FirstWord, MHLife科学;从精确的科学顾问委员会的费用,Nucleix,基列和NGM药品;从卫材和研究的支持。

    • 病人和公众参与病人和/或公众没有参与设计,或行为,或报告,或传播本研究计划。

    • 出处和同行评议不是委托;外部同行评议。

    • 补充材料此内容已由作者(年代)。尚未审查由BMJ出版集团有限公司(BMJ)和可能没有被同行评议。任何意见或建议讨论仅代表作者(年代)和不了BMJ的支持。和责任起源于BMJ概不负责任何依赖的内容。内容包括任何翻译材料,BMJ并不保证翻译的准确性和可靠性(包括但不限于当地法规、临床指南,术语,药物名称和药物剂量),和不负责任何错误或遗漏引起的翻译和改编或否则。

    相关的文章