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炎症性肠病
变异的ZNF365D亚型与克罗恩病有关
  1. 美丽的Haritunians1，
  2. 米歇尔·R·琼斯2，3.，
  3. 德莫特P B麦戈文1，3.，4，
  4. 施兆荣4，
  5. 罗伯特·J·巴雷特4，
  6. 嘉莉Derkowski4，
  7. Marla C Dubinsky4，5，
  8. 黛布拉Dutridge1，
  9. 菲利普·R·弗莱什纳4，
  10. 安德鲁Ippoliti4，
  11. 莉莉王1，
  12. 以斯帖Leshinsky-Silver6，
  13. 阿里·莱文7，
  14. 吉尔·梅尔梅德4，
  15. Emebet Mengesha1，
  16. Eric A Vasilauskas4，
  17. Shabnam Ziaee3.，4，
  18. 杰罗姆·罗特1，
  19. 斯蒂芬·R·塔根4，
  20. 肯特·D·泰勒1
  1. 1美国加州洛杉矶Cedars-Sinai医学中心医学遗传学研究所
  2. 2美国加州洛杉矶雪松西奈医学中心医学部内分泌、糖尿病和代谢科
  3. 3.美国加州洛杉矶雪松西奈医学中心生物医学与转化医学研究生班
  4. 4美国加州洛杉矶雪松西奈医学中心炎症肠与免疫生物学研究所
  5. 5美国加州洛杉矶雪松西奈医学中心儿科
  6. 6分子遗传学实验室，沃尔夫森医学中心，霍伦，以色列
  7. 7以色列特拉维夫萨克勒医学院沃尔夫森医学中心小儿胃肠科
  1. 对应到Talin Haritunians博士，美国洛杉矶贝弗利大道8700号雪松西奈医学中心医学遗传学研究所，CA 90048;talin.haritunians在}{cshs.org

摘要

客观的全基因组关联研究已经确定了多个克罗恩病(CD)易感性位点，包括在10q21与非编码基因间单核苷酸多态性(SNPs)的关联。

设计为了精确定位10q21位点，作者对1632例CD病例和961例对照进行了86个snp基因分型，并使用逻辑回归进行了单标记物和条件分析。

结果与CD风险的关联跨越11个SNPs (p<0.001)。在非同义SNP rs7076156 (Ala62Thr)上观察到最显著的关联ZNF365．丙氨酸等位基因在CD中表现过度(p=5.23×10−7；OR=1.39(95%可信区间1.22 - 1.58));CD组为76%，对照组为69.7%)。对rs7076156的条件分析排除了所有其他显著相关性，表明这是该位点的致病变异。四种异构体ZNF365之前已经确定，rs7076156位于一个独特的外显子ZNF365作者使用逆转录- pcr技术证实了ZNF365D在CD受试者和对照组肠道切除中的表达。从CD受试者纯合子的风险等位基因(Ala)中发现，在eb病毒转化的淋巴母细胞系中，ZNF365D的平均表达水平显著降低。全基因组微阵列表达研究进一步表明，Ala62Thr基因的变化ZNF365D亚型与基因的差异表达有关ARL4A，MKKS，RRAGD，SUMF2，TDR1而且ZNF148在CD。

结论总的来说，这些数据支持了一种假设，即非同义性Ala62Thr SNP rs7076156是10q21和CD风险之间的关联，并表明该SNP通过改变基因的表达而起作用ZNF365同种型D。

  • GWAS
  • 克罗恩氏病
  • ZNF365
  • 遗传学
  • 协会研究
  • 遗传学

http://dx.doi.org/10.1136/gut.2010.227256

数据来自Altmetric.com

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    脚注

    • 资金本研究部分得到以下支持:NCRR授予Cedars-Sinai综合研究中心基因分型核心M01-RR00425;NIH/NIDDK授权P01-DK046763;南加州糖尿病内分泌学研究中心资助项目DK063491;雪松-西奈医学中心炎症性肠病研究基金;IBD的Feintech家族主席(到SRT);儿科IBD的Abe和Claire Levine主席(MD)和Cedars-Sinai理事会医学遗传学主席(JIR);通过赠款DK062413(给DPBM)、DK76984(给MD)和DK084554(给MD和DPBM)提供额外资金。

    • 相互竞争的利益一个也没有。

    • 伦理批准本研究经Cedars-Sinai医疗中心IRB批准进行。

    • 出处和同行评审不是委托;外部同行评审。