重新定义肝脏分区

回到Bahar Halpern K, Shenhav R, Matcovitch-Natan O，等．单细胞空间重建揭示了哺乳动物肝脏的整体分工自然2017; 542:352-6。

肝细胞在肝小叶内的不同解剖位置被认为具有专门的功能，一种范式称为肝分区。在这项研究中，作者使用单分子荧光原位杂交和单细胞RNA测序(scRNA-seq)来详尽地定义小鼠所有肝脏基因的分区分布。利用六个带状分布的基因(Glul，Cyp2e1，Ass1，美国手语，铝青铜，Cyp2f2)，他们定义了一种“空间条形码”，通过这些区域基因的相对表达，可以推断出在中央静脉和门脉节点之间的九个小叶层之一中的给定细胞的位置。他们继续对新分离的肝细胞进行scRNA-seq，并使用空间条形码基因的表达水平将每个测序的肝细胞分配到9个小叶层中的一个。使用这种方法，大约50%的表达的肝脏基因是空间分区的，远高于以前的估计。他们继续研究可能影响这种带状基因表达谱的信号。与之前的文献一致，wnt反应性和缺氧反应性基因都在中心周围肝细胞中富集，而ras反应性基因主要在门静脉周围区域。在功能上，肝分泌蛋白(如凝血因子和补体)的表达偏向于门静脉周围，而中心周围通路包括解毒和胆汁酸生物合成。有趣的是，编码hepcidin调节铁稳态的基因在小叶中层表达丰富。这项研究有可能重新定义肝脏分区的传统观点，并强调了肝脏生物学的空间控制可能比以前所认识的更严格。进一步的工作，以确定这种肝细胞分区是如何在肝病中受到干扰，可能会产生新的见解……