客观的Adherent-invasive大肠杆菌(AIEC)是一个主要候选人细菌引发克罗恩病(CD)。的AIEC pathovar被定义为体外细胞系化验检查特定的细菌/细胞相互作用。不存在分子标记鉴定。我们的目的是确定一个分子财产共同AIEC表现型。

设计41 B2 phylogroup大肠杆菌菌株被分离出36澳大利亚主题:19 IBD患者和17。坚持/入侵检测进行了使用i - 407上皮细胞系和生存/复制化验使用THP-1巨噬细胞细胞系。细胞因子分泌肿瘤坏死因子(TNF) -α,白介素6 (IL),引发和IL - 10)用ELISA测定。基因组组装和注释,并使用CD-HIT执行集群分析。由此产生的矩阵进行分析识别基因独特的/更频繁AIEC菌株而non-AIEC菌株。碱基组成的差异和集群定期空隙回文重复(CRISPR)进行了分析。

结果的B2 phylogroup菌株进行评估,79%可以在巨噬细胞生存和复制。其中,11/41菌株(5 CD, 2 UCs, 5 non-IBD)也坚持和侵入上皮细胞,表现型分配他们到AIEC pathovar。系统异构AIEC菌株。我们没有确定一个基因(或核酸碱基组成差异)共同所有或大多数AIEC。细胞因子分泌和CRISPRs没有与AIEC表型有关。

结论比较基因组分析AIEC和non-AIEC菌株没有识别分子财产独家AIEC表现型。我们建议更广泛的识别方法bacteria-host交互在克罗恩病的发病机制是重要的。