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上消化道的活跃的细菌组合个人有或没有幽门螺杆菌感染
  1. 基督教舒尔茨1,2,
  2. Kerstin舒特等人1,3,
  3. Nadine科赫2,
  4. 新男友Vilchez-Vargas1,
  5. 梅丽莎·L Wos-Oxley2,
  6. Andrew P奥克斯利2,4,
  7. 马吕斯至关重要2,
  8. 彼得·马尔福泰尼1,
  9. 迪特马尔H皮珀尔2
  1. 1美国胃肠病学、肝病和传染病,Otto-von-Guericke-University马格德堡,马格德堡、德国
  2. 2微生物的相互作用和过程(MINP)研究小组,亥姆霍兹感染研究中心,布伦瑞克、德国
  3. 3内科和胃肠病学,Niels-Stensen-Kliniken, Marienhospital,奥斯纳布吕克、德国
  4. 4分子科学实验室,SARDI水生科学,西海滩,南澳大利亚、澳大利亚
  1. 对应到迪特马尔H皮珀尔教授Helmholtz-Zentrum皮毛Infektionsforschung GmbH, Inhoffenstraße 7,布伦瑞克38124年德国;dpi在{}helmholtz-hzi.de

文摘

客观的患者感染幽门螺杆菌发展为慢性胃炎组进行进一步的并发症。从口腔微生物群的作用吞唾液和过境胃或胃粘膜中坚持不确定。也不知道细菌社区在腔的不同和粘膜利基市场。一个关键的问题是幽门螺旋杆菌影响细菌群落的胃与十二指肠的利基市场。

设计唾液、胃和十二指肠吸入胃和十二指肠活检oesophagogastroduodenoscopy期间收集从24例(f m: 9日:15日平均年龄为52.2±14.5年SD)。RNA提取的v2 v1区retrotranscribed细菌16 s rRNA放大和测序Illumina公司MiSeq平台。

结果总的来说,687个细菌phylotypes属于95属,有11门被观察到。每个包含一个独特的微生物群组成,在不同的细分市场是一致的。然而,胃液体浓缩为特定的微生物群的组件。幽门螺杆菌spp被证明主导mucosa-associated社区在胃里,并显著影响十二指肠和口腔的社区。

结论全球细菌活跃社区的详细分析的五个不同网站上消化道首次允许主机之间的分化效果和抽样地区的细菌群落的影响。的影响幽门螺杆菌spp对全球社区结构是惊人的。

  • 细菌的相互作用
  • 幽门螺杆菌

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脚注

  • 贡献者设计马力,下午和CS导致了研究设计,数据的分析和解释。设计马力和CS起草了手稿。CS, KS和点收集样本,确定合适的实验对象。设计马力和PM监督研究过程。CS、NK、APAO建立分析和实验室检查进行。MV,设计马力,MLW-O RV-V进行生物信息学和统计分析。所有作者阅读和批准了最终版本的手稿。

  • 资金本研究在我的支持下,亥姆霍兹联合会对个性化医疗的倡议。CRC854 CS支持的研究项目由德国资金组织脱硫。

  • 相互竞争的利益一个也没有。

  • 伦理批准马格德堡大学操作数的31/11。

  • 出处和同行评议不是委托;外部同行评议。