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原始研究
胰腺导管腺癌的形态学分类预测分子亚型并与临床结果相关
  1. Sangeetha N Kalimuthu1,2,
  2. 加文·W·威尔逊3.,
  3. 罗伯特·C·格兰特4,5,
  4. 马修濑户1,
  5. Grainne O 'Kane4,5,
  6. 拉库马Vajpeyi1,2,
  7. Faiyaz Notta6,7,
  8. 史蒂文难堪的5,8,
  9. Runjan柴提1,2
  1. 1解剖病理学,检验医学专业,大学卫生网络,多伦多,安大略、加拿大
  2. 2实验室医学与病理生物学“,,多伦多大学,多伦多,安大略、加拿大
  3. 3.拉特纳胸外科实验室,外科胸外科分部,大学卫生网络,多伦多,安大略、加拿大
  4. 4肿瘤内科,玛嘉烈医院肿瘤中心,多伦多,安大略、加拿大
  5. 5PanCuRx转化研究计划,安大略癌症研究所,多伦多,安大略、加拿大
  6. 6研究部,玛嘉烈医院肿瘤中心,多伦多,安大略、加拿大
  7. 7医学生物物理学,多伦多大学,多伦多,安大略、加拿大
  8. 8肝胆/胰腺外科肿瘤学项目,大学卫生网络,多伦多,安大略、加拿大
  1. 对应到Sangeetha N Kalimuthu博士,解剖病理学,实验室医学项目,大学卫生网络,多伦多ON M5G 2C4,加拿大;sangeetha.kalimuthu在{}uhn.ca

摘要

简介转录分析已经确定了胰腺导管腺癌(PDAC)中几个不同的分子亚型,这些亚型具有预后和潜在的治疗意义。然而,到目前为止,还没有对这些分子亚型进行深入的临床形态学相关性研究。我们试图识别特定的形态模式,以与已知的分子亚型进行比较,询问它们的生物学意义,并进一步重新评估PDAC中当前的分级系统。

设计我们首先用匹配的RNA-Seq数据评估了86例初次化疗的PDAC切除标本,以获得特定的、可重复的形态学模式。利用形态特征对基因表达数据进行差异表达。接下来,我们将差异表达的基因标记与先前发表的分子亚型进行了比较。总生存期(OS)与形态学和分子亚型相关。

结果我们确定了四种形态模式,根据是否存在形态良好的腺体,它们分为两个组成部分(“腺体形成”和“非腺体形成”)。利用RNA-Seq数据建立了形态学截点(≥40%“非腺体形成”),该数据确定了两组(A和B)具有与已知分子亚型相关的基因特征。两组间OS有显著差异。形态学组在中度分化并使用RNA-Seq分类为“经典”的癌症中仍然具有显著的预后。

结论我们的研究表明,PDACs可以在形态上分为不同的和生物学相关的类别,预测已知的分子亚型。这些结果为PDAC的改进分类提供了基础,这可能有助于未来的治疗策略和深度学习模型的发展。

  • 胰导管腺癌
  • 基底亚型
  • 经典的子类型
  • 基于模式的形态分类系统
  • 深度学习

数据来自Altmetric.com

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脚注

  • GWW和RCG的贡献相当。

  • 贡献者起草和修改稿件:SNK, RC, GWW, RG, SG。病理模型发展:SNK, RC。RNA-Seq分析:GWW。生存分析:RG、GO、SG、ms。病理评估:SNK、RC、RV。项目构想:SNK, RC, GWW, RG, FN, SG。

  • 资金作者没有从任何公共、商业或非营利部门的资助机构宣布对这项研究的具体资助。

  • 相互竞争的利益没有宣布。

  • 伦理批准从机构审查委员会获得伦理批准,并获得所有患者的书面知情同意。

  • 出处和同行评审不是委托;外部同行评审。

  • 患者发表同意书获得的。