条文本
摘要
简介转录分析已经确定了胰腺导管腺癌(PDAC)中几个不同的分子亚型,这些亚型具有预后和潜在的治疗意义。然而,到目前为止,还没有对这些分子亚型进行深入的临床形态学相关性研究。我们试图识别特定的形态模式,以与已知的分子亚型进行比较,询问它们的生物学意义,并进一步重新评估PDAC中当前的分级系统。
设计我们首先用匹配的RNA-Seq数据评估了86例初次化疗的PDAC切除标本,以获得特定的、可重复的形态学模式。利用形态特征对基因表达数据进行差异表达。接下来,我们将差异表达的基因标记与先前发表的分子亚型进行了比较。总生存期(OS)与形态学和分子亚型相关。
结果我们确定了四种形态模式,根据是否存在形态良好的腺体,它们分为两个组成部分(“腺体形成”和“非腺体形成”)。利用RNA-Seq数据建立了形态学截点(≥40%“非腺体形成”),该数据确定了两组(A和B)具有与已知分子亚型相关的基因特征。两组间OS有显著差异。形态学组在中度分化并使用RNA-Seq分类为“经典”的癌症中仍然具有显著的预后。
结论我们的研究表明,PDACs可以在形态上分为不同的和生物学相关的类别,预测已知的分子亚型。这些结果为PDAC的改进分类提供了基础,这可能有助于未来的治疗策略和深度学习模型的发展。
- 胰导管腺癌
- 基底亚型
- 经典的子类型
- 基于模式的形态分类系统
- 深度学习
数据来自Altmetric.com
脚注
GWW和RCG的贡献相当。
贡献者起草和修改稿件:SNK, RC, GWW, RG, SG。病理模型发展:SNK, RC。RNA-Seq分析:GWW。生存分析:RG、GO、SG、ms。病理评估:SNK、RC、RV。项目构想:SNK, RC, GWW, RG, FN, SG。
资金作者没有从任何公共、商业或非营利部门的资助机构宣布对这项研究的具体资助。
相互竞争的利益没有宣布。
伦理批准从机构审查委员会获得伦理批准,并获得所有患者的书面知情同意。
出处和同行评审不是委托;外部同行评审。
患者发表同意书获得的。