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原始研究
荟萃分析的全基因组关联研究和功能分析解读中国胃癌易感基因的人群

文摘

客观的虽然基因位点的一个子集与胃癌相关(GC)的风险,潜在的机制在很大程度上是未知的。我们旨在识别新的易感基因,阐明其在GC发展机制。

设计我们进行了一项荟萃分析的四个全基因组关联研究(gwas)包括3771例病例和5426例对照。目标序列和功能注释后,我们进行体外和体内实验证实遗传变异和候选基因的功能。此外,我们选择33承诺为两级变异复制从其他5 7035例病例和8323例对照研究。

结果gwas的荟萃分析发现三个位点1的时候,5 p13.1和10 q23.33与GC风险p < 5×108和复制的七个已知基因座在p < 0.05。5点p13.1,风险rs59133000 [C]等位基因的亲和力增强NF-κB1(核因子k B亚基1)启动子的PRKAA1,导致减少了启动子活性和较低的表达式。的淘汰赛PRKAA1促进了GC细胞增殖和裸鼠异种移植肿瘤增长。在10 q23.33 rs3781266 [C]和rs3740365 [T]风险等位基因完全连锁不平衡破坏和创造,分别绑定图案POU2F1 PAX3,导致增加剂的活动和表达NOC3L,而NOC3L可拆卸的GC抑制细胞生长。此外,两个新的位点3 q11.2(或= 1.21,p = 4.56×109)和4 q28.1(或= 1.14,p = 3.33×1011)与GC有关风险。

结论我们确定了12个位点与GC有关风险在中国人口和破译的机制PRKAA1在5 p13.1NOC3L在胃tumourigenesis q23.33 10点。

  • 胃癌
  • 遗传学
  • 突变
  • 基因调控

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