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胃
原始研究
全基因组关联研究和功能分析的meta分析破译了中国人群胃癌的易感基因
  1. Caiwang严1，2，3.，
  2. 孟朱1，2，
  3. Yanbing叮4，
  4. 明杨5，
  5. Mengyun王6，7，
  6. 李刚8，
  7. Chuanli任9，
  8. Tongtong黄1，
  9. 蒙牛杨10，
  10. Bangshun他11，
  11. 梅林关王2，12，
  12. 范昱1，
  13. 金晨王1，
  14. Ruoxin张6，7，
  15. Tianpei王1，
  16. 京倪1，
  17. Jiaping陈1，2，
  18. 江越1，2，
  19. Juncheng戴1，2，
  20. Erbao张1，2，
  21. 红霞马1，2，
  22. Yanong王13，
  23. Dazhi徐13，
  24. Shukui王2，11，
  25. Yun陈2，14，
  26. Zekuan徐2，15，
  27. 健胃周2，16，
  28. 国众记2，17，
  29. 件王18，
  30. 郑东新区张2，12，
  31. Zhibin胡1，2，3.，
  32. 青衣魏6，19，20.，
  33. Hongbing沈1，2，
  34. Guangfu金1，2，3.
  1. 1公共卫生学院全球卫生中心流行病学系，南京医科大学，南京,中国
  2. 2江苏省癌症生物标志物防治重点实验室，癌症医学协同创新中心，南京医科大学，南京,中国
  3. 3.生殖医学国家重点实验室，中国环境与人类健康国际合作中心，南京医科大学，南京,中国
  4. 4消化内科，扬州大学附属医院，扬州,中国
  5. 5山东省肿瘤研究中心放射肿瘤学重点实验室，山东大学附属肿瘤医院，山东省医学科学院，济南,中国
  6. 6癌症研究所，复旦大学上海肿瘤中心，上海,中国
  7. 7上海医学院肿瘤科，复旦大学，上海,中国
  8. 8江苏省肿瘤医院普通外科，江苏省肿瘤研究所，南京医科大学附属肿瘤医院，南京,中国
  9. 9检验医学系，扬州大学临床医学院，扬州,中国
  10. 10生育保存与维持重点实验室，总医院，宁夏医科大学，银川,中国
  11. 11综合临床研究中心，南京医科大学附属南京第一医院，南京,中国
  12. 12公共卫生学院现代毒理学教育部重点实验室，南京医科大学，南京,中国
  13. 13胃癌及软组织肉瘤科“，，复旦大学上海肿瘤中心，上海,中国
  14. 14免疫学系，南京医科大学，南京,中国
  15. 15普通外科，南京医科大学附属第一医院，南京,中国
  16. 16公共卫生学院分子细胞生物学与毒理学教研室，南京医科大学，南京,中国
  17. 17消化内镜研究所和消化疾病医学中心，南京医科大学附属第二医院，南京,中国
  18. 18流行病学和癌症控制系“，，圣裘德儿童研究医院，孟菲斯，田纳西州美国
  19. 19杜克癌症研究所，杜克大学医学中心，达勒姆，北卡罗莱纳美国
  20. 20.人口健康科学系，杜克大学医学院，达勒姆，北卡罗莱纳美国
  1. 对应到金光福博士，南京医科大学公共卫生学院全球卫生研究中心流行病学教研室，南京211166;guangfujin在}{njmu.edu.cn

摘要

客观的虽然有一部分基因位点与胃癌(GC)风险相关，但其潜在机制在很大程度上尚不清楚。我们旨在鉴定新的易感基因并阐明其在GC发育中的机制。

设计我们对四项全基因组关联研究(GWASs)进行了荟萃分析，包括3771例病例和5426例对照组。在靶向测序和功能注释后，我们进行了体外和体内实验，以确认遗传变异和候选基因的功能。此外，我们从其他5项研究中选择了33个有前景的变体，用于7035例病例和8323例对照的两阶段复制。

结果GWASs的荟萃分析确定了3个与GC风险相关的位点，分别为1q22、5p13.1和10q23.33, p<5×10−8并复制了7个已知位点，p<0.05。在5p13.1处，risk rs59133000[C]等位基因增强了NF-κB1(核因子κB亚基1)与蛋白启动子的结合亲和力PRKAA1，导致启动子活性降低和表达降低。淘汰PRKAA1促进GC细胞增殖和裸鼠异种移植瘤生长。在10q23.33，完全连锁不平衡的rs3781266[C]和rs3740365[T]风险等位基因分别破坏和创造了POU2F1和PAX3的结合基序，导致增强子活性和表达增加NOC3L，而NOC3L敲低抑制GC细胞生长。此外，在3q11.2位点发现了两个新的基因座(OR=1.21, p=4.56×10−9)和4q28.1 (OR=1.14, p=3.33×10−11)与胃癌风险相关。

结论我们确定了12个与中国人群GC风险相关的基因座，并破译了其机制PRKAA1在5p13.1和NOC3L在胃肿瘤发生的10q23.33。

  • 胃癌
  • 遗传学
  • 突变
  • 基因调控

http://dx.doi.org/10.1136/gutjnl-2019-318760

数据来自Altmetric.com

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    • CY、MZ、YD、MY、MW、GL、CR为联合第一作者。

    • 调整通知这篇文章在Online First发表后已被更正。新增作者说明。

    • 贡献者GuaJ、HS、QW、ZH设计研究并编辑稿件;CY和MZ进行统计分析、实验并撰写稿件;TH、FY、JW、TW、JN、JC、YJ分别进行基因分型和实验;YD、MY、MenW、GL、CR、WY、BH和MeiW、RZ、YW、DX对样品采集有贡献;EZ、JD、HM、SW、YC、ZX、JZ、GuoJ、ZW、ZZ对数据进行评审并提出批评意见或建议;GuaJ对最终内容负有主要责任。

    • 资金国家重大研发计划(2016YFC1302703)资助;国家自然科学基金(81872702,81521004,81573228);江苏省333高层次人才培养计划项目(BRA2018057);江苏省杰出青年基金(BK20160095);中国博士后科学基金资助项目(2019TQ0157)。

    • 相互竞争的利益没有宣布。

    • 患者发表同意书不是必需的。

    • 伦理批准本研究获得南京医科大学机构评审委员会的批准。动物护理和处理程序按照美国国立卫生研究院的《实验动物护理和使用指南》执行，并得到南京医科大学(中国南京)动物实验伦理委员会的批准。

    • 出处和同行评审不是委托;外部同行评审。

    • 数据可用性声明所有与研究相关的数据都包含在文章中或作为补充信息上传。

    • 作者注魏庆义博士，复旦大学客座教授。