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  • 第70卷第5期
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胰腺
原始研究
导管内乳头状粘液性肿瘤的多区域全外显子组测序显示经常发生体细胞肿瘤KLF4突变主要发生在低等级地区
  1. Fujikura浩平表示1，
  2. Waki Hosoda1，2，
  3. 马索Felsenstein1，3.，
  4. 千千的歌4，
  5. 约翰尼斯·G·瑞特5，
  6. 莉莉郑6，
  7. Violeta Beleva Guthrie7，
  8. 纳塔莉亚林康8，
  9. 马可·达尔·莫林9，
  10. 乔纳森·达德利9，
  11. 约书亚·D·科恩9，
  12. 裴王4，
  13. 凯瑟琳·G·菲舍尔1，
  14. 艾丽西娅·M·布拉克斯顿1，
  15. 迈克尔•诺伊1，
  16. 马丁尼Jongepier1，
  17. 卡洛斯Fernández-del卡斯蒂略10，
  18. 玛丽Mino-Kenudson11，
  19. C马克斯·施密特12，
  20. Michele T Yip-Schneider12，
  21. 丽塔·T·劳勒13，
  22. 罗伯特·鼠尾草14，
  23. 尼古拉斯·J·罗伯茨1，
  24. 伊丽莎白·D·汤普森1，
  25. 瑞秋Karchin8，
  26. 安妮·玛丽·列侬15，
  27. 将尝试娇4，
  28. 劳拉·伍德1
  1. 1索尔戈德曼胰腺癌研究中心病理科，约翰霍普金斯大学医学院，巴尔的摩，马里兰美国
  2. 2病理学与分子诊断学“，，爱知癌症中心，名古屋,日本
  3. 3.外科，夏洛蒂，柏林、德国
  4. 4分子肿瘤学国家重点实验室，中国医学科学院和北京协和医学院，北京,中国
  5. 5放射学系金丝雀癌症早期检测中心，斯坦福癌症研究所，生物医学数据科学系，斯坦福大学医学院，斯坦福大学，加州美国
  6. 6麦库斯克-内森遗传医学研究所，约翰霍普金斯大学医学院，巴尔的摩，马里兰美国
  7. 7个人基因组诊断，巴尔的摩，马里兰美国
  8. 8计算医学研究所和生物医学工程系，约翰霍普金斯大学，巴尔的摩，马里兰美国
  9. 9路德维希癌症遗传学和治疗中心，悉尼坎摩尔综合癌症中心，约翰霍普金斯大学医学院，巴尔的摩，马里兰美国
  10. 10外科，麻省总医院和哈佛医学院，波士顿，麻萨诸塞州美国
  11. 11病理科，麻省总医院和哈佛医学院，波士顿，麻萨诸塞州美国
  12. 12外科，印第安纳大学医学院，印第安纳波利斯，印第安纳州美国
  13. 13癌症应用研究中心，维罗纳大学和医院信托基金，维罗纳、意大利
  14. 14普通和胰腺外科，维罗纳胰腺研究所和医院信托，维罗纳、意大利
  15. 15医学系，约翰霍普金斯大学医学院，巴尔的摩，马里兰美国
  1. 对应到Laura D Wood博士，美国马里兰州巴尔的摩市约翰霍普金斯大学医学院索尔戈德曼胰腺癌研究中心病理科;ldwood在}{jhmi.edu；焦宇辰博士，中国医学科学院、北京协和医学院分子肿瘤学国家重点实验室，中国北京;jiaoyuchen在}{cicams.ac.cn

摘要

客观的导管内乳头状粘液瘤(IPMNs)是非侵袭性前驱病变，可发展为侵袭性胰腺癌，根据肿瘤上皮的形态分为低级别或高级别。我们的目的是比较同一IPMN的低级别和高级别区域的遗传改变，以确定肿瘤进展背后的分子改变。

设计我们对17个具有低级别和高级别异常增生的IPMN的组织样本进行了多区域全外显子组测序(76个IPMN区域，其中49个来自低级别异常增生，27个来自高级别异常增生)。我们重建了每个病例的系统发育，并在63个IPMN囊肿液样本的独立队列中评估了一个新驱动基因的突变。

结果我们的多区域全外显子组测序确定KLF4之前未报道的IPMN肿瘤发生的遗传驱动因素，在> - 50%的分析IPMN中发现了两个密码子之一的热点突变。突变KLF4在我们测序的病例中，在低级别地区明显更普遍。整个外显子组测序数据的系统发育分析显示了IPMN起始和进展的不同模式。热点突变KLF4在IPMN囊肿液样本的独立队列中也被发现，同样在低级别IPMN中患病率显著更高。

结论热点突变KLF4在ipmn中患病率很高。在胰腺驱动基因中，KLF4突变在低级ipmn中富集。这些数据突出了低级别和高级别发育不良的不同分子特征，并提示通过IPMN途径导致高级别发育不良的多种途径。

  • 胰腺肿瘤
  • 胰腺病理
  • 突变
  • 胰腺癌
  • 分子遗传学

数据可用性声明

根据机构审查委员会的合理要求和数据共享批准，可从作者处获得数据。

http://dx.doi.org/10.1136/gutjnl-2020-321217

数据来自Altmetric.com

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    脚注

    • KF、WH、MF和QS贡献均等。

    • 调整通知这篇文章在Online First发表后已被更正。为了清晰起见，已经替换了数字。

    • 贡献者KF, WH, MF, QS, YJ和LDW设计了研究。WH、MDM、CF-dC、MM-K、CMS、MY-S、RTL、RS、EDT、AML和LDW有助于样本采集。WH、QS、JD、JC、PW采集数据。分析数据KF、MF、QS、JR、LZ、VBG、NR。KF、WH、MF、QS、JR、LZ、VBG、CGF、AB、MN、MJ、NJR、RK、YJ、LDW解释数据。KF, LDW撰写了手稿。所有作者都对手稿进行了严格的审查。LDW提供了研究监督。

    • 资金作者承认以下资金来源:NIH/NCI P50 CA62924;NIH / NIDDKK08 DK107781;索尔·戈德曼胰腺癌研究中心;Buffone家族胃肠癌研究基金;Carol S. and Robert M. Long胰腺癌研究基金;胃肠癌预防Kaya Tuncer职业发展奖;AGA-Bernard Lee Schwartz基金会胰腺癌研究学者奖;悉尼坎摩尔癌症研究基金会坎摩尔学者奖;aacr - incytecoration胰腺癌研究职业发展奖;美国癌症协会研究学者授予RSG-18-143-01-CSM; Emerson Collective Cancer Research Fund; Rolfe Pancreatic Cancer Foundation; Joseph C Monastra Foundation; The Gerald O Mann Charitable Foundation (Harriet and Allan Wulfstat, Trustees); Susan Wojcicki and Denis Troper; Lustgarten Foundation for Pancreatic Cancer Research; CAMS Innovation Fund for Medical Sciences 2016-I2M-1-001 and 2019-I2M-1-001; Virginia and D.K. Ludwig Fund for Cancer Research; Sol Goldman Sequencing Facility at Johns Hopkins; Howard Hughes Medical Institute; Associazione Italiana Ricerca Cancro (grant number: 12182).

    • 相互竞争的利益LDW得到了应用材料公司的研究支持。VBG是个人基因组诊断公司的员工。其他作者声明没有利益冲突。

    • 患者和公众参与患者和/或公众没有参与本研究的设计、实施、报告或传播计划。

    • 出处和同行评审不是委托;外部同行评审。