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摘要
客观的生殖系TP53致病性(P)变异导致Li-Fraumeni综合征(LFS),一种侵袭性多肿瘤易感条件。由于多基因面板检测的实施,TP53在没有LFS嫌疑的个体中已经检测到变异,例如,结直肠癌(CRC)患者。我们的目的是破译这些发现是检测背景人群患病率的结果,还是CRC的病因基础。
设计我们分析了TP53对473例家族/早发性结直肠癌患者进行了研究,并与另外5项在结直肠癌患者中进行的研究(总n=6200)进行了结果评估。对照人群和LFS数据来自基因组聚集数据库(gnomAD V.2.1.1)和国际癌症研究机构(IARC)。TP53数据库,分别。根据美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会(ACMG/AMP)遵循ClinGen的指南对所有变异进行了重新分类TP53专家小组规范。
结果在0.05%的对照组(n=27/59 095)和0.26%的CRC患者(n=16/6200)中发现P或可能致病(LP)变异(P <0.0001) (or =5.7, 95% CI 2.8 - 10.9),没有人符合所建立的临床标准TP53测试。当在更高龄(>50岁和>60岁)诊断为CRC的患者被排除在分析之外时,这种关联仍然被检测到,以尽量减少克隆造血引起的变异。与对照组相比,功能缺失和错义变异与CRC密切相关(功能缺失和剪接位点等位基因OR=25.44, 95% CI 6.10 ~ 149.03,错义P或LP变异OR=3.58, 95% CI 1.46 ~ 7.98)。
结论TP53P变异不应该明确地与LFS相关。种系携带者的前瞻性随访TP53缺乏LFS表型的P变异将决定如何对这些个体进行监测和临床管理。
- 癌症遗传学
- 癌症易感性
- 癌症的症状
- 基因突变
- 基因检测
数据可用性声明
所有与研究相关的数据都包含在文章中或作为补充信息上传。
来自Altmetric.com的统计
脚注
推特@LValleResearch
MT, PM和SB贡献相等。
贡献者LV构思、设计和监督了这项研究。MT、PM、SB和IQ进行了实验。SB和PMM-T进行生物信息学分析。MT、PM和VM进行统计分析。MT, PM, SB和LV进行文献检索和数据分析。MT, PM, ERW, GJB, MP和DGRE执行和/或审查证据TP53变体的分类。MN、JB、MP、CL和GC提供了样本和患者的临床和遗传信息。LV, MT和PM撰写了手稿,ERW和DGRE提供了相关的输入。所有作者都对文章进行了批判性的修改。
资金本研究由西班牙科学与创新部资助,联邦资助基金共同资助:建设欧洲的方法(SAF2016-80888-R (LV), SAF2015-68016-R (GC和MP), FPI奖学金(IQ));由联邦储备基金共同资助的卡洛斯三研究所:建设欧洲的一种方式(CIBERONC CB16/12/00234, FIS PI19/00553 (CL), Sara Borrell博士后合同(PM));加泰罗尼亚的政府(卫生部PERIS SLT002/16/0037、SLT002/16/00164、AGAUR 2017SGR1282、CERCA方案);托雷斯Fundacion奥尔加;科学基金会Asociación Española Contra el Cáncer (MT)。DGRE和ERW得到曼彻斯特国家卫生研究所(1215-20007)的支持。
相互竞争的利益没有宣布。
患者和公众的参与患者和公众均未参与本研究的设计、实施、报告或传播计划。
来源和同行评审不是委托;外部同行评议。