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原始研究
克罗恩病患者停用英夫利昔单抗后发现与短期和中长期复发风险相关的生物标志物候选物:一项基于蛋白质组学的研究
  1. 尼古拉斯·皮埃尔1
  2. 多米尼克•Baiwir2
  3. 范·安Huynh-Thu3.
  4. 加布里埃尔Mazzucchelli4
  5. 尼古拉斯Smargiasso4
  6. 埃德温•德•波夫4
  7. 推断Bouhnik5
  8. 大卫Laharie6
  9. Jean-Frederic Colombel7
  10. Marie-Alice Meuwis18
  11. 爱德华路易18
  12. GETAID(音乐小组Thérapeutique des Inflammatoires du tube digest)
  1. 1消化病学转化实验室,giga研究所列日大学列日、比利时
  2. 2GIGA蛋白质组学工具列日大学列日、比利时
  3. 3.电气工程与计算机科学系“,列日大学列日、比利时
  4. 4质谱分析实验室,MolSys研究单位列日大学列日、比利时
  5. 5服务Gastroentérologie等援助营养友谊医院Beaujon克里希、法国
  6. 6服务d 'Hepato-Gastroenterologie楚de波尔多波尔多、法国
  7. 7胃肠病学分工西奈山伊坎医学院纽约纽约美国
  8. 8肝消化内科和消化肿瘤科列日大学列日、比利时
  1. 对应到Nicolas Pierre博士,比利时列日大学giga研究所转化消化病学实验室,列日4000;nicolas.pierre在{}uliege.be

摘要

客观的一组克罗恩病(CD)患者在停用英夫利昔单抗后经历中期/长期缓解。需要生物标记物来识别这些患者。

设计在联合治疗(抗代谢药物和英夫利昔单抗)和稳定的临床缓解期(克罗恩病与免疫抑制剂联合治疗的稳定缓解期患者停药,n=102)的CD患者的基线血清中寻找新的复发生物标志物。从鸟枪蛋白质组学实验(发现步骤)中,通过选定的反应监测(验证步骤)确定候选生物标志物并进一步靶向。对数据集进行分层,以寻找短期(<6个月)或中长期复发(>6个月)的标记。分别采用单变量Cox模型和log-rank统计方法评估复发风险和与生物标志物候选相关的预测能力。为了测试它们的互补预测能力,生物标志物候选物被系统地成对组合。

结果不同的候选生物标志物与短期(15个蛋白,2.9

结论我们首次确定了与停用英夫利昔单抗的CD患者中/长期复发风险相关的循环生物标志物候选物。我们还强调了导致复发的一系列病理生理过程,这有助于更好地了解疾病的进展。我们的研究结果可能为更好地评估CD患者停用抗肿瘤坏死因子α时的复发风险铺平道路。

  • 克罗恩氏病
  • 临床决策
  • 炎症性肠病临床
  • 炎症性肠病
  • 英夫利昔单抗

数据可用性声明

数据可在一个公共的、开放访问的存储库中获得。所有与研究相关的数据都包含在文章中或作为补充信息上传。通过数据集标识符PXD019008的PRIDE合作伙伴存储库,发现步骤的所有原始数据和结果都已存储在ProteomeXchange Consortium中。对于验证步骤,所有SRM原始文件和Skyline文件(包括质量控制文件)都可以在Panorama上使用数据集标识符PXD019434 (https://panoramaweb.org/atQBcH.url).

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脚注

  • DB和vaah - t贡献相同。

  • M-AM和EL贡献相当。

  • 贡献者NP、M-AM、YB、DL、J-FC和EL设计了实验。GETAID提供了样本和临床信息。M-AM进行了发现研究。M-AM、DB和NP发展了SRM方法。NP和M-AM进行样品制备。NP、M-AM、DB、NS、GM和EDP管理蛋白质组学实验的注射,并为原始数据分析提供建议。VAH-T和NP进行统计分析。NP、M-AM、vaah - t和EL解释数据。NP, M-AM和EL是论文的作者。

  • 资金这项工作得到了瓦隆大区和Fond européen de développement régional (FEDER)的支持[拨款组合2 46099-510388]。对STORI试验的财政支持由SNFGE和协会François Aupetit提供。M-AM获得了ECCO研究基金(2012年)的发现研究。由ULiège和CHU de Liège提供的内部资金提供了其他支助。

  • 相互竞争的利益没有宣布。

  • 来源和同行评审不是委托;外部同行评议。

  • 补充材料本内容由作者提供。它没有经过BMJ出版集团有限公司(BMJ)的审查,也可能没有经过同行评审。讨论的任何意见或建议仅仅是那些作者(s)和不被BMJ认可。BMJ放弃从放在内容上的任何依赖产生的所有责任和责任。如果内容包含任何翻译材料,BMJ不保证翻译的准确性和可靠性(包括但不限于当地法规、临床指南、术语、药品名称和药物剂量),并且不对翻译和改编或其他原因引起的任何错误和/或遗漏负责。