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摘要
客观的肠道菌群已被认为在自闭症谱系障碍(ASD)中发挥作用。我们假设ASD儿童的肠道菌群发育状况与正常发育(TD)儿童不同。在这里,我们的目的是描述与年龄相关的ASD儿童肠道微生物组的组成和功能变化,并识别新的粪便细菌标记来预测ASD。
设计我们对146名中国儿童(72名自闭症儿童和74名TD儿童)的粪便样本进行了深度宏基因组测序。我们比较了ASD儿童和TD儿童的肠道微生物组成和功能。筛选候选细菌标记并用宏基因组分析进行验证。采用随机森林模型评估肠道菌群发育与年龄之间的关系。
结果ASD和实际年龄对儿童粪便微生物群的影响最为显著和最大,而饮食没有相关性。与TD儿童相比,ASD儿童的粪便微生物组组成有显著改变,其特征是细菌丰富度增加(p=0.021)和微生物组组成改变(p<0.05)。在ASD和TD儿童中鉴定了5种细菌种类来区分肠道微生物,在发现队列和验证队列中,受试者工作曲线下面积(AUC)分别为82.6%和76.2%。与TD儿童相比,ASD儿童肠道菌群中多种神经递质生物合成相关通路被消耗(p<0.05)。在TD儿童中发现的生长相关肠道细菌(年龄歧视物种)的发展动态在ASD儿童的早期生命谱系中消失。
结论与TD儿童相比,中国ASD儿童肠道微生物群的组成、生态网络和功能发生了改变。我们发现了用于预测ASD的新的细菌标记物,并证明患有ASD的儿童肠道菌群持续发育不足,落后于他们相应年龄的同龄人。
- 肠道微生物
数据可用性声明
数据可在一个公共的、开放访问的存储库中获得。支持本研究结果的(原始序列)数据已存入(NCBI),登录代码为(PRJNA686821) [https://dataview.ncbi.nlm.nih.gov/object/PRJNA686821]
来自Altmetric.com的统计
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脚注
贡献者作者贡献:YW进行了研究,进行了DNA提取,数据分析,并起草了手稿。RC负责伦理应用、受试者招募、收集所有问卷数据和临床样本,并对手稿进行评论。TZ、ZX、FZ、HZ、YKY和FKLC对手稿作出了重要的智力贡献。DFC和T-FL为受试者招募和DNA提取提供支持和临床建议。SCN设计了研究,监督了研究并修改了手稿。
资金这项工作得到了中华人民共和国香港特别行政区InnoHK,政府的支持。这项工作亦获得香港特别行政区政府食物及卫生局卫生及医学研究基金(HMRF,拨款编号:14152251)的拨款。
相互竞争的利益没有宣布。
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